سوابق علمی - اجرائی

سوابق تحصیلی

  • ثبت نشده ليسانس

    مهندسی کشاورزی زراعت

    دانشگاه زنجان

  • ثبت نشده فوق ليسانس

    مهندسی کشاورزی- اصلاح نباتات

    دانشگاه اصفهان

  • ثبت نشده دکتری تخصصی

    اصلاح نباتات

    دانشگاه تهران

مراتب علمی

  • دانشيار1391

    گروه آموزشی زراعت

  • استاد1394

    گروه آموزشی زراعت

علاقه مندیها

رویدادها

مرتب سازی:

نمایش:

تجزیه QTL در برنج (مبانی ژنتیکی و مولکولی کیفیت دانه)

براتعلی فاخری,لیلا بذرکارخطیبانی,نفیسه مهدی نژاد,مریم حسینی چالشتری
ناشر: سلسله انتشارات دانشگاه | تاریخ چاپ: 2018 | شابک:978-964-6183-23-0کتاب

چکیده

اصلاح نبات مدیریت تنوع ژنتیکی است . تعداد زیادی از صفات اقتصادی در محصول استراتژیک برنج ذاتا کمی بوده و از طریق تنوع پیوست ه ای که ناشی از کنترل آنها توسط تعداد زیاد ژن می باشد، مشخص می گردند. پیشرفت در زیست شناسی مولکولی کمک نموده تا این صفات با جزئیات دق یق تر مورد بررسی قرار گیرند، اما هنوز هم مکان دقیق و تعداد ژن های کنترل کننده این صفات به طور کامل شناخته شده نیست . جنبه های مختلف مطالعه صفات کمی مشتمل بر تعداد ژن ها، مکان های کروموزومی، اثرات متقابل آللی و غیر آللی، اثر متقابل تلفیقی از نقشه یابی QTL ژنوتیپ و محیط و اثرات چند شکلی (پلیوتروپی) است. مکان یابی لینکاژی (پیوستگی) و روش های کلاسیک آماری و ژنتیک کمی است . روش های مختلف از قبیل تجزیه تک نشانگری، نقشه یابی فاصله ای، نقشه یابی فاصل ه ای مرکب و QTL نقشه یابی تلاقی برگشتی ،F نقشه یابی چند منظوره با استفاده از جمعی ت های نقشه یابی متعدد از قبیل 2 و دابل هاپلوئیدها و بسته های نرم افزاری مختلف استانداردسازی شد ه اند . NIL ،RIL ،(BC) ها برای صفات اقتصادی مختلف شناسایی شد ه اند که نسبت بزرگی از QTL تعداد زیادی از در تجزیه و تحلیل ژنتیکی صفات QTL تنوع ژنتیکی را تشکیل می دهند. پیشرفت در نقشه یابی و مطالعه بیان MAS پیچیده، ژنوم گیاهی، تقویت ژرم پلاسم، بهبود کارآیی انتخاب از طریق ژن در خلال فازهای رشد و نمو زندگی گیاه کمک خواهد کرد. در این مجموعه بر آنیم تا جنبه های مولکولی و ژنومی کیفیت دانه برنج را مورد بررسی قرار دهیم ضمن آنکه نتایج مطالعات پژوهشگران مختلف در زمینه جنبه های مختلف کیفیت دانه برنج ارائه خواهد شد.

EFFECTS OF DEFICIT IRRIGATION ON YIELD, YIELD COMPONENTS AND SOME MORPHOLOGICAL TRAITS OF WHEAT CULTIVARS UNDER FIELD CONDITIONS

,Barat Ali Fakheri,,
IRAN , International Journal of Agriculture: Reaserch and Review , Year : 2012 , Pages: 825-833, ISSN:2228-7973 Journal Paper

Abstract

Effect of micronutrient and irrigation deficit on yield and yield component of isabgol

Maryam Allahdou,,Barat Ali Fakheri,
ثبت نشده , ثبت نشده , Year : 2011 , Pages: 247-251, ISSN: Journal Paper

Abstract

Genetic variation among and within tritipyrum (Thinopyrum)bessarabicum × Triticum durum) lines using PCR-based molecular

Maryam Allahdou,Barat Ali Fakheri
ثبت نشده , ثبت نشده , Year : 2011 , Pages: 127-135, ISSN: Journal Paper

Abstract

Evaluation of Drought Tolerance Indices and Their Relationship with Grain Yield ofLentil Lines in Drought-stressed and Irrigated Environments

مریم اله دو,براتعلی فاخری,صالحه گنجعلی
ثبت نشده ، ثبت نشده ، سال : ثبت نشده ، صفحات : 4336-4346، شاپا: مقاله در مجله

چکیده

The identification of Eb chromosome in tritipyrum primery lines using random and semi random primers

Maryam Allahdou,Barat Ali Fakheri,
ثبت نشده , ثبت نشده , Year : 2009 , Pages: 1-6, ISSN: Journal Paper

Abstract

Investigation of genetic variation of lentil lines using random amplified polymorphic

Maryam Allahdou,Saleheh Ganjali,Barat Ali Fakheri
English , International Research Journal of Applied and Basic Sciences , Year : 2012 , Pages: 466-478, ISSN:2251-838X Journal Paper

Abstract

Investigation of Correlation and Board Sense Heritability in Tritipyrum Lines under Normal and Drought Stress Conditions

Maryam Allahdou,Barat Ali Fakheri,حسين شاهسوند حسني
ثبت نشده , ثبت نشده , Year : 2013 , Pages: 207-211, ISSN: Journal Paper

Abstract

QTLs mapping of physiological and biochemical traits of barley under drought

براتعلی فاخری,لیلا مهرآوران
ثبت نشده ، ثبت نشده ، سال : 2014 ، صفحات : 367-386، شاپا: مقاله در مجله

چکیده

Evaluation of genetic diversity in weed dodder (Cuscuta epithymum L) on Northern of Iran by RAPD molecular marker

Barat Ali Fakheri,
ثبت نشده , ثبت نشده , Year : 2014 , Pages: 213-220, ISSN: Journal Paper

Abstract

Evaluation of genetic diversity in weed dodder (Cuscuta epithymum L) on Northern of Iran by ISSR

Barat Ali Fakheri
ثبت نشده , ثبت نشده , Year : 2014 , Pages: 221-227, ISSN: Journal Paper

Abstract

Locating QTLs Controlling Agronomic Traits of “Steptoe×Morex” Derived Double Haploid Population of Barley under Drought Stress Conditions

براتعلی فاخری,لیلا مهرآوران
ايران ، علوم گیاهان زراعی ایران ، سال : 2013 ، صفحات : 47-67، شاپا: 2008-4811 مقاله در مجله

چکیده

The Effect of Drought Stress and Micronutrient of Zn and Mn on yield and Essential Oil of (Cuminum cyminum)

Barat Ali Fakheri
Egypt , Journal of Novel Applied Sciences , Year : 2013 , Pages: 350-356, ISSN:2322-5149 Journal Paper

Abstract

Agroecological Zoning of Wheat in the BorujenWatershed: Rianfed and Irrigated Wheat Cropping System Evaluation

براتعلی فاخری,سید احمد قنبری
ايران ، دانش کشاورزی و تولید پایدار ، سال : ثبت نشده ، صفحات : 1-12، شاپا: 2476-4310 مقاله در مجله

چکیده

Genomic regions mapping for some phenological traits associated with salt tolerance in barley

Barat Ali Fakheri,Maryam Allahdou
Japan , International Journal of Agriculture and Crop Sciences , Year : 2013 , Pages: 403-409, ISSN:2227-670X Journal Paper

Abstract

بررسي تأثير روش كاشت بر ويژگيهاي زراعي، عملكرد و اجزاي عملكرد ارقام شيرين و فوق شيرين ذرت (Zea mays L.) در شرايط شور

براتعلی فاخری,محمود رمرودی,محمد گلوی
ايران ، بوم شناسی کشاورزی ، سال : ثبت نشده ، صفحات : 188-197، شاپا: ۲۰۰۸-۷۷۱۳ مقاله در مجله

چکیده

اثرهاي تنش شوري و آهن بر رشد، رنگيزه هاي فتوسنتزي و باندهاي الكتروفورزي بابونه آلماني (Matricaria chamomilla L.) و بابونه رومي (Anthemis nobilis L.)

براتعلی فاخری
ثبت نشده ، ثبت نشده ، سال : ثبت نشده ، صفحات : 732-746، شاپا: مقاله در مجله

چکیده

اثر پساب تصفيه شده، همراه با محلول پاشي كود كامل بر خصوصيات كمي و كيفي علوفه ارزن دم روباهي

براتعلی فاخری,سید احمد قنبری,,
ايران ، آب و خاک ، سال : ثبت نشده ، صفحات : 660-671، شاپا: 2008-4757 مقاله در مجله

چکیده

اثر آبياري با پساب و محلولپاشي كود كامل بر عملكرد و اجزاي عملكرد علوفه ارزن دم روباهي (Setaria italica)

براتعلی فاخری,سید احمد قنبری,,
ايران ، پژوهشهای زراعی ایران ، سال : ثبت نشده ، صفحات : 200-207، شاپا: 2008-1472 مقاله در مجله

چکیده

تاثير كاربرد انواع كود فسفري شيميايي و زيستي بر عملكرد و اجزاي عملكرد ذرت و خلر در كشت مخلوط

براتعلی فاخری,محمود رمرودی,محمد گلوی
ايران ، علوم گیاهان زراعی ایران ، سال : ثبت نشده ، صفحات : 203-215، شاپا: 2008-4811 مقاله در مجله

چکیده

Effects of seed treatment with copper and nickel on germination and growth of Sanguisorba minor L.

براتعلی فاخری,دیاکو رسولی
ثبت نشده ، ثبت نشده ، سال : ثبت نشده ، صفحات : 202-211، شاپا: مقاله در مجله

چکیده

Small but Potent Killers

Barat Ali Fakheri,
pakistan , International Journal of Farming and Allied Sciences , Year : 2014 , Pages: 436-448, ISSN:2322-4134 Journal Paper

Abstract

Determination of yield gap of winter wheat in water and nitrogen limit conditions using CERES-wheat model in shirvan region, Iran

Barat Ali Fakheri,
ثبت نشده , ثبت نشده , Year : 2014 , Pages: 247-252, ISSN: Journal Paper

Abstract

Wheat yield simulation using crops growth simulation models of CERES-wheat and aquacrop and evaluating accuracy of these two models(Case study: Shirvan Region, Iran)

Barat Ali Fakheri,
ثبت نشده , ثبت نشده , Year : 2014 , Pages: 253-262, ISSN: Journal Paper

Abstract

Isolation and Characterization of Novel Microsatellite Markers in Walnut (Juglans regia L.)

Barat Ali Fakheri,فاطمه نجفي,محسن مردي
ثبت نشده , ثبت نشده , Year : 2014 , Pages: 409-415, ISSN: Journal Paper

Abstract

Biotechnological strategies for conservation of rare medicinal plants

Barat Ali Fakheri,سجاد شيخ پور,پرويز يدالهي
Japan , International Journal of Agriculture and Crop Sciences , Year : 2014 , Pages: 79-82, ISSN:2227-670X Journal Paper

Abstract

QTL analysis of some phenological and morphological traits in Babax andSeri M82 recombinant inbred line population of wheat during salinity stress

براتعلی فاخری,نفیسه مهدی نژاد,منصور اميدي,محمد رضا جلال كمالي,محمد رضا نقوي
ايران ، ژنتیک نوین ، سال : ثبت نشده ، صفحات : 207-218، شاپا: 2008-4439 مقاله در مجله

چکیده

Investigating the genetic variation in the collection germplasm Sistangrapevine native and non-native cultivars using REMAP marker

براتعلی فاخری,سمیه خون رز,مسيح فروتن
ايران ، ژنتیک نوین ، سال : ثبت نشده ، صفحات : 219-228، شاپا: 2008-4439 مقاله در مجله

چکیده

Review: Breeding for Resistance to Soybean Rust

Barat Ali Fakheri,,
Japan , International Journal of Agriculture and Crop Sciences , Year : 2014 , Pages: 330-330, ISSN:2227-670X Journal Paper

Abstract

Blast resistance in rice: a review of breeding and biotechnology

Barat Ali Fakheri
Japan , International Journal of Agriculture and Crop Sciences , Year : 2014 , Pages: 329-333, ISSN:2227-670X Journal Paper

Abstract

Optimal cropping pattern of sugar beet growers with emphasis on price and yield risk: the case of Fasa district

براتعلی فاخری,حمید محمدی ,محمود احمد پور برازجانی,سامان ضیائی,محمود رمرودی
ثبت نشده ، ثبت نشده ، سال : 2014 ، صفحات : 249-263، شاپا: مقاله در مجله

چکیده

ارزيابي كارآيي مصرف نور و نيتروژن در گندم (Triticum aestivum) تحت سطوح آبياري و كود نيتروژنه

براتعلی فاخری,سید احمد قنبری
ثبت نشده ، ثبت نشده ، سال : 2014 ، صفحات : 41-56، شاپا: مقاله در مجله

چکیده

Effects of organic and mineral sources of nutrient on quality and quantity yields of forage barley

Barat Ali Fakheri,,
Bangladesh , Agriculture Science Developments , Year : 2014 , Pages: 308-311, ISSN:2306-7527 Journal Paper

Abstract

The Response of qualitative and quantitative characteristics of ajowan (Carum copticum) to organic and chemical fertilizers under drought stress condition

Barat Ali Fakheri,,
ثبت نشده , ثبت نشده , Year : 2014 , Pages: 216-223, ISSN: Journal Paper

Abstract

Leaf blight resistance in rice: a review of breeding and biotechnology

Barat Ali Fakheri,
pakistan , International Journal of Farming and Allied Sciences , Year : 2014 , Pages: 895-902, ISSN:2322-4134 Journal Paper

Abstract

RNA Silencing and Plant Viral Diseases

Barat Ali Fakheri,
pakistan , International Journal of Farming and Allied Sciences , Year : 2014 , Pages: 946-951, ISSN:2322-4134 Journal Paper

Abstract

Review: Breeding for Resistance to Sheath blight in rice

Barat Ali Fakheri,
pakistan , International Journal of Farming and Allied Sciences , Year : 2014 , Pages: 970-979, ISSN:2322-4134 Journal Paper

Abstract

Marker-assisted selection for disease resistance: applications in breeding

Barat Ali Fakheri,
Japan , International Journal of Agriculture and Crop Sciences , Year : 2014 , Pages: 1392-1405, ISSN:2227-670X Journal Paper

Abstract

افزايش بيان ژن فنيل آلانين آمونيالياز PAL و تركيبات فنيل پروپانوئيدي گياه ريحان تحت تاثير كيتوزان

براتعلی فاخری
ايران ، ژنتیک نوین ، سال : ثبت نشده ، صفحات : 259-266، شاپا: 2008-4439 مقاله در مجله

چکیده

نقشه يابي نواحي ژنومي كنترل كنندة صفات فيزيولوژيك و مورفولوژيك مرتبط باجوانه زني گندم نان در وضعيت طبيعي و تنش اسمزي

براتعلی فاخری,ابوالفضل خالق بابکی
ايران ، علوم گیاهان زراعی ایران ، سال : ثبت نشده ، صفحات : 121-135، شاپا: 2008-4811 مقاله در مجله

چکیده

Localization of quantitative trait loci (QTLs) controlling drought tolerance in Barley

Barat Ali Fakheri,
ثبت نشده , ثبت نشده , Year : 2014 , Pages: 248-259, ISSN: Journal Paper

Abstract

افزايش بيان ژن چاويكول O-متيل ترانسفراز و فعاليت آنزيم¬هاي كاتالاز و آسكوربات پراكسيداز گياه Ocimum basilicum L. تحت تأثير كيتوزان

براتعلی فاخری
ايران ، زیست فناوری گیاهان زراعی ، سال : ثبت نشده ، صفحات : 1-9، شاپا: 2252-0783 مقاله در مجله

چکیده

طراحي و ساخت سازه اختصاصي كلروپلاستي گياه برنج حاوي ژنهاي بتائين آلدهيد دهيدروژناز (badh) و فلاودكسين (fld) جهت ايجاد مقاومت به تنش¬هاي غيرزنده

براتعلی فاخری
ايران ، زیست فناوری گیاهان زراعی ، سال : ثبت نشده ، صفحات : 47-59، شاپا: 2252-0783 مقاله در مجله

چکیده

PLANT BIOTECHNOLOGY AND ETHICAL ISSUES

yasuob shiri,Barat Ali Fakheri,mohamad forouzandeh
ثبت نشده , ثبت نشده , Year : 2014 , Pages: 2957-2961, ISSN: Journal Paper

Abstract

systemic aquired resistance

,,Barat Ali Fakheri,رضا خدري
India , JOURNAL ON NEW BIOLOGICAL REPORTS , Year : 2015 , Pages: 56-69, ISSN:2319-1104 Journal Paper

Abstract

تجزيهQTL برخي صفات فنولوژيك و مورفولوژيك جمعيت لاين هاي اينبرد نوتركيب گندم حاصل از از تلاقي Seri m82و Babax تحت تنش شوري

نفیسه مهدی نژاد,منصور اميدي,محمدرضا نقوي,براتعلی فاخری
ايران ، ژنتیک نوین ، سال : ثبت نشده ، صفحات : 207-218، شاپا: 2008-4439 مقاله در مجله

چکیده

investigation of the effects of growth regulators on callus induction in taxus baccata L.

