سوابق علمی - اجرائی

سوابق تحصیلی

  • ثبت نشده ليسانس

    زیست شناسی علوم گیاهی

    دانشگاه زابل

  • 1388فوق ليسانس

    ژنتیک

    ميسور

  • 1393دکتری تخصصی

    ژنتیک

    ميسور

مراتب علمی

  • استاديار1393

    گروه آموزشی زیست شناسی ( عمومی- جانوری،گیاهی)

علاقه مندیها

رویدادها

مرتب سازی:

نمایش:

Biallelic missense variants in ZBTB11 can cause intellectual disability in humans

Mohammad Haddadi
ثبت نشده , Human Molecular Genetics , Year : 2018 , Pages: 3177-3188, ISSN:0964-6906 Journal Paper

Abstract

Exploring genes and pathways underlying intellectual disability (ID) provides insight into brain development and function, clarifying the complex puzzle of how cognition develops. As part of ongoing systematic studies to identify candidate ID genes, linkage analysis and next-generation sequencing revealed Zinc Finger and BTB Domain Containing 11 (ZBTB11) as a novel candidate ID gene. ZBTB11 encodes a little-studied transcription regulator, and the two identified missense variants in this study are predicted to disrupt canonical Zn2+-binding residues of its C2H2 zinc finger domain, leading to possible altered DNA binding. Using HEK293T cells transfected with wild-type and mutant GFP-ZBTB11 constructs, we found the ZBTB11 mutants being excluded from the nucleolus, where the wild-type recombinant protein is predominantly localized. Pathway analysis applied to ChIP-seq data deposited in the ENCODE database supports the localization of ZBTB11 in nucleoli, highlighting associated pathways such as ribosomal RNA synthesis, ribosomal assembly, RNA modification and stress sensing, and provides a direct link between subcellular ZBTB11 location and its function. Furthermore, given the report of prominent brain and spinal cord degeneration in a zebrafish Zbtb11 mutant, we investigated ZBTB11-ortholog knockdown in Drosophila melanogaster brain by targeting RNAi using the UAS/Gal4 system. The observed approximate reduction to a third of the mushroom body size—possibly through neuronal reduction or degeneration—may affect neuronal circuits in the brain that are required for adaptive behavior, specifying the role of this gene in the nervous system. In conclusion, we report two ID families segregating ZBTB11 biallelic mutations disrupting Zn2+-binding motifs and provide functional evidence linking ZBTB11 dysfunction to this phenotype.

CNKSR1 gene defect can cause syndromic autosomal recessive intellectual disability

Mohammad Haddadi
USA , American Journal of Medical Genetics Part B: Neuropsychiatric Genetics , Year : 2018 , Pages: 691-699, ISSN:1552-4841 Journal Paper

Abstract

The advent of high-throughput sequencing technologies has led to an exponential increase in the identification of novel disease-causing genes in highly heterogeneous diseases. A novel frameshift mutation in CNKSR1 gene was detected by Next-Generation Sequencing (NGS) in an Iranian family with syndromic autosomal recessive intellectual disability (ARID). CNKSR1 encodes a connector enhancer of kinase suppressor of Ras 1, which acts as a scaffold component for receptor tyrosine kinase in mitogen-activated protein kinase (MAPK) cascades. CNKSR1 interacts with proteins which have already been shown to be associated with intellectual disability (ID) in the MAPK signaling pathway and promotes cell migration through RhoA-mediated c-Jun N-terminal kinase (JNK) activation. Lack of CNKSR1 transcripts and protein was observed in lymphoblastoid cells derived from affected patients using qRT-PCR and western blot analysis, respectively. Furthermore, RNAi-mediated knockdown of cnk, the CNKSR1 orthologue in Drosophila melanogaster brain, led to defects in eye and mushroom body (MB) structures. In conclusion, our findings support the possible role of CNKSR1 in brain development which can lead to cognitive impairment.