,Barat Ali Fakheri,
India , BIOLOGICAL FORUM , Year : 2015 , Pages: 732-735, ISSN:0975-1130 Journal Paper

Abstract

effects of growth regulators on in vitro callogenesis of taxus baccata L.

,Barat Ali Fakheri,
India , BIOLOGICAL FORUM , Year : 2015 , Pages: 142-145, ISSN:0975-1130 Journal Paper

Abstract

the effect of withanta somnifera extract on drug resistant strains of escherichia coli

,محمد بوكايين,Barat Ali Fakheri
ثبت نشده , ثبت نشده , Year : 2015 , Pages: 1-4, ISSN: Journal Paper

Abstract

اثر تنش خشكي و تلفيق كودهاي زيستي بر رشد، عملكرد و تركيبات اسانس آويشن (Thymus Vulgaris L.).

محمود رمرودی,محمد گلوی,براتعلی فاخری
ثبت نشده ، ثبت نشده ، سال : 2015 ، صفحات : 237-253، شاپا: مقاله در مجله

چکیده

Differences in fennel seed responses to drought stress at the seed formation stage in sensitive and tolerant genotypes

Abbasali Emamjomeh,,Akiko Hashiguchi3,Barat Ali Fakheri,Saeed Aharizad,Majid Norouzi,Setsuko Komatsu
India , Journal of Plant Biochemistry and Biotechnology , Year : 2018 , Pages: 1-15, ISSN:0971-7811 Journal Paper

Abstract

To understand the effects of drought on fennel seed production and determine the underlying molecular processes, various fennel genotypes were exposed to drought stress. The yield and quality, including aromatic oil content, of fennel seeds were reduced by drought during seed development. To explore drought-induced biological processes in fennel, a label-free/ gel-free proteomic analysis was performed. In Gaziantep and Tatmaj cultivars, which are sensitive and tolerant fennel genotypes, respectively, 106 and 92 drought-responsive proteins were identified. Comparison of protein-functional profiles indicated that proteins classified in stress, cell, and protein synthesis/degradation categories consisted important responsive mechanisms against drought stress. Pathway analysis visualized that the tricarboxylic acid cycle is important for both cultivars. In Tatmaj, moderate activation of proteins related to oxidative pentose phosphate pathway was detected along with an increase in photosynthesis-related proteins. Furthermore, cluster analysis of drought-responsive proteins using protein abundance at milky, dough, and mature stages identified protein homeostasis as a mechanism of drought tolerance in fennel. These results suggest that coordinated energy consumption and supply might be a drought-tolerance mechanism in fennel plants.

Leaf proteomics of drought-sensitive and -tolerant genotypes of fennel

Abbasali Emamjomeh,,Barat Ali Fakheri,سعید اهری زاد,مجید نوروزی,ستسوکو کوماتسو
Netherlands , Biochimica et Biophysica Acta - Proteins and Proteomics , Year : 2017 , Pages: 1433-1444, ISSN:1570-9639 Journal Paper

Abstract

Leaf proteomics of drought-sensitive and -tolerant genotypes of fennel

ASSESMENT OF MOLECULAR DIVERSITY OF INTERNAL TRANSCRIBED SPACER REGION IN SOME LINES AND LANDRACE OF PERSIAN CLOVER (TRIFOLIUM RESUPINATUM L.)

Bahman Fazeli Nasab,,,Barat Ali Fakheri,
Slovakia , Potravinarstvo Slovak Journal of Food Sciences , Year : 2018 , Pages: 657-666, ISSN:1337-0960 Journal Paper

Abstract

Clover which is an herbaceous, annual, and self-pollinated plant belongs to fabaceae family (legumes) and has become naturalized in Iran, Asia Minor and the Mediterranean eastern suburban countries. The aim of the present study is ITS molecular evaluation of the nuclear ribosomal genes of lines and landraces of Persian Clover. The sequences were aligned using ClustalW method and by MegAlign software and the dendrogram of different phylogenetic and matrix relationships between the sequences were drawn. The results showed little genetic diversity between the lines and the landrace. The conserved sequence of the analyzed gene in the Persian clover is 561 base. Totally, 740 loci (69 and 671 loci, respectively, with and without removal and addition), 9 Singletons, and 5 haplotypes were identified. The highest rate of transfer was observed in pyrimidine (%16.3). The numerical value of the ratio (dN/dS) was 0.86, and since it was less than 1, the pure selection on the studied gene happened. The lines and landraces were not separated based on their geographic locations. In general, the results indicated that the highest rate of the regional diversity belonged to the clover plants in Lorestan region. Moreover, ITS markers did not seem suitable enough for evaluating the intra- species genetic variation, but it was quite well- suited for inter-species or intergeneric evaluation. The nanotechnology is a relatively new technology that has recently entered the field of agriculture. Nanotechnology covers the integration or manipulation of individual atoms, molecules or molecular masses to a diverse array of structures allowing the production of new characteristics and traits of interest. The aim of this study was to evaluate the effects of foliar application of TiO2 nanoparticles on quantitative traits (plant height, number of branches, dry weight of shoots and roots) and the essential oil content of thyme under different levels of field capacity. Our results showed that the application of TiO2 nanoparticles had significant effects on thyme growth, while the essential oil concentrations not affected. These results imply that the application of TiO2 nanoparticles in plants increase agronomic value under reduced irrigation conditions but has not different significant on essential oil.

Identification of genetic diversity between common Sistan wheat cultivars based on resistance genes to rust diseases by microsatellite marker

بهمن فاضلی نسب,عباسعلی امام جمعه,براتعلی فاخری,ملیحه شهرکی
ايران ، زیست فناوری گیاهان زراعی ، سال : 2018 ، صفحات : 57-78، شاپا: 2252-0783 مقاله در مجله

چکیده

To evaluate genetic diversity between Sistan common wheat cultivars, it was used 10 SSRs primers associated to stem, leaf and yellow rusts resistance genes. The lowest (3) and highest (7) allele number were generated by 12C, SCS719 and Xgdm116 primers and Xgwm443 primer, respectively (4.55 allele per each primer). The highest genetic diversity (0.39) and MI (2.29) was related to Xgdm116 and Xgwm533 primers, respectively; also, the lowest genetic diversity (0.1) and MI (0.33) was related to Xcfd36 primer. Xgdm36 primer showed the highest Ne, Shannon diversity and Nei diversity (1.45, 0.63 and 0.44, respectively); on the other hand, Xcfd36 primer the lowest Ne, Shannon diversity and Nei diversity (1.18, 0.19 and 0.11, respectively). The highest polymorphic bands between wheat cultivars were related to Arg. Arg and Aflak showed the least diversity for resistance to yellow rust and leaf rust, respectively. Also, Arg had the highest diversity for three types of rusts. The Xgdm116, Xwmc810 and SCS719 primers had more effect on identification of wheat cultivars. Finally, Arg cultivar can be recommended as a donor parent in wheat breeding programs for rust resistance. To gain the highest heterosis, it can be suggested hybridization between Arg and Hirmand cultivars.

ارزیابی تاثیر سطوح متفاوت نانوذرات نقره بر خصوصیات جوانه زنی ارقام مختلف گندم

عباسعلی امام جمعه,سهیلا حاتمی,محسن فرشادفر,هوشمند صفری,براتعلی فاخری
ايران ، زیست فناوری ، سال : 2018 ، صفحات : 293-299، شاپا: 2322-2115 مقاله در مجله

چکیده

اهداف: گندم یکی از مهم ترین محصولات غذایی در ایران است و با توجه به نقش نانوتکنولوژی در تولید محصولات زراعی، بررسی تاثیر نانوذرات بر فرآیندهای رشدی آن بسیار حایز اهمیت است. هدف پژوهش حاضر، بررسی تاثیر نانوساختارهای نیترات نقره با ابعاد مختلف در شرایط \\\" در شیشه\\\" بر خصوصیات جوانه زنی ارقام مختلف گندم بود. مواد و روش ها: در پژوهش تجربی حاضر، جوانه زنی ۱۰ رقم گندم در چهار غلظت ۱۰۰۰ و صفر (شاهد) با چهار تکرار و در قالب طرح ،۵۰۰۰ ،۱۰۰۰۰ppm نانوذرات نقره فاکتوریل بر پایه کاملاً تصادفی صورت گرفت. صفات طول ریش هچه و ساقه چه، نسبت ریش هچه به ساقه چه، سرعت جوانه زنی، درصد جوانه زنی، متوسط زمان و شاخص جوانه زنی، متوسط جوانه زنی روزانه، سرعت ظهور گیاهچه و شاخص بنیه انداز هگیری شدند. به منظور تحلیل داده ها از آزمون های آماری تحلیل استفاده Excel و 2013 SPSS واریانس و همبستگی پیرسون و نرم افزارهای 18 شد. بین ارقام .(p<۰/ یافته ها: تمام صفات، همبستگی معن یدار با یکدیگر داشتند ( ۰۱ و همچنین بین غلظت های متفاوت نانوذره نقره اختلاف معنی دار برای تمام در تجزیه به مولفه های اصلی و تجزیه کلاستر، .(p<۰/ صفات وجود داشت ( ۰۱ ۱۰۰۰ مشاهده ppm بیشترین میزان جوانه زنی در سطح شاهد و در ادامه در سطح شد و با افزایش غلظت نانوذره خصوصیات جوان هزنی نیز کاهش معن یداری ارقام اروم و پارسی با داشتن بیشترین میزان برای .(p<۰/ نشان داد ( ۰۱ خصوصیات جوانه زنی ارقام برتر بودند. نتیجه گیری: سطوح بالای غلظت نانوذرات نقره

اثر کاربرد کودهای آلی، زیستی و شیمیایی بر خصوصیات کمی زرشک بیدانه در سال آور

براتعلی فاخری,امین زارع,محمد رضا اصغری پور چمن
ايران ، پژوهش های تولید گیاهی ، سال : 2018 ، صفحات : 87-100، شاپا: 2322-2050 مقاله در مجله

چکیده

سابقه و هدف: برای داشتن یک نظام کشاورزی پایدار، استفاده از نهاده‌هایی که جنبه‌های بوم شناختی را بهبود بخشند و مخاطرات محیطی را کاهش دهند، ضروری به‌نظر می‌رسد. گیاه زرشک از قرن‌ها پیش در اکثر کشورها برای مصرف خوراکی به‌عنوان چاشنی غذاها و هم‌چنین به‌عنوان دارو برای کاهش فشار خون، تقویت قلب، تسکین حرارت معده و بند آمدن سیلان خون بواسیر، استفاده می‌شده است. همچنین، میوه زرشک طبیعتی سرد و خشک دارد، صفرابر و مدر است، از خون‌ریزی مزمن جلوگیری می‌کند و برای تقویت و رفع انسداد کبد بسیار نافع است (31). این گیاه در ایران پراکنش زیادی دارد و در شیب‌های تند به‌ویژه خاک‌های آهک‌دار در آذربایجان، گیلان، مازندران، گلستان، تهران، خراسان (قاین، سربیشه، سلم‌آباد، درگز) و فارس دیده می‌شود (44). شهرستان‌های قاین و بیرجند در استان خراسان جنوبی بیش از 97 درصد سطح زیرکشت زرشک کشور و تولید 95 درصد از زرشک دنیا را دارا می باشد (20). مواد و روش‌ها: این آزمایش به‌صورت کرت‌های خردشده در قالب طرح بلوک‌های کامل تصادفی با سه تکرار، در باغی تجاری در شهرستان قاینات، در سال زراعی 1394-1395 اجرا شد. کرت‌های اصلی آزمایش شامل چهار ترکیب کودی شامل عدم مصرف کود، مصرف کود شیمیایی، کود آلی (گاوی) و کاربرد 50 درصد کود شیمیایی + 50 درصد کود آلی بودند. کرت‌های فرعی نیز شامل عدم مصرف کود زیستی و اسید‌هیومیک، کود زیستی فسفات‌بارور2، اسید هیومیک و کاربرد توام کود زیستی + اسید هیومیک بود. یافته‌ها: تیمارهای مورد مطالعه اثر معنی‌داری بر تمام صفات اندازه گیری شده داشت. به‌طوری که کاربرد توام کود‌های شیمیایی و دامی همراه با کود آبیاری اسید هیومیک و فسفات ‌بارور2 بیشترین میانگین‌ها را از نظر طول حبه و برگ، وزن تر و خشک 100 حبه، عملکرد تر و خشک حبه و عملکرد تر شاخه‌های بارور داشت. استفاده از کود آلی با کود آبیاری اسید هیومیک و فسفات‌بارور2 موجب تولید بیشترین تعداد حبه در خوشه، خوشه در شاخه و تعداد شاخه‌های بارور گردید. بیشترین تعداد شاخه‌های فصل جاری و نسبت شاخه‌های بدون بار به شاخه‌های بارور نیز به کاربرد کود شیمیایی به همراه کود آبیاری اسید هیومیک و فسفات‌بارور‌2 اختصاص داشت. عملکرد خشک حبه (عملکرد اقتصادی) در شرایط استفاده توام کودهای شمیایی و دامی با اسید هیومیک و فسفات‌بارور2، حدود 48/10 درصد نسبت به تیمار کود آلی + اسید‌هیومیک + فسفات بارور‌2، حدود 11/20 درصد نسبت به تیمار کود شیمیایی + اسیدهیومیک + فسفاتبارور2 و 30/27 درصد نسبت به شاهد (عدم مصرف کود) افزایش یافت. نتیجه‌گیری: با توجه به نتایج به دست آمده از این آزمایش، تیمار کاربرد تلفیقی کود آلی و شیمیایی به همراه اسیدهیومیک و فسفات بارور 2 حداکثر طول حبه و برگ، وزن تر و خشک 100 حبه، عملکرد تر و خشک حبه، عملکرد تر محصول با شاخه را نشان داد.

اثر نانو ذرات نقره بر صفات فیزیولوژیک برخی اکوتیپ‌های زعفران (.Crocus sativus L) خراسان جنوبی تحت تنش کم‌آبی ملایم

براتعلی فاخری,بتول صابرتنها,نفیسه مهدی نژاد,زهره علیزاده
ايران ، تنش های محیطی در علوم زراعی ، سال : 2018 ، صفحات : 627-643، شاپا: 2228-7604 مقاله در مجله

چکیده

ین پژوهش به‌منظور بررسی تأثیر تنش کم‌آبی و نانو ذرات نقره بر صفات فیزیولوژی در گیاه زعفران انجام شد. آزمایش در دو سطح کم‌آبی و نرمال بر روی 10 اکوتیپ زعفران در سه سطح شاهد (آب مقطر)، 55و 110 پی­ پی­ ام نانو ذرات نقره پیاده شد. این بررسی به‌صورت اسپلیت پلات فاکتوریل در قالب طرح بلوک­ های کامل تصادفی در سه تکرار در مزرعه تحقیقاتی دانشگاه بیرجند و پژوهشکده زیست‌فناوری دانشگاه زابل انجام شد. بعد از تهیه نمونه­ های برگی از تمامی تیمار­ها، عصاره­ آنزیمی برای اندازه­ گیری میزان آنزیم­ها، کلروفیل a و b، کارتنوئید و پروتئین تهیه شد. داده­ ها با نسخه 9.2 نرم‌افزار­SAS مورد تجزیه‌وتحلیل قرار گرفتند. اثرات اصلی تیمار­های اکوتیپ، نانوذره نقره، تنش خشکی و اثرات متقابل آن‌ها برای آنزیم­های کاتالاز، پلی فنل اکسیداز، فنیل آلانین آمونیالیاز، کلروفیل b وکارتنوئید در سطح احتمال یک درصد معنی­ دار شدند. بیشترین مقدار کلروفیل b، کارتنوئید و فنیل آلانین آمونیالیاز تحت تنش خشکی در غلظت 55 پی­پی­ام نانوذره نقره نسبت به شاهد و سطح 110 پی ­پی­ ام مشاهده شد که می­توان استدلال کرد نانو ذرات به دلیل خاصیت آب‌دوستی و آنتی باکتریال توانسته عملکرد بالایی داشته باشد. بیشترین مقدار کلروفیل a، کاتالاز، پلی فنل اکسیداز و گایاکول پراکسیداز تحت تنش خشکی در تیمار آب مقطر (شاهد) مشاهده شد که می‌توان استدلال کرد نانو نقره در این صفات سمیت ایجاد کرده و باعث کاهش عملکرد در سطوح نانو نقره نسبت به شاهد شده است. درنتیجه اکوتیپ­های قاین و آرین شهر در شرایط تنش خشکی تحت نانو ذرات نقره با غلظت 55 پی­ پی­ ام بیشترین عملکرد داشتند.

تنش کم آبی و اثر نانو ذرات نقره بر صفات مورفولوژیک برخی اکوتیپ های زعفران (Crocus sativus L.) خراسان جنوبی

براتعلی فاخری,بتول صابرتنها,نفیسه مهدی نژاد,زهره علیزاده
ايران ، زراعت و فناوری زعفران ، سال : 2018 ، صفحات : 473-485، شاپا: 2383-1529 مقاله در مجله

چکیده

این پگوهش به منظور بررسی تأثیر تنش کم آبی و نانو ذرات نقره بر صفات مورفولوژیکی برخی اکوتیپهای زعفران انجام شد. آزموایش به صورت اسپیلت پلات فاکتوریل در قالب طرح بلوکهای کامل تصادفی در سه تکرار در مزرعوه تحقیقواتی دانشوگاه بیرجنود بوا دو سوطح آبیاری کامل و کم آبی بر روی 71 اکوتیپ زعفران و در سه سطح نانو ذرات نقره شامل تیمار شاهد )آب مقطر(، 99 و 771 پیپیام اجرا شد. صفاتی مانند تاری جوانه زنی )سبز شدن(، تعداد بنه جوانه زده، تعداد پنجه، تعداد برگ، طول برگ، طول غلاف و عرض برگ اندازه گیری شد. بهترین تاری خروج جوانه )سبز شدن( و بیشترین تعداد پنجه در تیمار آبیاری کامل، تحت تیمار آب مقطر )شواهد ( مشواهده شود . بیشوترین تعداد بنه جوانه زده در شرایط آبیاری در غلظت 99 پیپیام نانو ذرات نقره در اکوتیپ قاین مشاهده شد. بیشوترین طوول بورگ تحوت تونش خشکی در تیمار با آب مقطر )شاهد( مشاهده شد. بیشترین تعداد برگ و عرض برگ تحت تنش خشکی در غلظت 99 پیپیام نانوذره نقوره مشاهده شد. بر اساس نتایج چنین استدلال شد برخی از صفات در شرایط تنش خشکی تحت نانو ذرات نقره با غلظت 99 پیپیام و برخی از صفات در آبیاری کامل و عدم استفاده از نانو ذرات نقره بهترین عملکرد داشتند که احتمالا میتووان گفوت در تونش خشوکی میوزان اتویلن افزایش مییابد، برخی از نتایج در این تحقی میتواند به اثر نقره در جلوگیری از فعالیت اتیلن مرتبط باشد.

بررسی و مقایسه مورفولوژیکی و فیتوشیمیایی اسانس گیاه دارویی Echium italicum L. در رویشگاه‌های مختلف استان کردستان

براتعلی فاخری,فرنوش صبوری,عبدالرحمن رحیمیان بوگر
ايران ، اکو فیتو شیمی گیاهان دارویی ، سال : 2018 ، صفحات : 12-27، شاپا: 2322-3235 مقاله در مجله

چکیده

به­­منظور بررسی مقایسه ای ویژگی­های مورفولوژیکی و فیتو­شیمیایی اسانس گیاه دارویی گل­گاوزبان ایتالیایی (Echium italicum L.) آزمایشی به­­صورت طرح آشیانه­ای در سه رویشگاه سنندج، مریوان و دیواندره استان کردستان در سه ارتفاع مختلف از هر رویشگاه در سال 1393 انجام گرفت. برای اندازه­گیری شاخص­های مورد­نظر سرشاخه­های گلدار گیاه از رویشگاه­های طبیعی در اوایل تابستان برداشت شد. متغیرهای مورفولوژیکی شامل: ارتفاع بوته، وزن تر و خشک، طول و عرض برگ­های ساده و رزت، فاصله میانگره، قطر ساقه، تعداد گل، قطر ساقه، تعداد برگ و تعداد شاخه فرعی و متغیرهای فیزیولوژیک شامل: شاخص کلروفیل، اندازه‌گیری عناصر NPK خاک، گل و برگ، عملکرد اسانس که با استفاده از روش تقطیر با آب طرح کلونجراستخراج، شناسایی ترکیبات تشکیل­دهنده اسانس بااستفاده از دستگاه کروماتوگرافی گازی (GC/MS) و عملکرد موسیلاژ نیز با روش جداسازی توسط آب مقطر و رسوب­دهی در اتانول 96 درصد مورد سنجش قرار گرفتند.داده­ها به­­وسیله نرم­افزار آماری SAS و با روش آنالیز LGM مقایسه میانگین­ها انجام گرفت. نتایج مقایسه میانگین­ها نشان داد که با افزایش ارتفاع از سطح دریا و به­دنبال آن کاهش درجه، ارتفاع بوته، فاصله­ی میانگره، قطر ساقه، تعداد برگ و درصد موسیلاژ و همچنین اسانس گیاه کاهش، در­ حالی که شاخص کلروفیل افزایش یافته است. ارتفاع از سطح دریا تاثیر معنی­داری بر عملکرد اسانس دارد و بالاترین میزان اسانس در پایین­ترین ارتفاع برای هر رویشگاه بدست آمد ، همچنین اکوتیپ سنندج در ارتفاع 1557 متری از نظر عملکرد اسانس (097/0 درصد)، از سایر اکوتیپ­ها برتر بود. از ترکیبات غالب اسانس می­توان به بورنئول، کامفور،کانوئیک­متیل­استرو کاندینون و... اشاره کرد

ارزیابی صفات مورفولوژیک و فیزیولوژیک آویشن باغی (Thymus vulgaris L.) تحت تنش کم آبی و محلول پاشی اسید آسکوربیک

براتعلی فاخری,علی اصغر قادری,نفیسه مهدی نژاد
ايران ، به زراعی کشاورزی ، سال : 2018 ، صفحات : 817-834، شاپا: 2008-8337 مقاله در مجله

چکیده

به‌‌منظور بررسی تأثیر محلول‌پاشی اسیدآسکوربیک بر شاخص‌های رشد و صفات فیزیولوژیک آویشن باغی تحت تنش خشکی آزمایشی به‌صورت کرت‌های خردشده در قالب طرح بلوک‌های کامل تصادفی با سه تکرار در مزرعة تحقیقاتی دانشکدة کشاورزی دانشگاه زابل اجرا شد. عامل اصلی تنش خشکی در سه سطح آبیاری در 75، 55 و 35 درصد ظرفیت زراعی و عامل فرعی محلول‌پاشی در سه سطح آب مقطر (شاهد)، 10 و 20 میلی‌مولار اسید آسکوربیک بود. آثار اصلی تنش خشکی و محلول‌پاشی اسید‌آسکوربیک برای تمامی صفات مورد بررسی در سطح احتمال یک درصد معنادار بود. اثر متقابل تنش خشکی و محلول‌پاشی اسیدآسکوربیک فقط برای میزان پرولین معنادار شد. اعمال تنش شدید، صفات کلروفیل کل، کارتنوئید، وزن خشک ریشه و وزن خشک شاخساره را به‌ترتیب 0/29، 9/39، 5/50 و 0/43 درصد نسبت به شاهد کاهش، درحالی که میزان پرولین برگ و طول ریشه را به میزان 2/44 و 6/26 درصد افزایش داد. محلول‌پاشی اسیدآسکوربیک (20 میلی‌مولار) موجب افزایش معنادار میزان رنگیزه‌های فتوسنتزی، طول شاخساره، وزن ریشه و وزن شاخساره شد. ضرایب همبستگی ساده صفات، ارتباط مثبت و معنا‌دار وزن خشک شاخساره را با سایر صفات مورد بررسی در شرایط اعمال تنش و کاربرد اسیدآسکوربیک با غلظت 20 میلی‌مولار نشان داد. تجزیه به عامل‌ها چهار عامل برای شرایط نرمال و چهار عامل برای شرایط تنش شدید استخراج کرد که در مجموع به‌ترتیب 98 و 95 درصد از تغییرات داده‌ها را توجیه کردند. در کل استنباط شد که رنگیزه‌های فتوسنتزی و صفات مرتبط با ریشه از معیارهای مهم مرتبط با عملکرد (وزن خشک شاخساره) بودند که می‌توانند در اصلاح آویشن با عملکرد بیشتر در شرایط تنش سودمند باشند.

آثار کودهای نانو و نانوزیستی بر ویژگی های فیزیولوژیکی، بیوشیمیایی و عملکرد چای ترش(Hibisicus sabdariffa L.)تحت تنش خشکی

براتعلی فاخری,سیده عصمت هاشمی فدکی,نفیسه مهدی نژاد,رقیه محمدپوروشوائی
ايران ، به زراعی کشاورزی ، سال : 2018 ، صفحات : 45-66، شاپا: 2008-8337 مقاله در مجله

چکیده

جایگزینی نهاده‏های شیمیایی با نهاده‏های بوم‌سازگار، به‌عنوان گامی به‌منظور گذار از کشاورزی رایج به پایدار، ضروری به‌نظر می‌رسد. در این راستا، آزمایشی در سال 1394 در مزرعة تحقیقاتی دانشگاه زابل، به‌صورت طرح کرت‌های یک‌بار خردشده در قالب بلوک‌های کامل تصادفی با سه تکرار اجرا شد. تنش خشکی در چهار سطح 30، 50، 70 و 90 درصد رطوبت دردسترس گیاه، عامل اصلی و کودهای نانو و نانوزیستی در چهار سطح، عامل فرعی در نظر گرفته شد. اثر اصلی تیمارهای کود، تنش خشکی و برهمکنش آنها بر تمامی صفات مورد بررسی معنادار شد. بیشترین مقدار رنگیزه‌های فتوسنتزی، وزن تر و خشک کاسبرگ در تیمار تنش خشکی 70 درصد رطوبت دردسترس و محلول‌پاشی کود نانوکلات آهن به‌دست آمد. بیشترین مقدار اسمولیت‌های آنتوسیانین، پرولین و کربوهیدرات به تیمار تنش خشکی 30 درصد رطوبت دردسترس و بیشترین محتوای نسبی آب برگ به تیمار آبیاری 90 درصد رطوبت قابل‌دسترس و محلول‌پاشی کود نانوکلات آهن تعلق داشت. نتایج تجزیه به مؤلفه‌های اصلی نشان داد که بهترین تیمار مورد بررسی، تنش خشکی 70 درصد رطوبت دردسترس توأم با محلول‌پاشی کود نانوکلات آهن بود. محلول‌پاشی با کود نانوکلات آهن موجب تعدیل آثار تنش خشکی و افزایش کمّیت و کیفیّت کاسبرگ‌های چای ترش شد

تأثیر کودهای مختلفو تلفیق آنها بر برخی خصوصیات کمی و کیفی (Silybum marianum L.) گیاه دارویی ماریتیغال

فاطمه بیدرنامنی,هوشنگ یادگاری,عیسی خمری,محمد سالاری ,براتعلی فاخری,مریم رحیمی
ايران ، تحقیقات گیاهان دارویی و معطر ایران ، سال : 2017 ، صفحات : 1010-1025، شاپا: 0905-1735 مقاله در مجله

چکیده

ماریتیغال میدهد. مهمترین ترکیبی که از دانههای این گیاه استخراج میشود سیلیمارین نام دارد که در درمان امراض کبدی، هپاتیت، سیروز کبدی و پیشگیری از سرطان کبد کاربرد دارد. در سیستمهای کشاورزی متداول هدف استفاده از کودهای مختلف و تلفیق آنها، بدست آوردن بیشترین عملکرد دانه و کیفیت مواد مؤثره است. بهمنظور بررسی تأثیر کودهای مختلف و تلفیق آنها بر برخی خصوصیات کمی 1392 طرح کرتهای خرد شده در پایه طرح بلوکهای کامل تصادفی با سه تکرار و در - و کیفی ماریتیغال، در سال زراعی 1393 و توده (A مزرعه تحقیقاتی پژوهشکده کشاورزی دانشگاه زابل اجرا شد. در این تحقیق عامل اصلی شامل ژنوتیپ مجارستان ( 1 و عامل فرعی شامل کاربرد کودهای مختلف مانند تیمار شاهد، کود دامی، کود شیمیایی (اوره+ فسفات آمونیوم+ (A مشهدی ( 2 ترکیب نیتروکسین، بیوسولفور و بیوسوپر فسفات، ترکیب کود ،(Glomus mosseae) سولفات پتاسیم)، قارچ میکوریزا گلوموسموسهآ شیمیایی و کود دامی، ترکیب قارچ میکوریزا و کود دامی و کود نانو کلات آهن بود. نتایج نشان داد، بین ژنوتیپ مجارستان و توده بهترین تیمار در بین (Glomus mosseae) مشهد اختلاف معنیداری وجود نداشت. در مجموع قارچ میکوریزا گلوموسموسهآ تیمارهای کودی در گیاه ماریتیغال بود و موجب افزایش رشد و فعالیت بهتر رنگریزههای فتوسنتزی گردید، همچنین باعث بهبود عملکرد دانه و افزایش سیلیمارین گیاه ماریتیغال شد.