بررسی فراوانی ایزوفرم های ژن APOE و ارتباط آن با برخی فاکتورهای پاراکلینیکی در میان سالمندان مبتلا به فراموشی ناشی از افزایش سن در منطقه سیستان

محمد حدادی
ايران ، ژنتیک نوین ، سال : 2018 ، صفحات : 505-516، شاپا: 2008-4439 مقاله در مجله

چکیده

درجه ای از دمانس یا فراموشی در بسیاری از موجودات زنده ازجمله انسان همراه با افزایش سن و پیر شدن ایجاد میشود. این گونه اختلالات ممکن است ناشی از عوامل ژنتیکی و بالینی متفاوتی باشد. در این پژوهش تعیین پلی مورفیسم ژن APOE به عنوان مهم ترین فاکتور ژنتیکی شناخته شده برای بیماری آلزایمر، در گروهی از سالمندان مبتلا به فراموشی در منطقه سیستان صورت گرفت و ارتباط آن با وضعیت چربی خون، سطح یون های فلزی خون و برخی ویژگیهای دموگرافیک مرتبط با سبک زندگی بررسی شد. هم چنین در پژوهش حاضر، ارتباط بین عوامل محیطی مربوط به سبک زندگی و فاکتور ژنتیکی APOE مورد بررسی قرار گرفت. با اخذ مجوزهای قانونی و گرفتن رضایت نامه از افراد شرکت کننده در مطالعه، پس از غربال گری افراد جمعیت هدف با استفاده از پرسشنامه استاندارد ) MMSE ) Mini Mental Estate Examination و هم چنین در نظر گرفتن نژاد سیستانی از گروه سالمندان بیمار و سالمندان سالم به عنوان شاهد نمونه خون تام تهیه شد. نمونه ها شامل 55 فرد بیمار و 00 فرد سالم بود. افراد سالم انتخاب شده از نظر سن، جنس و نژاد با گروه بیمار هم خوان بودند. از سرم خون آن ها جهت سنجش میزان چربی و میزان عناصر فلزی مس، آهن و روی استفاده شد. استخراج DNA از گلبول های سفید خون محیطی انجام گرفت و بررسی ژنوتیپ افراد برای ژن APOE با روش ( AS PCR ) allele specific PCR صورت پذیرفت. پارامترهای دموگرافیک شامل سن، جنسیت، سطح سواد، مصرف دخانیات و مواد مخدر، وجود سابقه خانوادگی برای بیماری و سابقه بیماری های قلبی و صدمه سر نیز برای هر یک از افراد بیمار و همین طور گروه شاهد مورد ارزیابی قرار گرفت. نتایج بیانگر وجود فراوانی بیشتر آلل E4 ژن APOE در میان سالمندان بیمار نسبت به سالمندان سالم بود. شایان ذکر است که میزان HDL خون سالمندان بیمار کمتر از افراد سالم بود درحالی که سطح فلز روی در خون گروه شاهد کمتر از گروه بیماران بود. به طورکلی فراوانی زنان مبتلا به فراموشی بیش تر از مردان بود. هم چنین میانگین سطح سواد در بیماران بسیار کمتر از گروه شاهد بود درحالی که مصرف مواد مخدر در بین بیماران شایع تر از سالمندان سالم بود. در دیگر فاکتورهای بررسی شده تفاوت معناداری میان دو گروه مورد مطالعه مشاهده نشد.

Drosophila melanogaster as a Model to Study Human Neurodegenerative Diseases

Mohammad Haddadi
IRAN , International Journal of Basic Science in Medicine , Year : 2018 , Pages: 9-12, ISSN:2476-664X Journal Paper

Abstract

The central nervous system (CNS) is the most complex part of the human body, which controls a variety of cellular and molecular activities. Neurobehavioral functions of CNS play a vital role in making appropriate responses to the environmental stimuli. Some kind of such responses can be maintained in neural networks due to neuronal plasticity. When brain ages, or being damaged by means of genetic or environmental factors, memories will disappear gradually. Molecular mechanism of memory formation and disruption are studied during normal and diseased conditions, respectively. However, it is far to understand the complete scenario and we need a model organism to undertake specific studies and unravel the mystery of neuronal function. The fruit fly, Drosophila melanogaster possesses many characteristics, which enable neuroscientists to model wide range of complex behaviors and find their neural circuit. Even though, many human neurodegenerative disorders (NDDs) can be modeled in this insect and provide unique opportunities for effective therapeutic interventions. Here I summarized few points on the contribution of D. melanogaster in the neurobiology of learning and memory as well as human NDDs.

شنبه

یکشنبه

دوشنبه

سه شنبه

چهارشنبه

پنجشنبه

  •    شماره تماس:_
  •    شماره داخلی:_
  •    نمابر:_
  •   پست الکترونیک:m.haddadi@uoz.ac.ir