Identification, Prediction and Data Analysis of Non coding RNAs: A Review

Abbasali Emamjomeh,جواد ظهیری,,مهرداد بهمنش,Barat Ali Fakheri,قاسم مهدور
United Arab Emirates , Medicinal Chemistry , Year : 2018 , Pages: 0-0, ISSN:1875-6638 Journal Paper

Abstract

Background: Non coding RNAs (ncRNAs) which play an important role in various cellular processes are important in medicine as well as drug design strategies. Different studies have shown that ncRNAs are dis-regulated in cancer cells and play an important role in human tumorigenesis. Therefore, it is important to identify and predict such molecules by experimental and computational methods, respectively. However, to avoid expensive experimental methods, computational algorithms have been developed for accurately and fast prediction of ncRNAs. Objective: The aim of this review was to introduce the experimental and computational methods to identify and predict ncRNAs structure. Also, we were explained the ncRNAs roles in cellular processes and drugs design, briefly. Methods: In this survey, we will introduce ncRNAs and their roles in biological and medicinal processes. Then, some important laboratory techniques will be studied to identify ncRNAs. Finally, the state-of-the-art models and algorithms will be introduced along with important tools and databases. Results: The results showed that the integration of experimental and computational approaches improves to identify ncRNAs. Moreover, the high accurate databases, algorithms and tools were compared to predict the ncRNAs. Conclusion: ncRNAs prediction is an exciting research field, but there are different difficulties. It requires to accurate and reliable algorithms and tools. Also, it is should be mentioned that computational costs of such algorithm including running time and usage memory is very importance. Finally, some suggestions were presented to improve computational methods of ncRNAs gene and structural prediction.

شناسایی تنوع ارقام گندم سیستان از لحاظ ژنهای مقاومت به عوامل بیماریهای زنگ گندم با نشانگر ریز ماهواره

عباسعلی امام جمعه,ملیحه شهرکی,براتعلی فاخری,بهمن فاضلی نسب
ايران ، زیست فناوری گیاهان زراعی ، سال : 2018 ، صفحات : 57-78، شاپا: 2252-0783 مقاله در مجله

چکیده

در این پژوهش از 10 جفت آغازگر ریزماهواره¬ای برای بیماری زنگ¬های زرد، قهوه¬ای و سیاه گندم استفاده شد. آغازگرهای 12C، SCS719 و Xgdm116 با 3 آلل کمترین و آغازگر Xgwm443 با 7 آلل، بیشترین آلل را داشتند. میانگین تعداد آلل در کل جایگاه‌ها برابر 55/4 بود. بیشترین شاخص چندشکلی (39/0) و شاخص نشانگری (29/2) به ترتیب مربوط به آغازگر Xgdm116 و Xgwm533 و کمترین میزان شاخص چندشکلی (1/0) و شاخص نشانگری (33/0) مربوط به آغازگر Xcfd36 بود. بیشترین تعداد آلل مؤثر، شاخص تنوع شانن و شاخص تنوع نی به ترتیب 45/1، 63/0، 44/0 متعلق به آغازگر Xgdm116 و کمترین میزان آلل مؤثر، شاخص تنوع شانن و شاخص تنوع نی به ترتیب 18/1، 19/0، 11/0 متعلق به آغازگر Xcfd36 بود. بیشترین درصد مکان چندشکلی، تعداد آلل مؤثر، شاخص تنوع نی و شاخص تنوع شانن به ترتیب 53/39، 27/1، 16/0 و 23/0 متعلق به رقم ارگ بود. تغییرات درون و بین ارقام با استفاده از تجزیه واریانس مولکولی نشان داد که 55 درصد کل تغییرات ژنتیکی درون ارقام وجود دارد. بیشترین و متنوع¬ترین ژن¬های مقاومت به زنگ از لحاظ مقاومت به بیماری زنگ زرد و قهوه¬ای به ترتیب، در رقم ارگ و رقم افلاک و نسبت به هر سه زنگ در رقم ارگ بود. آغازگرهای Xgdm116، Xwmc810 و SCS719 مؤثرترین آغازگرها در شناسایی و جداسازی ارقام مقاوم و حساس بودند. پیشنهاد می‌گردد به‌عنوان یکی از پایه‌های پدری یا مادری در برنامه¬های اصلاحی مورد استفاده قرار گیرد.

اثر کاربرد کودهای آلی، زیستی و شیمیایی بر خصوصیات کمی زرشک بیدانه در سال آور

محمد رضا اصغری پور چمن,براتعلی فاخری,امین زارع
ايران ، پژوهش های تولید گیاهی ، سال : 2018 ، صفحات : 87-100، شاپا: 2322-2050 مقاله در مجله

چکیده

برای داشتن یک نظام کشاورزی پایدار، استفاده از نهادههایی که جنبههای بوم شناختی را بهبود بخشند و مخاطرات محیطی را کاهش دهند، ضروری بهنظر میرسد. گیاه زرشک از قرنها پیش در اکثر کشورها برای مصرف خوراکی بهعنوان چاشنی غذاها و همچنین بهعنوان دارو برای کاهش فشار خون، تقویت قلب، تسکین حرارت معده و بند آمدن سیلان خون بواسیر، استفاده میشده است. همچنین، میوه زرشک طبیعتی سرد و خشک دارد، صفرابر و مدر است، از خونریزی مزمن جلوگیری می کند و برای تقویت و رفع انسداد کبد بسیار نافع است. این گیاه در ایران پراکنش زیادی دارد و در شیب های تند بهویژه خاک های آهکدار در آذربایجان، گیلان، مازندران، گلستان، تهران، خراسان (قاین، سربیشه، سلمآباد، درگز) و فارس دیده می شود. شهرستان های قاین و بیرجند در استان خراسان جنوبی بیش از 97 درصد سطح زیرکشت زرشک کشور و تولید 95 درصد از زرشک دنیا را دارا می باشد. بنابراین، با توجه به اهمیت غذایی و دارویی گیاه زرشک، این آزمایش با هدف بررسی اثر روش کاربرد و ترکیب کود های شیمیایی، آلی و زیستی بر خصوصیات کمی درختچه زرشک انجام شد. مواد و روشها: این آزمایش بهصورت کرتهای خردشده در قالب طرح بلوکهای کامل تصادفی با سه تکرار، در 1395 اجرا شد. کرت های اصلی آزمایش شامل چهار ترکیب - باغی تجاری در شهرستان قاینات، در سال زراعی 1394 کودی شامل عدم مصرف کود، مصرف کود شیمیایی، کود آلی (گاوی) و کاربرد 50 درصد کود شیمیایی + 50 درصد ، کود آلی بودند. کرت های فرعی نیز شامل عدم مصرف کود زیستی و اسیدهیومیک، کود زیستی فسفاتبارور 2 اسید هیومیک و کاربرد توام کود زیستی + اسیدهیومیک بود. ویژگیهای مورد مطالعه در پایان فصل رشد (اوایل آبان ماه) هنگامی که میوه ها در مرحله رسیدگی فیزیولوژیکی قرار داشتند، اندازهگیری شدند. برای نمونهگیری از هر درختچه 7 شاخه به طور تصادفی انتخاب شد و میانگین تعداد حبه در خوشه، تعداد خوشه در شاخه و وزن تر 100 حبه به عنوان مقادیر این صفات برای آن درختچه گزارش گردید. میانگین طول 7 برگ و حبه که تصادفی انتخاب شدند نیز به عنوان طول برگ و حبه زرشک گزارش شد. عملکرد تر حبه و عملکرد شاخههای بارور برای همه درختچههای زرشک اندازهگیری شد. تعداد کل شاخههای بارور و غیر بارور در هر

تحلیل امرژی نظام کشت انگور یاقوتی سیستان

محمد رضا اصغری پور چمن,شیرعلی کوهکن,سید احمد قنبری,براتعلی فاخری
ايران ، خشکبوم ، سال : 2018 ، صفحات : 73-84، شاپا: 2008-790X مقاله در مجله

چکیده

این پژوهش با استفاده از رهیافت تحلیل امرژی برای ارزیابی جنبه‌های محیط زیستی تولید انگور یاقوتی سیستان که از مهترین محصولات باغی است اجرا شد. در این مطالعه تمام ورودی‌ها اعم از ورودی‌های تجدید‌پذیر شامل نور خورشید، باد و باران؛ تجدید ناپذیر شامل خاک؛ نهاده‌ها و خدمات خریداری شده شامل نیروی انسانی، کودهای شیمیایی نیتروژن، پتاسیم و فسفر و سموم شیمیایی برای تولید انگور یاقوتی مورد ارزیابی قرار گرفت. نتایج مطالعه نشان داد کل امرژی تولید انگور یاقوتی برابر1016×94/1 امژول خورشیدی که بیشترین امرژی مصرفی با 41/43 درصد مربوط به نیروی کارگری و پس از آن مربوط به آب آبیاری با 16/23 درصد و در رتبه سوم مربوط به مصرف نیتروژن با 32/11 درصد بود. شاخص نسبت عملکرد امرژی 31/1، شاخص نسبت سرمایه گذاری امرژی 25/3، نسبت بارگزاری بر محیط زیست 541/0 و شاخص پایداری امرژی 42/2 حاصل گردید، که در مقایسه با گزارش‌های ارائه شده از سوی سایر محققین نشان دهنده پایداری نسبتا خوب و بار زیست محیطی کم این سیستم است. بنابراین، با افزایش کارایی مصرف انرژی از طریق بهینه نمودن مصرف نیروی کارگری، آب آبیاری و کود نیتروژن سیستم کشت انگور یاقوتی می‌تواند بعنوان الگوی مناسب در منطقه سیستان توصیه شود.

TRANSFORMATION OF MANITOL 1- PHOSPHATE DEHYDROGENASE (MTLD) GENE INTO CANOLA (BRASSICA NAPUS L.) TO IMPROVE SALINITY TOLERANCE

Forouzan Heidari,Barat Ali Fakheri
Italy , Acta Medica Mediterranea , Year : 2017 , Pages: 935-943, ISSN:0393-6384 Journal Paper

Abstract

Abiotic stresses such as salinity are one of the important factors that limit crops production worldwide. One suitable method for inducing salinity resistance is osmolytes production increase in plants. In this study, biosynthetic gene which produces osmolyte manitol (mtlD gene) was transferred to Brassica napus L. to increase salinity tolerance. AGLO1 strain of Agrobacterium tumefaciens carrying pBI121 transformation vector, containing mtlD and nptII (transformed plant selectable marker) gene were used for transformation of SLM046 cultivar of B. napus L. Hypocotyl explants were utilized for regeneration of canola plants. PCR analysis of transgenic plants depicted a resemblance in the observed band size and expected band of 500 and 680 bp for the nptII and mtlD genes, respectively. Extracted DNA of transgenic plants, just the same as extracted plasmid containing mtlD gene, revealed a colored blot on a positively charged nylon membrane, while wild-type plants revealed no colored blot. Transformation efficiency was 4.7%. Tolerance threshold against NaCl in wild type and transgenic seeds germination were 250 and 350 mM of NaCl. Thus, Gene transformation into B. napus L. led to the synthesis of mannitol 1-phosphate dehydrogenase that improves its salinity tolerance ability.

اثر برخی نانو ذرات بر بیان ژن های جرمارکرن A سنتاز (TpGAS) و پارتنولوئید سنتاز (TpPTS) در گیاه بابونه کبیر (Tanacetum parthenium L.) تحت تنش کم آبی

فروزان حیدری,حدیث موسوی,نفیسه مهدی نژاد,براتعلی فاخری,محمد مجدی
ايران ، تحقیقات گیاهان دارویی و معطر ایران ، سال : 2017 ، صفحات : 314-324، شاپا: 0905-1735 مقاله در مجله

چکیده

به منظور بررسی تأثیر اسپری نانو کلات آهن و نانوذرات نقره سنتز شیمیایی و سنتز سبز بر میزان بیان دو ژن جرماکرن A سنتاز TpGAS)) و و پارتنولید سنتاز (TpPTS) دخیل در مسیر بیوسنتزی پارتنولید در گیاه بابونه کبیر (Tanacetum parthenium L.) آزمایشی به صورت فاکتوریل دو عاملی در قالب طرح پایه کاملاً تصادفی با سه تکرار در گلخانه دانشکده کشاورزی دانشگاه زابل اجرا شد. RNA کل از نمونه های برگی استخراج و به دنبال آن cDNA سنتز و برای بررسی الگوی بیان ژن از واکنش Real time استفاده شد. میزان پارتنولید موجود در عصاره گیاهان بهوسیله دستگاه کروماتوگرافی مایع با کارایی بالا HPLC سنجش شد. دادهها به کمک نرم افزار آماری SAS مورد تجزیه و تحلیل قرار گرفتند. افزایش معنی داری در بیان ژنهای جرماکرن A سنتاز و پارتنولید سنتاز در گیاهان تیمار شده با نانو ذره نقره سنتز سبز نسبت به گیاهان شاهد، گیاهان تیمار شده با نانو ذره نقره سنتز شیمیایی و نانو کلات آهن مشاهده شد و بیشترین بیان ژنهای جرماکرن A سنتازو پارتنولید سنتاز در گیاهانی که تحت تنش خشکی و تیمار با نانوذرات نقره سنتز سبز قرار گرفته بودند، ثبت شد. همبستگی مثبتی بین بیان ژن های جرماکرنA سنتاز و پارتنولید سنتاز با میزان پارتنولید مشاهده شد. . بنابراین به نظر میرسد نانوذرات نقره سنتز سبز و تنش کم آبی میتوانند به عنوان القاءکننده سبب افزایش بیان ژنهای جرماکرن A سنتاز و پارتنولید سنتاز و بهدنبال آن افزایش تولید پارتنولید در گیاه بابونه کبیر شوند.

اثر برخی نانو ذرات بر فعالیت آنزیم های آنتی اکسیدانی و عملکرد پارتنولید گیاه دارویی بابونه کبیر (Tanacetum parthenium L.) تحت تنش کم آبی

فروزان حیدری,نفیسه مهدی نژاد,براتعلی فاخری,حدیث موسوی
ايران ، تنش های محیطی در علوم زراعی ، سال : 2018 ، صفحات : 917-929، شاپا: 2228-7604 مقاله در مجله

چکیده

بهمنظور بررسی اثر نانو کلات آهن، سنتز شیمیایی و سنتز سبز نانو ذرات نقره بر فعالیت آنزیمی، پروتئین کل و درصد پارتنولید گیاه بابونه کبیر تحت تنش خشکی آزمایشی بهصورت فاکتوریل در قالب طرح کاملاً تصادفی در سه تکرار در گلخانه دانشکده کشاورزی دانشگاه زابل اجرا شد. تیمارها شامل فاکتور اول یعنی تنش کمآبی در دو سطح (عدم تنش و تنش ملایم یعنی پنجاهدرصد ظرفیت زراعی) و فاکتور دوم شامل محلولپاشی نانو ذرات در سه سطح نانو کلات آهن با نسبت دو در هزار میلیلیتر، نانو ذرات نقره سنتز شیمیایی و سنتز سبز با غلظت 30 پیپیام و یک سطح محلولپاشی با آب مقطر بهعنوان شاهد بود. جهت بررسی فعالیت آنزیمهای کاتالاز، پلی فنول اکسیداز، پراکسیداز، گایاکول پراکسیداز و پروتئین کل بعد از اعمال آخرین محلولپاشی، نمونهبرداری از برگهای کاملا جوان و گسترده انجام و موردسنجش قرار گرفت. برای اندازهگیری درصد پارتنولید عصاره گیاه از دستگاه کروماتوگرافی مایع با استفاده شد. نتایج نشان داد که تغذیه برگی نانو ذرات و تنش کمآبی منجر به افزایش فعالیت آنزیمهای اکسیدانی، (HPLC) کارایی بالا پروتئین کل و درصد پارتنولید در مقایسه با تیمار شاهد گردید. میتوان اظهار داشت محلولپاشی نانو نقره سنتز شیمیایی تحت تنش 0 واحد در گرم وزن تر در دقیقه) و نانو / 3 و 2873 / کمآبی باعث افزایش آنزیمهای اکسیدانی کاتالاز و پراکسیداز (به ترتیب 4266 1/ 0 و 2373 / کلات آهن در شرایط تنش کمآبی باعث افزایش آنزیم گایاکول پراکسیداز و آنزیم پلی فنل اکسیداز (به ترتیب 5452 واحد در گرم وزن تر در دقیقه) شده است. همچنین میزان پروتئین کل با محلولپاشی نانو نقره سنتز شیمیایی و نانو کلات آهن بدون اعمال تنش کمآبی و عملکرد اقتصادی گیاه بابونه کبیر (مقدار پارتنولید) با محلولپاشی نانو نقره سبز تحت تنش کمآبی افزایش یافته است. بهطورکلی میتوان بیان کرد که گیاه دارویی بابونه کبیر با دارا بودن سیستم آنزیمی قدرتمند و تولید آنزیمهای اکسیداتیو در سطوح بالا، میتواند رادیکالهای آزاد را از بین برده و شرایط ادامه حیات را در شرایط تنش رطوبتی فراهم کند.

EmergyAnalysis of Greenhouse Cucumber Production in Sistan Region

Barat Ali Fakheri,,,Mohammad Reza Asgharipour
IRAN , International Journal Of Agricultural Management And Development , Year : 2018 , Pages: 377-387, ISSN:2159-5852 Journal Paper

Abstract

In the current century, agriculture sustainability and the reduction of environmental pressure are two main objectives of the management of agro-ecosystems that is challenged by energy inefficiency. In this respect, the present study assessed one of the most important planting systems in Sistan region by emergy analysis approach. It analyzed all inputs of greenhouse cucumber production system in Sistan including renewable inputs (sunlight, wind, rain), non-renewable inputs (net topsoil loss), and purchased inputs (machinery, fossil fuels, electricity, plastic, utility, labor, N, K, P and micro fertilizers, and chemical herbicides) and services. In this study, an emergy analysis was performed on greenhouse cucumber production system of Sistan using the data collected from a 3000-m2 greenhouse in Zahak Agricultural Research Station (as an average representative of agricultural lands in Sistan Region). The results revealed that total emergy of greenhouse cucumber system was 1.094 × 1018 seJ, and diesel fuel and labor were the main emergy consumers with the emergy consumption rates of 7.9 × 1017 and 1.92 × 1017 seJ ha-1, respectively. Main emergy indices including emergy yield ratio, emergy investment ratio, environmental loading ratio, and sustainability index were found to be 1.00, 2089, 4.34 and 20.23, respectively. Therefore, it is imperative to consider the optimization of highly consumed inputs, the reduction of environmental impacts, and the increase in sustainability by making changes in greenhouse structures, enhancing energy use efficiency inside the greenhouse, and mechanizing the planting, cultivating and harvesting processes in order to develop greenhouse cucumber system in Sistan.

PHYTOCHEMICAL COMPOUNDS OF LILIUM LEDEBOURII BIOSS USING BULB EXPLANTS

Barat Ali Fakheri,,
Bangladesh , Bangladesh Journal of Botany , Year : 2018 , Pages: 911-920, ISSN:0253-5416 Journal Paper

Abstract

Lilium ledebourii Bioss is a wild species of Lilium, which grows naturally in Damash Mountains of Roodbar, Iran. Secondary metabolite synthesis in plants is one of the most important defensive mechanisms applied against various pathogens, and the quality and quantity of those materials depend on the species diversity, organs, habitat conditions, and different extraction methods. In this study, phytochemical compounds were measured quantitatively and qualitatively. Results showed the existence of secondary metabolites in the regenerated plants. Phenolic content was 5.198±0.17 mg in each extract. Radical trapping of the diphenyl-picryl hydrazyl test was 3.24 ± 0.52 mg/ml. Antioxidant activity based on reduced iron was 25.88 ± 1.47 mmol fe+2/g DW. Flavonoid content of L. ledebourii Bioss was 0.78±0.07 mgRE/G. Peroxidase and superoxide dismutase\\\\\\\'s enzymes activity in L. ledebourii Bioss was low. Also, in this study, the combination of saponin, cardiac glycosides, Steroids, Alkaloids and Terpenoid was seen qualitative in the L. ledebourii Bioss.

Mapping QTL controlling agronomic traits in a doubled haploid population of winter oilseed rape (Brassica napus L.)

Barat Ali Fakheri,,,Christian Möllers,Abbas Rezaizad
India , Journal of Genetics , Year : 2018 , Pages: 1-18, ISSN:0022-1333 Journal Paper

Abstract

Identification of superior alleles for agronomic traits in genetic resources of oilseed rape (Brassica napus L.) would be useful for improving the performance of locally adapted cultivars in Iran. The objective of the present work was to analyse the genetic variation and inheritance of important agronomic traits in a doubled haploid population derived from a cross between two German oilseed rape cultivars, Sansibar and Oase. Field experiments were performed in 2016–2017 with 200 doubled haploid lines and the parental genotypes applying an alpha-lattice design with two replicates. Phenological traits were recorded during the cultivation period and at maturity, seed yield, yield components and seed quality traits were determined. Significant genetic variation was found in most of the traits and heritabilities ranged from medium (48.5%) for days to end of flowering to high (92.6%) for oil content. A molecular marker linkage map was used to map 36 QTL for different traits on 17 linkage groups. Between three and four QTL were identified for each seed yield, seed weight, oil and protein content. Some of the plant material and positive QTL alleles identified for agronomic traits may be useful for improving those characters in locally adapted cultivars in Iran

تحلیل شاخص¬های رشدی شنبلیله تحت تأثیر سطوح مختلف نیتروژن و تراکم بوته

براتعلی فاخری,لیلا بذرکارخطیبانی
ايران ، پژوهشهای زراعی ایران ، سال : 2017 ، صفحات : 747-760، شاپا: 2008-1472 مقاله در مجله

چکیده

به‌منظور بررسی اثر سطوح مختلف نیتروژن و تراکم بوته بر شاخص‌های فیزیولوژیک شنبلیله، آزمایشی مزرعه‌ای در سال زراعی 91-90 در استان گیلان (شهرستان شفت) به‌صورت کرت‌های خردشده در قالب بلوک‌های کامل تصادفی در چهار تکرار انجام شد. کود نیتروژن در چهار سطح (شاهد، 25، 50 و 75 کیلوگرم نیتروژن خالص در هکتار) به‌عنوان عامل اصلی و تراکم بوته شامل (60، 80، 100 و 120 بوته در متر مربع) به‌عنوان عامل فرعی در نظر گرفته شد. نتایج نشان داد که شاخص‌های فیزیولوژیک تحت تأثیر تیمارهای مذکور قرار گرفتند. بالاترین شاخص سطح برگ با کاربرد 50 کیلوگرم کود نیتروژن در هکتار و در تراکم 120 بوته در متر مربع به‌دست آمد. بیشترین تجمع ماده خشک و سرعت رشد محصول مربوط به تیمار نیتروژن 75 کیلوگرم در هکتار و تراکم 120 بوته در متر مربع بود. حداکثر سرعت رشد نسبی پس از دریافت 3/294 درجه روز رشد در تیمار 50 کیلوگرم نیتروژن در هکتار با تراکم 80 بوته در متر مربع مشاهده شد

ارزیابی عملکرد دانه و روابط بین صفات لاینهای خالص نوترکیب گندم نان (Triticum aestivum L.) حاصل از تلاقی SeriM82/Babax در شرایط تنش خشکی

براتعلی فاخری,سیدمحمدتقی طباطبایی مزرعه نو,محمود سلوکی,محسن اسماعیل زاده مقدم,نفیسه مهدی نژاد
ايران ، علوم زراعی ایران ، سال : 2018 ، صفحات : 270-283، شاپا: 1562-5540 مقاله در مجله

چکیده

به‌منظور مقایسه پتانسیل عملکرد دانه لاین­های خالص نوترکیب گندم نان حاصل از تلاقی (SeriM82/Babax) در شرایط تنش خشکی و بررسی روابط عملکرد دانه با سایر صفات مرتبط جهت گزینش غیرمستقیم ژنوتیپ­های برتر برای استفاده در برنامه­های به‌نژادی، 167 لاین­ خالص نوترکیب گندم نان به همراه والدین آن­ها در قالب طرح آلفالاتیس در دو تکرار در شرایط بدون تنش و تنش خشکی در سال‌های 93-1392 و 94-1393 در ایستگاه تحقیقاتی مرکز تحقیقات و آموزش کشاورزی و منابع طبیعی استان یزد مورد ارزیابی قرار گرفتند. نتیجه حاصل از تجزیه واریانس مرکب صفات مورد مطالعه، اختلاف معنی­داری را بین ژنوتیپ‌ها نشان داد. تنوع بالای کلیه صفات مورد ارزیابی در ژنوتیپ‌های گندم نشان دهنده توان و ارزش بالای اصلاحی در جمعیت مورد مطالعه بود. نتایج تجزیه همبستگی نشان داد که تعداد روز تا گلدهی در ژنوتیپ‌های گندم مورد ارزیابی، اثر تعیین کننده‌ای بر عملکرد دانه آن‌ها در شرایط تنش خشکی داشت و به نظر می‌رسد که انتخاب ارقام با طول دوره رشدی کوتاه‌تر، برای تحمل بیشتر به خشکی گزینش مناسب باشد. نتایج تجزیه رگرسیون گام‌به‌گام و تجزیه ضرایب مسیر نشان داد که وزن هزار دانه و طول سنبله از صفات مهم مرتبط با عملکرد دانه هستند که می‌توان از آن‌ها برای گزینش غیرمستقیم عملکرد دانه استفاده نمود. به­طورکلی می­توان نتیجه­گیری کرد که به­دلیل وراثت‌پذیری پایین عملکرد دانه، این صفت برای انتخاب رقم برای شرایط تنش خشکی صفت مناسبی نیست و بهتر است از صفات دارای همبستگی بالا با عملکرد مانند تعداد دانه، میانگین وزن دانه و همچنین ویژگی­های فنولوژیک گیاه استفاده کرد.

شناسایی نواحی ژنگانگی کنترل¬کننده صفات فیزیولوژیک و ریخت شناسی گندم نان در شرایط تنش گرمای انتهای فصل

براتعلی فاخری,فرامرز سهرابی چاه حسن,محمود سلوکی,نفیسه مهدی نژاد
ايران ، علوم گیاهان زراعی ایران ، سال : 2018 ، صفحات : 151-159، شاپا: 2008-4811 مقاله در مجله

چکیده

به‌منظور شناسایی نواحی ژنومی اصلی و اپیستاتیک و اثر متقابل آن‌ها با محیط برای برخی صفات فیزیولوژیک و مورفولوژیک گندم، آزمایشی با 167 لاین خویش آمیخته نوترکیب به همراه والدین آن‌ها (‘‘Babax و ‘SeriM82’) در سال زراعی 95-1394 در مزرعه تحقیقاتی ایستگاه تحقیقات کشاورزی سیستان اجرا گردید. آزمایش در قالب دو طرح آلفا لاتیس با دو تکرار در دو شرایط نرمال و تنش گرمای انتهای فصل اجرا شد‌. صفات روز تا رسیدگی، دوره پر شدن دانه، حداکثر کارایی فتوسیستمII، پایداری غشاء سیتوپلاسمی، تعداد دانه در سنبله، عملکرد دانه و وزن هزار دانه اندازه‌گیری شدند. اثر ژنوتیپ برای کلیه صفات مورد مطالعه معنی‌دار بود و بیشترین میزان همبستگی بین عملکرد دانه و حداکثر کارایی فتوسیستمII (**86/0r =) مشاهده شد. تجزیه QTL به روش ترکیبی بر اساس مکان‌یابی فاصله‌ای مرکب (MCIM) انجام گرفت. برای صفات مورد مطالعه درمجموع سی QTL اصلی مکان‌یابی شد. واریانس فنوتیپی توجیه شده به‌وسیله این QTL ‌ها از 04/7 درصد برای دوره پر شدن دانه تا 41/19 درصد برای وزن هزار دانه متغیر بود. مکان ژنی Qtgw7D درمجاورت نشانگر acc/cat-10 به‌عنوان یک QTL بزرگ اثر (41/19 R2 =) شناسایی شد و پس از تعیین اعتبار می‌تواند در گزینش به کمک نشانگر برای ایجاد ارقام گندم متحمل به گرما مورد استفاده قرار گیرد.

اثر برخی نانو ذرات بر فعالیت آنزیمهای آنتی اکسیدانی و عملکرد پارتنولید گیاه دارویی بابونه کبیر (Tanacetum parthenium L.) تحت تنش کم¬آبی

براتعلی فاخری,نفیسه مهدی نژاد,حدیث موسوی,فروزان حیدری
ايران ، تنش های محیطی در علوم زراعی ، سال : 2018 ، صفحات : 917-929، شاپا: 2228-7604 مقاله در مجله

چکیده

به ­منظور بررسی اثر نانو کلات آهن، سنتز شیمیایی و سنتز سبز نانو ذرات نقره بر فعالیت آنزیمی، پروتئین کل و درصد پارتنولید گیاه بابونه کبیر تحت تنش خشکی آزمایشی به­صورت فاکتوریل در قالب طرح کاملاً تصادفی در سه تکرار در گلخانه دانشکده کشاورزی دانشگاه زابل اجرا شد. تیمارها شامل فاکتور اول یعنی تنش کم‌آبی در دو سطح (عدم تنش و تنش ملایم یعنی پنجاه‌درصد ظرفیت زراعی) و فاکتور دوم شامل محلول‌پاشی نانو ذرات در سه سطح نانو کلات آهن با نسبت دو در هزار میلی‌لیتر، نانو ذرات نقره سنتز شیمیایی و سنتز سبز با غلظت 30 پی ­پی ­ام و یک سطح محلول‌پاشی با آب مقطر به ­عنوان شاهد بود. جهت بررسی فعالیت آنزیم­های کاتالاز، پلی فنول اکسیداز، پراکسیداز، گایاکول پراکسیداز و پروتئین کل بعد از اعمال آخرین محلول‌پاشی، نمونه‌برداری از برگ­های کاملا جوان و گسترده انجام و موردسنجش قرار گرفت. برای اندازه ­گیری درصد پارتنولید عصاره گیاه از دستگاه کروماتوگرافی مایع با کارایی بالا (HPLC)استفاده شد. نتایج نشان داد که تغذیه برگی نانو ذرات و تنش کم‌آبی منجر به افزایش فعالیت آنزیم‌های اکسیدانی، پروتئین کل و درصد پارتنولید در مقایسه با تیمار شاهد گردید.می­توان اظهار داشت محلول ­پاشی نانو نقره سنتز شیمیایی تحت تنش کم‌آبی باعث افزایش آنزیم­های اکسیدانی کاتالاز و پراکسیداز (به ترتیب 3.4266 و 0.28730 واحد در گرم وزن تر در دقیقه) و نانو کلات آهن در شرایط تنش کم‌آبی باعث افزایش آنزیم گایاکول پراکسیداز و آنزیم پلی فنل اکسیداز (به ترتیب 0.5452 و 1.2373 واحد در گرم وزن تر در دقیقه) شده است. همچنین میزان پروتئین کل با محلول­ پاشی نانو نقره سنتز شیمیایی و نانو کلات آهن بدون اعمال تنش کم‌آبی و عملکرد اقتصادی گیاه بابونه کبیر (مقدار پارتنولید) با محلول‌پاشی نانو نقره سبز تحت تنش کم‌آبی افزایش یافته است. به‌طورکلی می­توان بیان کرد که گیاه دارویی بابونه کبیر با دارا بودن سیستم آنزیمی قدرتمند و تولید آنزیم‌های اکسیداتیو در سطوح بالا، می­تواند رادیکال­های آزاد را از بین برده و شرایط ادامه حیات را در شرایط تنش رطوبتی فراهم ­کند

بررسی میزان تنوع در عملکرد و برخی ویژگی‌های ریخت‌شناسی نژادگان‌های انبه (Mangifera indica L.) در برخی مناطق جنوب ایران

براتعلی فاخری,سمیرا عمرانی پور,لیلا فهمیده
ايران ، علوم و فنون باغبانی ایران ، سال : 2018 ، صفحات : 0-0، شاپا: 1680-7154 مقاله در مجله

چکیده

انبه یکی از مهمترین میوه‌های گرمسیری می‌باشد که به سلطان میوه‌ها معروف است. در این راستا روابط بین 19 ویژگی ریخت‌شناسی مربوط به برگ و میوه در 27 نژادگان انبه جنوب ایران مورد بررسی قرار گرفت. نتیجه‌ها نشان داد که بیشتر ویژگی‌های مورد بررسی معنی‌دار بود. بیشترین و کمترین تعداد میوه در درخت را رقم سیندری و نژادگان نارگیل (به ترتیب با میانگین 847 و 340 عدد) داشتند. بیشترین میزان عملکرد تک درخت از نژادگان سیندری و شاهانی2 (با میانگین 261 و240 کیلوگرم) بدست آمد. بر اساس نتیجه‌های بدست آمده از ضریب همبستگی، ویژگی‌ها همبستگی بالایی را با هم نشان دادند و در بیشتر ویژگی‌ها همبستگی معنی‌دار شد. بیشترین میزان همبستگی مثبت و معنی‌دار (75/0) بین ویژگی تعداد میوه درخت و عملکرد مشاهده گردید. براساس تجزیه کلاستر نژادگان‌ها به چهار گروه اصلی تقسیم بندی شدند. بررسی‌های حاصله، حاکی از تنوع بالایی در میان نمونه‌های انبه است که می‌‌تواند به علت افزایش زایشی توسط بذر و دگرگرده افشانی در این گیاه و همچنین تنوع اقلیمی در ایران باشد. از آن‌جا که در این پژوهش رقم وارداتی سیندری و نژادگان شاهانی2 از بیشترین مقدار تعداد میوه، وزن میوه و عملکرد برخوردار بودند. بنابراین نژادگان شاهانی 2 ‌می‌تواند به عنوان رقم مناسب برای بررسی‌های آتی و استفاده در برنامه به‌نژادی و کشت انبه در مناطق مورد مطالعه پیشنهاد شود.

اثر تنش باد بر ویژگی های کمی چای ترش (Hibiscus sabdariffa L) تحت سطوح مختلف کودهای شیمیایی و زیستی

براتعلی فاخری,ملیحه محمدی زاده,نفیسه مهدی نژاد,رقیه محمدپوروشوائی
ايران ، بوم شناسی کشاورزی ، سال : 2019 ، صفحات : 0-0، شاپا: ۲۰۰۸-۷۷۱۳ مقاله در مجله

چکیده

چای ترش (Hibiscus sabdariffa L.) از خانواده پنیرکیان (Malvacea)، گیاهی یکساله، شاخه دار می باشد. به منظور بررسی اثر تنش باد بر ویژگی های کمی چای ترش تحت تاثیر سطوح مختلف کود های شیمیایی و زیستی آزمایشی به صورت طرح کرت های دو بار خرد شده در قالب بلوک های کامل تصادفی در سه تکرار در مزرعه تحقیقاتی دانشگاه زابل در سال 1393 اجرا شد. تیمارهای مورد بررسی شامل تنش باد در سه سطح تنش شدید، ملایم و بدون تنش به عنون عامل اصلی، و عامل فرعی شامل کود شیمیایی با سه سطح فسفر، نیتروژن و NPK و عامل فرعی فرعی شامل کود زیستی با شش سطح نیتروکسین، سوپرنیتروپلاس، سوپربیوفسفات، فسفات بارور2، اسیدهیومیک، بیوسولفور بودند. در این تحقیق ویژ گی های ارتفاع بوته، تعداد شاخه فرعی در بوته، وزن تر و خشک اندام های هوایی، تعداد غوزه در بوته، وزن تر غوزه، وزن تر و خشک کاسبرگ ها، و وزن هزار دانه، مورد اندازه گیری قرار گرفتند. نتایج حاصل از تجزیه واریانس نشان داد که اثر تیمارهای تنش باد وکود شیمیایی، زیستی بر کلیه صفات مورد بررسی معنی دار (01/0P) بودو همچنین اثر متقابل کود شیمیایی و زیستی در صفت وزن خشک اندام هوایی در سطح 5 درصد ودر بقیه صفات در سطح یک درصد معنی دار بود. بیشترین میزان ارتفاع بوته، وزن تر و خشک اندام هوایی،تعداد غوزه، وزن غوزه در تیمار بدون تنش باد و وزن تر و خشک کاسبرگ در تنش ملایم باد به دست آمد. بیشترین میزان ارتفاع بوته، وزن تر خشک اندام هوایی، تعداد غوزه، وزن غوزه، وزن هزاردانه، وزن تر و خشک کاسبرگ در تیمار کودشیمیایی نیتروژن حاصل شد. بیشترین تعداد شاخه های فرعی در تیمار کودشیمیایی NPK به دست آمد. بیشترین میزان ارتفاع و تعداد شاخه های فرعی و وزن تر اندام هوایی به ترتیب در تیمار کود زیستی فسفات بارور 2 و بیوسولفور حاصل شد. بیشترین مقدار وزن غوزه، وزن تر و خشک کاسبرگ و وزن هزار دانه در تیمار کود زیستی اسیدهیومیک حاصل شد. با توجه به ضرورت گیاهان دارویی در نظام های زراعی به نظر می رسد که تلفیق کودهای شیمیایی و زیستی باعث افزایش عملکرد وکاهش اثرات تنش باد می شود

مستندسازی فرآیندهای تولید گندم (.Triticum aestivum L) در سیستم‎های آبی و دیم در استان گلستان

براتعلی فاخری,مریم طهماسبی,محمود رمرودی,افشین سلطانی,سید احمد قنبری
ايران ، بوم شناسی کشاورزی ، سال : 2019 ، صفحات : 0-0، شاپا: ۲۰۰۸-۷۷۱۳ مقاله در مجله

چکیده

مستند‎سازی از قدم‌های اولیه و اساسی در بهبود هر فرآیند تولیدی است که متاسفانه جایگاه درخوری در بخش کشاورزی کشور ندارد. مستندسازی فرآیند تولید یک محصول در کشاورزی شامل تهیه کلیه اطلاعات و فعالیت‎هایی است که سیر تولید آن محصول از مرحله آماده سازی بستر بذر تا برداشت را نشان می‎دهد. در این مطالعه به منظور بهره‎گیری از این ابزار در جهت بهبود فرآیندهای تولید گندم در دو سیستم آبی و دیم استان گلستان، کلیه فعالیت‎ها و مصرف نهاده‎ها که هر مدیر مزرعه در طی سه سال گذشته به طور معمول انجام داده یا مصرف کرده است، در 540 مزرعه با مدیریت‌های مختلف ثبت گردید. نتایج مستندسازی نشان داد که میانگین مساحت مزارع آبی بیشتر از دیم بود. اکثر مزارع آبی قبل از گندم زیر کشت دو محصول تابستانه‌ی سویا و برنج بودند، بیشتر مزارع دیم محصول تابستانه نداشته و اکثر مزارع در سال قبل نیز زیر کشت گندم و جو بودند. اکثر تولیدکنندگان گندم آبی و دیم از گاوآهن و دیسک به عنوان خاک‌ورزی اولیه استفاده کرده‌اند. همچنین بیشترین نوع ادوات کشت در تولید گندم در هر دو سیستم، خطی‎کار بود. رقم مروارید بیشترین رقم مورد استفاده در هر دو سیستم کشت گندم دیم و آبی بود. مقدار بذر مصرفی در سیستم دیم بیشتر و تاریخ کشت نیز از گستردگی زمانی بیشتری نسبت به کشت آبی برخوردار بود. 50 درصد از مزارع مورد بررسی در بخش آبی و دیم به ترتیب حداقل از 95 و 70 کیلوگرم نیتروژن خالص استفاده کردند. در هر دو سیستم بیشترین استفاده از علف‎کش‎مربوط به گرانستار و تاپیک، بیشترین استفاده از قارچ‎کش مربوط به تیلت و بیشترین استفاده از آفت کش دیازینون بود. ترجیح کشاورزان به استفاده از روش‎های سنتی آبیاری برای مزارع بود. دامنه زمانی برداشت گندم از اواسط اردیبهشت تا اواخر خرداد بود. میانگین عملکرد گندم آبی 3845 کیلوگرم در هکتار بود که از دیم با عملکرد 3145 کیلوگرم در هکتار بیشتر بود. نتایج این مطالعه با ارایه تصویری کلی از زیر فرآیندهای تولید گندم در سیستم‎های آبی و دیم و مشخص‌سازی دقیق مقدار و زمان ورود نهاده‌ها به فرآیند تولید امکان ارزیابی‎های جامع‌نگر تولید گندم در گلستان از دیدگاه‌های زیست محیطی، اقتصادی و جامعه شناختی را میسر می‌سازد

Assessment of Yield and Yield Component of Soybean Genotypes (Glycine Max L.) in North of Khuzestan

Barat Ali Fakheri,,Ahmad Nooshkam,
south korea , Journal of Crop Science and Biotechnology , Year : 2018 , Pages: 435-441, ISSN:1975-9479 Journal Paper

Abstract

18 soybean genotypes were examined to investigate the relationships between some principal attributions of morphology with seed yield per soybean, by Random Complete Block Design (RCBD) study. This study was also carried out three replicates to gain reliable results. The results of variance analysis indicated that, there were significance differences among all soybean genotypes. Moreover, the results of correlated analysis revealed that biological yield (0.96), harvest index (0.92), and number of branches (0.92) had the uttermost correlation with seed yield. To data factor analysis, four independent variables justified 99 percent of all data. The first variable, seed yield, justified 96 percent of entire variance. Multiple-Regression Model with method Analytical Regression Model (step-by-step) was utilized to examine soybean seed yield. This model proved that biological yield, thousand seed weight, and harvest index entered into model respectively and justified 98.85 percent of variation of seed yield. Correlated coefficients of considered attributions were equal to 0.96, 0.78, and 0.92, respectively. All of these indexes had significant at 1% in statistical process. Therefore, these traits can be notability used in soybean breeding programs. Also, accordance to cluster analysis, the sample was divided into three groups.

Protein complex prediction: A survey

Abbasali Emamjomeh,جواد ظهیری,,اسما ایوزه,قاسم مهدور,حسام سپاسی تهرانی,مهدی میرزایی,Barat Ali Fakheri,مرتضی محمدنوری
English , Genomics , Year : 2019 , Pages: 1-9, ISSN:0888-7543 Journal Paper

Abstract

Protein complexes are one of the most important functional units for deriving biological processes within the cell. Experimental methods have provided valuable data to infer pro-tein complexes. However, these methods have inherent limitations. Considering these limi-tations, many computational methods have been proposed to predict protein complexes, in the last decade. Almost all of these in-silico methods predict protein complexes from the ever-increasing protein-protein interaction (PPI) data. These computational approaches usually use the PPI data in the format of a huge protein-protein interaction network (PPIN) as input and output various sub-networks of the given PPIN as the predicted protein com-plexes. Some of these methods have already reached a promising efficiency in protein com-plex detection. Nonetheless, there are challenges in prediction of other types of protein complexes, specially sparse and small ones. New methods should further incorporate the knowledge of biological properties of proteins to improve the performance. Additionally, there are several challenges that should be considered more effectively in designing the new complex prediction algorithms in the future. This article not only reviews the history of computational protein complex prediction but also provides new insight for improvement of new methodologies. In this article, most important computational methods for protein com-plex prediction are evaluated and compared. In addition, some of the challenges in the re-construction of the protein complexes are discussed. Finally, various tools for protein com-plex prediction and PPIN analysis as well as the current high-throughput databases are re-viewed

Salinity-associated microRNAs and their potential roles in mediating salt tolerance in rice colonized by the endophytic root fungus Piriformospora indica

Abbasali Emamjomeh,,Barat Ali Fakheri,مهدی قبولی,,بهنام خطابی,مژگان سپهری,قاسم حسینی سالکده,مجمدرضا غفاری
Germany , Functional and integrative genomics , Year : 2019 , Pages: 1-14, ISSN:1438-793X Journal Paper

Abstract

Piriformospora indica (P. indica), an endophytic root fungus, supports the growth and enhanced tolerance of plants to biotic and abiotic stresses. Several recent studies showed the significant role of small RNA (sRNA) molecules including microRNAs (miRNAs) in plant adaption to environmental stress, but little is known concerning the symbiosis-mediated salt stress tolerance regulated at miRNAs level. The overarching goal of this research is to elucidate the impact of miRNAs in regulating the P. indicamediated salt tolerance in rice. Applying sRNA-seq analysis led to identify a set of 547 differentially abundant miRNAs in response to P. indica inoculation and salt stress. These included 206 rice-specific and 341 previously known miRNAs from other plant species. In silico analysis of miRNAs predictions of the differentially abundant miRNAs led to identifying of 193 putatively target genes, most of which were encoded either genes or transcription factors involved in nutrient uptake, sodium ion transporters, growth regulators, and auxin- responsive proteins. The rice-specific miRNAs targeted the transcription factors involved in the import of potassium ions into the root cells, the export of sodium ions, and plant growth and development. Interestingly, P. indica affected the differential abundance of miRNAs regulated genes and transcription factors linked to salt stress tolerance. Our data helps to understand the molecular basis of salt stress tolerance mediated by symbionts in plant and the potential impact of miRNAs for genetic improvement of rice varieties for tolerance to salt stress.

EmergyAnalysis of Greenhouse Cucumber Production in Sistan Region

Mohammad Reza Asgharipour,,,Barat Ali Fakheri
IRAN , International Journal Of Agricultural Management And Development , Year : 2018 , Pages: 377-387, ISSN:2159-5852 Journal Paper

Abstract

In the current century, agriculture sustainability and the reduction of environmental pressure are two main objectives of the management of agro-ecosystems that is challenged by energy inefficiency. In this respect, the present study assessed one of the most important planting systems in Sistan Region by emergy analysis approach. It analyzed all inputs of greenhouse cucumber production system in Sistan including renewable inputs (sunlight, wind, rain), non-renewable inputs (net topsoil loss), and purchased inputs (machinery, fossil fuels, electricity, plastic, utility, labor, N, K, P and micro fertilizers, and chemical herbicides) and services. In this study, an emergy analysis was performed on greenhouse cucumber production system of Sistan using the data collected from a 3000-m2 greenhouse in Zahak Agricultural Research Station (as an average representative of agricultural lands in Sistan Region). The results revealed that total emergy of greenhouse cucumber system was 1.094 × 1018seJ, and diesel fuel and labor were the main emergy consumers with the emergy consumption rates of 7.9 × 1017 and 1.92 × 1017seJ ha-1, respectively. Main emergy indices including emergy yield ratio, emergy investment ratio, environmental loading ratio, and sustainability index were found to be 1.00, 2089, 4.34 and 20.23, respectively. Therefore, it is imperative to consider the optimization of highly consumed inputs, the reduction of environmental impacts, and the increase in sustainability by making changes in greenhouse structures, enhancing energy use efficiency inside the greenhouse, and mechanizing the planting, cultivating and harvesting processes in order to develop greenhouse cucumber system in Sistan

اثر نظام های مختلف کوددهی (زیستی و نانوزیستی) بر رشد، غلظت عناصر، عملکرد پیکره رویشی و اسانس رزماری (Rosmarinus officinalis L.) تحت تنش خشکی

محمود رمرودی,رقیه محمدپوروشوائی,سید احمد قنبری,براتعلی فاخری
ايران ، علوم گیاهان زراعی ایران ، سال : 2019 ، صفحات : 67-86، شاپا: 2008-4811 مقاله در مجله

چکیده

جایگزینی نهاده های شیمیایی با نهاده های بومسازگار بهعنوان گامی در جهت گذار از کشاورزی رایج به پایدار، ضروری بهنظر میرسد. در این راستا، آزمایشی در سالهای 1393 - 1395 ، بهصورت کرتهای یکبار خرد شده و در قالب طرح بلوکهای کامل تصادفی، در سه تکرار، در پژوهشکده کشاورزی دانشگاه زابل اجرا شد. تنش خشکی در چهار سطح شامل 30 ، 50 ، 70 و 90 درصد آب قابل دسترس گیاه، بهعنوان عامل اصلی و کود در چهار سطح، شامل نانوبیومیک، نیتروکسین، میکوریزا و عدم کاربرد کود بهعنوان عامل فرعی، در نظر گرفته شد. اثر متقابل سال، تنش خشکی و کود برای کلیه صفات مورد بررسی، معنادار شد. در تیمار آبیاری با 90 درصد رطوبت قابل دسترس و کود نانوبیومیک در سال دوم، بیشترین ارتفاع بوته ) 75 / 37 سانتیمتر(، تعداد شاخه در بوته ) 01 / 47 شاخه(، وزن تر و خشک شاخ و برگ )بهترتیب 60 / 86 و 82 / 31 گرم در بوته(، عملکرد پیکره رویشی ) 38 / 1750 کیلوگرم در هکتار(، درصد نیتروژن و فسفر برگ ) 35 / 13 و 742 / 0 درصد( بهدست آمد. بالاترین درصد پتاسیم برگ ) 07 / 7 درصد(، درصد اسانس ) 575 / 1 درصد( و عملکرد اسانس ) 22 / 31 و 93 / 1716 گرم در بوته/کیلوگرم در هکتار(، به تیمار آبیاری با 30 درصد رطوبت قابل دسترس و کود نانوبیومیک در سال دوم تعلق داشت. ترکیبات یک و هشت سینئول،  ترپینئول و لیمونن، - مهمترین ترکیبات اسانس گیاه رزماری بودند. تنش خشکی، موجب تغییر و کودهای نانوزیستی و زیستی، موجب افزایش ترکیبات اسانس رزماری شدند. کود نانوبیومیک نسبت به سایر کودهای زیستی توانست تنش خشکی را بهتر تعدیل نماید و موجب بهبود رشد، عملکرد پیکره رویشی و اسانس و ترکیبات اسانس رزماری شود. بنابراین، در راستای نیل به اهداف کشاورزی پایدار، استفاده از آن، جهت بهبود ویژگیهای زراعی و بیوشیمیایی رزماری توصیه میشود.

اثر تنش خشکی و کودهای زیستی بر ویژگی¬های کمّی و کیفی ماریتیغال (Silybum marianum L.).

محمود رمرودی,رقیه محمدپوروشوائی,براتعلی فاخری
ايران ، بوم شناسی کشاورزی ، سال : 2017 ، صفحات : 134-152، شاپا: ۲۰۰۸-۷۷۱۳ مقاله در مجله

چکیده

خار مریم یا ماریتیغال منظور بررسی اثر تنش خشکی و کودهای زیستی بر خصوصیات کمی و کیفی ماریتیغال، آزمایشی به صورت کرتهای خرد شده در قالب طرح بلوک- 70 و 90 ، 1391 اجرا شد. کرتهای اصلی شامل آبیاری با 50 - های کامل تصادفی در سه تکرار در مزرعه تحقیقاتی دانشگاه زابل در سال زراعی 92 درصد ظرفیت زراعی و کرتهای فرعی شامل تغذیه گیاه با کودهای زیستی نیتروکسین، سوپرنیتروپلاس، فسفات بارور 2، میکوریزا به صورت بذر مال و عدم مصرف کود بود. صفات مورد مطالعه شامل عملکرد دانه، تعداد کاپیتول در بوته، تعداد دانه در کاپیتول، وزن هزار دانه، درصد اسانس، درصد ماده آلی گیاه، درصد پرولین و درصد پروتئین دانه بودند. نتایج نشان داد که اثر تنش خشکی، کود زیستی و برهمکنش آنها بر کلیه صفات مورد بررسی در سطح 23 گرم)، درصد / 12 عدد)، وزن هزار دانه ( 27 / 1300 گیلوگرم)، تعداد کاپیتول در بوته ( 00 / احتمال یک درصد معنیدار شد. بیشترین عملکرد دانه ( 00 17 درصد) در تیمار 90 درصد آبیاری و کود زیستی نیتروکسین حاصل شد. حداکثر تعداد دانه در / 95 درصد) و درصد پروتئین دانه ( 19 / ماده آلی گیاه ( 00 87 عدد به تیمار 90 درصد آبیاری و کود زیستی میکوریزا تعلق داشت. تیمارهای 70 و 90 درصد آبیاری و کود زیستی نیتروکسین به / کاپیتول با 67 0 درصد) را تبیین نمودند. تعداد کاپیتول در بوته مهمترین جزء تعیین- / 3 درصد) و درصد پرولین ( 04 / ترتیب حداکثر و حداقل صفات درصد اسانس ( 72 کننده عملکرد بود. کود زیستی نیتروکسین نسبت به سایر کودها توانست تنش خشکی را بیشتر تعدیل نماید و موجب بهبود ویژگیهای کمی و کیفی گیاه ماریتیغال شود. بنابراین، به نظر میرسد که در راستای نیل به اهداف کشاورزی پایدار به جای کودهای شیمیایی قابل توصیه باشد.

بررسی ژنوتیپهای انبه ) Mangifera indica L. ( جنوب ایران بر اساس شاخصهای مورفولوژیکی و بیوشیمیایی

لیلا فهمیده,سمیرا عمرانی پور,براتعلی فاخری
ايران ، نشریه فیزیولوژی محیطی گیاهی ، سال : 2019 ، صفحات : 0-0، شاپا: 7671-2423 مقاله در مجله

چکیده

به منظور گروهبندی و مقایسه 22 ژنوتیپ انبه در مناطق جنوب ایران )استانهای کرمان و هرمزگان(، صفات فیزیولوژیکی مربوط به برگ، میوه و هسته، بر اساس توصیفگر جهانی انبه اندازهگیری شد. نتایج تجزیه واریانس دادهها نشان داد که اثر ژنوتیپ بر صفات کلروفیل b ، کلروفیل کل، کارتنوئیدها، نشت یوونی، ننتوسویانیب بورگ، pH میوه، میزان مواد جامد محلول، ویتامیب ث )اسید نسکوربیک(، TSS نب میوه، اسیدیته میوههوا و هچننویب خصوصیات هسته )طول هسته، ضخامت هسته، عرض هسته، وزنتر هسته و وزنخشک هسته( معنویدار بوود . نتایج مقایسه میانگیبها مشخص ساخت بالاتریب میزان اسید نسکوربیک، مواد جامد محلول میوه و کلروفیل کل 3 سانتیمتر( / برگ به ترتیب به ژنوتیپهای سیندری، دوقلو و خاروست تعلق داشتند. ژنوتیپ نباتی 1 کچتریب ) 9 11 سانتیمتور(، و ژنوتیوپ نبواتی 1 و لانگورا بوهترتیوب کچتوریب و / و بینام 1 بیشتریب میانگیب طول هسته ) 66 4 سانتیمتر( را در بیب ژنوتیپهای مورد مطالعوه بوه خوود اختصوا / 2 و 2 / بیشتریب میانگیب عرض هسته ) 8 دادند. هچننیب بیشتریب عچلکرد تک درخت از ژنوتیپ سیندری ) 262 کیلوگرم( بدست نمود بوا ننکوه تفواوت 242 کیلوگرم( نداشت. تجزیه کلاستر بر اساس متوسو فاصوله بویب گوروههوا ( معنیداری با ژنوتیپ شاهانی 2 ( UPGMA 2 در چهار گروه قرار داد.

Genetic Mapping and Validation of Quantitative Trait Loci (QTL) for the Grain Appearance and Quality Traits in Rice (Oryza sativa L.) by Using Recombinant Inbred Line (RIL) Population

Barat Ali Fakheri,,Maryam Hosseini-Chaleshtori,Anumalla Mahender,,Jauhar Ali
Egypt , International Journal of Genomics , Year : 2019 , Pages: 1-13, ISSN:2314-436X Journal Paper

Abstract

Rice grain shape and nutritional quality traits have high economic value for commercial production of rice and largely determine the market price, besides influencing the global food demand for high-quality rice. In order to understand the genetic components of grain appearance traits in paddy, brown, and head rice, 15 traits were evaluated by using 157 recombinant inbred lines (RILs) derived from a cross between two Iranian rice cultivars Ali-Kazemi (A) and Kadous (K). A significant variation was observed and showed transgressive segregation among the RILs. Correlations between the visual appearances of grain traits were studied. A linkage map with 65 polymorphic SSR markers was constructed, which covered 1517.32 cM of the rice genome. A total of seven QTLs were identified on four chromosomes, 1, 6, 9, and 12, associated with four traits, which are explained by the total phenotypic variation of 44.27% and LOD score of 32.77 in 2014 and 2015, respectively. Among these, four QTLs for two traits were consistently flanked by RM23904 and RM24432 on chromosome 9. Single QTL for head grain length (HGL) expressed in both the years on chromosomes 1 and 9. A major QTL for seed weight was detected on chromosome 9, which explained 10.18% of the phenotypic variation. The additive effect of all the QTLs was positively contributed by Ali-Kazemi allele, except one QTL on chromosome 6 (qBGL_6) that showed a negative additive effect being contributed by the Kadous allele. The study also validated the identified QTLs with the polymorphic SSR markers that were previously reported. Novel QTLs were identified on chromosomes 6 and 9, and many of the polymorphic markers were found to be associated with milling processing of grain quality, cooking, and nutraceutical properties of rice by extensive literature and database analysis. Therefore, these validated QTLs and marker information could be utilized in the marker-assisted selection to improve grain appearance and nutritional grain quality traits in rice.

اثر کودهای زیستی بیومیک و نانو (آهن، روی، منگنز) بر عملکرد اقتصادی، آنزیم¬های آنتی¬اکسیدانی و غلظت برخی عناصر چای ترش (Hibiscus sabdariffa L.) تحت تنش خشکی

براتعلی فاخری,سیده عصمت هاشمی فدکی,نفیسه مهدی نژاد,رقیه محمدپوروشوائی
ايران ، نشریه فیزیولوژی محیطی گیاهی ، سال : 2018 ، صفحات : 107-113، شاپا: 7671-2423 مقاله در مجله

چکیده

ه­منظور بررسی اثرات کود نانو (آهن، روی، منگنز)، زیستی بیومیک و تنش خشکی بر عملکرد اقتصادی کاسبرگ، فعالیت آنزیم­های آنتی اکسیدانی و غلظت برخی عناصر در گیاه چای ترش تحت تنش خشکی، آزمایشی در مزرعه تحقیقاتی دانشگاه زابل در سال 1394 به صورت کرت­های یک­بار خرد شده در قالب بلوک‌های کامل تصادفی با سه تکرار انجام شد. تیمار­های آزمایش شامل چهار سطح تنش خشکی (30، 50، 70 و 90 درصد رطوبت قابل دسترس) به عنوان عامل اصلی و چهار سطح (عدم مصرف کود، نانو آهن، ترکیبات آهنی و نانو زیستی بیومیک) به‌عنوان عامل فرعی بودند. اثرات اصلی تنش خشکی، کود و برهمکنش آن­ها بر کلیه صفات مورد بررسی در سطح احتمال یک درصد معنی­دار شد. بیشترین وزن تر و خشک محلول­پاشی کود نانو آهن و تنش خشکی 70 درصد ظرفیت زراعی بدست آمد. تیمار کود نانو آهن و 30 درصد رطوبت قابل دسترس، بیشترین فعالیت آنزیم­های کاتالاز، گایاکول پراکسیداز و آسکوربات پراکسیداز را شامل شد. کاربرد کود نانو آهن باعث افزایش غلظت عناصر ماکرو و میکرو (آهن، روی،ازت، فسفر وپتاس) در گیاه شد و بیشترین مقدار غلظت عناصر آهن، روی، فسفر وپتاس در برهمکنش کود نانو آهن و تنش خشکی 70 درصد ظرفیت زراعی بدست آمد. به‌طورکلی می­توان گفت تنش موجب تأثیرات مخرب بر گیاه شده و مصرف نانو آهن موجب افزایش تحمل گیاه به تنش شده و استفاده از گیاه چای ترش برای شرایط تنش مناسب می­باشد.

تجزیه QTL برای صفات مورفولوژیک جو تحت شرایط تنش بور

براتعلی فاخری,حسن مسلمی,محمود سلوکی
ايران ، پژوهشنامه اصلاح گیاهان زراعی ، سال : 2018 ، صفحات : 57-65، شاپا: 2228-6128 مقاله در مجله

چکیده

در این مطالعه 72 لاین هاپلوئید مضاعف شده جو به همراه دو والد مورد مطالعه قرار گرفتند. این تحقیق در قالب طرح بلوک‌های کامل تصادفی با دو تکرار و در شرایط بدون تنش (شاهد) و تنش بور، در محیط کشت هیدروپونیک در سال 1392 به اجرا درآمد. صفات وزن تر و خشک ریشه و بخش هوایی و نسبت آنها، طول ریشه و ساقه، طول بلندترین برگ و طول کل گیاه اندازه گیری شدند. تجزیه­ های آماری برای بررسی‌های فنوتیپی شامل تجزیه واریانس، مقایسه میانگین و محاسبه همبستگی­ های فنوتیپی بین صفات انجام شد. نتایج تجزیه واریانس نشان داد که تفاوت معنی‌داری بین لاین ­ها برای اغلب صفات مورد بررسی وجود داشت. در شرایط شاهد و تنش بور حداکثر همبستگی بین صفت طول ریشه با طول کل گیاه (925/0 و 934/0) مشاهده شد. تجزیه QTL با استفاده از نقشه پیوستگی ژنتیکی حاصل از نشانگرهای مولکولی به دست آمده از 327 مارکر AFLP و نرم­افزار WinQTL cartographer 2.5 به روش مکان­یابی فاصله­ ای مرکب (CIM) انجام شد. در مجموع 29 عدد QTL برای صفات مورد بررسی (به ترتیب 17 تا برای شرایط شاهد و 12 تا برای شرایط تنش) بدست آمد که واریانس فنوتیپی توجیه شده به وسیله این QTLها از10 تا 56/27 درصد متغیر بود. بیشترین و کمترین واریانس فنوتیپی متعلق به صفت نسبت طول ریشه به ساقه در شرایط تنش بور بود. LOD در دامنه 32/4-50/2 قرار داشت. بیشترین و کمترین LOD به ترتیب مربوط به QTLهای صفات نسبت طول ریشه به ساقه و طول برگ بود. در این تحقیق فقط یک جایگاه واجد QTL در یک مکان مشابه قرار داشت که به صورت پایدار بود (طول برگ 3H)، بنابراین می‌توان از آن برای گزینش به کمک نشانگر استفاده نمود.

The Effects of Zinc Oxide Nanoparticles on Enzymatic and Osmoprotectant Alternations in Different Moringa peregrina Populations Under Drought Stress

Barat Ali Fakheri,Leila Foroutan,,Vahid Abdossi
IRAN , International Journal of Basic Science in Medicine , Year : 2018 , Pages: 178-187, ISSN:2476-664X Journal Paper

Abstract

Introduction: Moringa peregrina (Forssk.) Fiori as a desert tree has economic, nutritional, and medicinal properties, and is constantly encountered with drought stress. In addition, the role of zinc oxide nanoparticles (ZnO-NPs) in regulating the drought stress which induces biochemical processes is uncertain in this plant. Therefore, this study aimed to investigate the biochemical alternations, namely, enzymatic and osmoprotectant which are induced by ZnO-NPs in ten populations of M. peregrina under drought stress. Materials and Methods: Moringa peregrina seeds were collected from southeast of Iran in 2014. The young plants were exposed to drought stress by withholding irrigation (until 50% filed capacity [FC]) 40 days after germination followed by spraying 0 (as control), 0.05, and 0.1% of the ZnONPs. Results: The alternations of Na/K ratio, enzymes activities, and osmoprotectant content varied under drought stress depending on the M. peregrina populations. Generally, drought stress significantly enhanced peroxidase (POD) and polyphenol oxidase (PPO) activities, as well as proline content in untreated plants. Further, the Na/K ratio and carbohydrates content significantly decreased under the drought stress. Furthermore, ZnO-NP treatment significantly enhanced POD and PPO activities, as well as proline and carbohydrates content under both well-watered (100% FC) and drought stress conditions (50% FC), and at the concentration of 0.05% rather than 0.1%, ZnO-NPs was more effective. Conclusion: Overall, ZnO-NP treatment could effectively improve the drought tolerance by enhancing the enzymes activities and osmoprotectant content in different M. peregrina populations under drought stress. Therefore, foliar application of ZnO-NPs at 0.05% concentration could be a recommended treatment for growing different M. peregrina populations under drought stress conditions.

اثر مدیریتهای مختلف خاک ورزی بر کیفیت علوفه و دانه ذرت (Zea mays L.) تحت تأثیرمنابع مختلف کودهای آلی و شیمیایی

براتعلی فاخری,احمد قاسمی,سید احمد قنبری,حمید رضا فنایی
ايران ، بوم شناسی کشاورزی ، سال : 2018 ، صفحات : 490-503، شاپا: ۲۰۰۸-۷۷۱۳ مقاله در مجله

چکیده

در راستای توسعه کشاورزی پایدار، این آزمایش به¬صورت کرت‌های یک بار خرد شده در قالب طرح بلوک‌های کامل تصادفی با سه تکرار در مرکز تحقیقات کشاورزی و منابع طبیعی سیستان طی دو سال زراعی 1392 و 1393 اجرا گردید. تیمارها‌ی آزمایش شامل خاک‌ورزی به¬عنوان عامل اصلی در دو سیستم متداول ( شخم و مخلوط کردن کود با خاک) و بی‌خاک‌ورزی (باقی گذاشتن بقایای کود سبز بر سطح خاک و کشت مستقیم ذرت (Zea mays L.) و منابع کود: T0: شاهد (بدون مصرف کود)،T1: کود سبز جو (Hordeum vulgare L.) بدون مصرف کود دامی و شیمیایی، T2: کود سبز با مصرف کامل کود شیمیایی توصیه شده (NPK) به جو شامل اوره، سوپر فسفات تریپل و سولفات پتاسیم به¬ترتیب به¬میزان 165، 90 و 75 کیلوگرم در هکتار، T3: کود سبز با دو سوم کود شیمیایی به جو و یک سوم باقی مانده به ذرت،T4 : کود سبز با یک سوم کود شیمیایی به جو و دو سوم باقی مانده به ذرت،T5 : کود سبز جو با مخلوط نصف کود دامی و شیمیایی و T6: کود سبز با 40 تن کود دامی به عنوان عامل فرعی بودند. زمان برگرداندن جو به خاک مرحله خوشه‌دهی بود. نتایج نشان داد که اختلاط کود با خاک در مقایسه با بی‌خاک‌ورزی منجر به افزایش عملکرد دانه، علوفه‌تر و خشک، میزان نیتروژن، پتاسیم، فسفر و خاکستر دانه و کاهش درصد الیاف نامحلول در شوینده خنثی (NDF)گردید. منابع کود آلی و شیمیایی باعث افزایش معنی‌دار عملکرد دانه، علوفه‌تر و خشک، میزان نیتروژن، پتاسیم، فسفر، روی و خاکستر دانه شدند، ولی بر درصد NDF روند کاهشی نشان دادند. برهمکنش سال در خاک‌ورزی در منبع کود نشان داد که بیشترین عملکرد دانه، علوفه‌تر و خشک در سال دوم در سیستم اختلاط کود با خاک و در منبع کود سبز جو با مخلوط نصف کود دامی و شیمیایی با میانگین عملکرد دانه و علوفه‌تر به¬ترتیب برابر 400/9 و 151/110 تن در هکتار حاصل شد. بر اساس نتایج مخلوط کود سبز با نصف کود دامی و شیمیایی همراه با اختلاط کود با خاک برای تولید کمی و کیفی دانه و علوفه ذرت مناسب می باشد.

تاثیر کاربرد انواع کود فسفری شیمیایی و بیولوژیک بر عملکرد و اجزای عملکرد ذرت و خلر در کشت مخلوط

محمود رمرودی,مهدی نقی زاده,محمد گلوی,براتعلی فاخری,مصطفی حیدری,علی اکبر مقصودی
ايران ، علوم گیاهان زراعی ایران ، سال : 2012 ، صفحات : 203-215، شاپا: 2008-4811 مقاله در مجله

چکیده

ه منظور بررسی تاثیر کودهای فسفری شیمیایی و زیستی و نسبت‌های مختلف کشت مخلوط بر عملکرد و اجزای عملکرد ذرت و خلر، در سال زراعی 89-1388 دو آزمایش جداگانه در مزرعه تحقیقاتی دانشگاه کرمان و مزرعه دشتکار در بردسیر کرمان اجرا شد. آزمایش در هر دو محل، به صورت فاکتوریل در قالب طرح بلوک‌های کامل تصادفی با چهار تکرار اجرا گردید. فاکتورهای مورد بررسی شامل چهار سطح کود فسفری و پنج الگوی کاشت بود. تجزیه مرکب داده‌ها نشان داد که اثر مکان بر اکثر ویژگی‌های اندازه‌گیری شده معنی‌دار بود. اثر نسبت‌های مختلف کشت و کودهای فسفری بر وزن هزار دانه، تعداد دانه در ردیف، عملکرد دانه، عملکرد بیولوژیک و شاخص برداشت ذرت معنی‌دار بود و بیشترین آن‌ها در مخلوط 75:25 ذرت و خلر و تیمار کودی 50 درصد فسفر زیستی +50 درصد فسفر شیمیایی و کمترین آن‌ها در کاشت خالص ذرت و شرایط عدم مصرف کود بدست آمد. برهمکنش نسبت‌های مختلف کشت و کودهای فسفری بر تعداد غلاف در بوته، تعداد دانه در غلاف، عملکرد دانه، عملکرد بیولوژیک و شاخص برداشت خلر معنی‌دار بود و حداکثر این پارامترها در کشت مخلوط 25:75 ذرت و خلر و تیمار کودی 50 درصد فسفر زیستی +50 درصد فسفر شیمیایی حاصل گردید. ارزیابی نسبت برابری زمین نشان داد که نسبت برابری زمین در تمام سیستم‌های کشت مخلوط بیشتر از یک بود و بیشترین آن در کشت مخلوط 25:75 ذرت و خلر مشاهده شد. این نشان دهنده برتری کشت مخلوط نسبت به کشت خالص است.بنابر این این نسبت کشت مخلوط همراه با مصرف 50 درصد فسفر زیستی +50 درصد فسفر شیمیایی در شرایط کرمان قابل توصیه می باشد.

بررسی تأثیر روش کاشت بر ویژگی¬های زراعی، عملکرد و اجزای عملکرد ارقام شیرین و فوق شیرین ذرت(Zea mays L.) در شرایط شور

محمود رمرودی,فهیمه فریدی مایوان,محمد گلوی,براتعلی فاخری,سعید خاوری خراسانی
ايران ، بوم شناسی کشاورزی ، سال : 2013 ، صفحات : 188-197، شاپا: ۲۰۰۸-۷۷۱۳ مقاله در مجله

چکیده

به منظور بررسی تأثیر الگوی کشت بر خصوصیات فنولوژیک، مورفولوژیک، عملکرد و اجزای عملکرد ارقام ذرت (Zea mays L.) شیرین و فوق شیرین در شرایط شور، آزمایشی به صورت کرت های خرد شده در قالب طرح پایه بلوک های کامل تصادفی با چهار تکرار انجام شد. کرتهای اصلی الگوی کشت در سه سطح شامل، کشت تک‌ردیفه و دو ردیفه روی پشته و کشت در کف جوی آبیاری و کرت های فرعی چهار رقم شامل دو رقم ذرت شیرین (Ksc403su, Merit) و دو رقم ذرت فوق شیرین (Basin و Obsession) بودند. نتایج نشان داد که الگوی کشت تأثیر معنی-داری بر ارتفاع بوته، ارتفاع بلال، طول و عرض برگ، تعداد ردیف دانه، تعداد دانه در ردیف، عملکرد دانه، شاخص برداشت و وزن هزار دانه داشت؛ در حالی که بر تعداد کل برگ، تعداد برگ بالای بلال اصلی، طول تاسل، قطر ساقه، زمان گرده افشانی، کاکل‌دهی، فاصله بین ظهور دانه گرده تا ظهورکاکل و عملکرد بیولوژیک تأثیر معنی داری نداشت. تأثیر رقم بر کلیه ویژگی های مورد مطالعه بجز تعداد برگ بالای بلال اصلی و قطر ساقه معنی دار شد. بیشترین عملکرد دانه و شاخص برداشت در رقم Obsession (به ترتیب برابر با 10 کیلو گرم و 39 درصد) و کمترین آنها در رقم Basin (به ترتیب برابر با 4 کیلو گرم و 20 درصد) مشاهده شد. نتایج حاکی از آن است که استفاده از روش کشت کف فارو برای ذرت شیرین و فوق شیرین در شرایط شور می تواند منجر به بهبود عملکرد شود.

Study of the Molecular Diversity of Internal Transcribed Spacer Region (ITS1.4) in Some Lettuce Genotypes

بهمن فاضلی نسب,براتعلی فاخری,زهرا جمعه قاسم آبادی
ايران ، پژوهشنامه اصلاح گیاهان زراعی ، سال : 2019 ، صفحات : 29-39، شاپا: 2228-6128 مقاله در مجله

چکیده

Lettuce is belong to the Cichorium family with leaf consumption, Annual cold weather plants and rich in minerals, vitamins and nutrients. The aim of the present study was to evaluate the genetic diversity of 15 varieties and lettuce populations using the ITS area. Sequence quality was evaluated using Chromas 2.1.1 software, aligned by MegAlign 5 software and then similarity matrix and dendrogram of phylogenic relationships of Lettuce sequences were conducted using Mega 6 software. Also, a comparison was conducted among the lettuce were used in this research and other plants of the Asteraceae genus family (presented on NCBI site). The numerical value of the ratio (dN/dS) was 0.015, which indicates a pure selection in the examined gene and has not caused any key changes. Cluster analysis split the different genotypes of lettuce into 3 groups and could not differentiate by geographical location but it could separate the lettuce of this research and other plants from different species of the Asteraceae family related by NCBI. Therefore, it can be concluded that ITS can be a suitable tool for genetic evaluations among genus and among species. The inability of ITS marker to separate the intra-species of populations it could be because dN/dS was less than and a small number of deletion and insertion sites (376 out of 1551 positions) indicating low variation between different genotypes and populations. Considering that the Initial origin of the plants is belong to the centers that are most diverse and because varzaneh Lettuce populations of Isfahan have the most varieties, as a result, it is necessary to pay more attention to the Varzaneh region of Isfahan to collection of lettuce germplasms for breeding programs.

Mapping QTLs of flag leaf morphological and physiological traits related to aluminum tolerance in wheat (Triticum aestivum L.)

Barat Ali Fakheri,,,Sirous Tahmasebi,Abbas Mirsoleimani
English , Physiology and Molecular Biology of Plants , Year : 2019 , Pages: 1-16, ISSN:0971-5894 Journal Paper

Abstract

Genetic improvement of aluminum (Al) tolerance is one of the cost-effective solutions to improve plant productivity in acidic soils around the world. This study was performed to progress our understanding of the genetic mechanisms of aluminum tolerance underlying wheat (Triticum aestivum L.) flag leaf morphological and physiological traits. A recombinant inbred line population derived from SeriM82 and Babax was used for mapping quantitative trait loci (QTL) in wheat for tolerance to Al toxicity through 477 DNA markers. Based on a singlelocus analysis, 48 QTLs including 16 putative and 32 suggestive QTLs were identified for all studied traits. Individual QTL explained 4.57–11.29% of the phenotypic variance in different environments during both the crop seasons. These QTLs located unevenly throughout the wheat genome. Among them, 52.08%, 29.17%, and 18.75% were in the A, B, and D genomes, respectively. Based on two-locus analysis, 54 additive QTLs and 6 pairs of epistatic effects were detected, among which 29 additive and 5 pairs of epistatic QTLs showed significant QTL 9 environment interactions. The highest number of stable QTLs was identified on genome A. Determining a number of QTL clusters indicated tight linkage or pleiotropy in the inheritance of different traits. The stable and major QTLs controlling traits in this research can be applied for verification in different environments and genetic backgrounds and identifying superior allelic variations in wheat to increase the performance of selection of high yielding lines adapted to Al stress in breeding programs.

بررسی برخی خصوصیات فیتوشیمیایی گیاه دارویی انزروت (Astragalus fasciculifolius Boiss.) در رویشگاه‌های طبیعی جنوب استان سیستان و بلوچستان

براتعلی فاخری,فاطمه نصرتی,محمود سلوکی,نفیسه مهدی نژاد,محرم ولی زاده
ايران ، تحقیقات گیاهان دارویی و معطر ایران ، سال : 2019 ، صفحات : 68-79، شاپا: 0905-1735 مقاله در مجله

چکیده

گیاه انزروت (Astragalus fasciculifolius Boiss.)، متعلق به خانواده بقولات (Fabaceae) از گیاهان دارویی است که در جنوب استان سیستان و بلوچستان پراکنش دارد و به‌دلیل ترکیب‌هایی مانند فنل‌ها، فلاونوئیدها و پلی‌ساکاریدها دارای نقش مؤثری در درمان بیماری‌های قلبی، سرطان، از بین بردن اثرهای شیمی درمانی و افزایش ایمنی می‌باشد. در این پژوهش نمونه‌های گیاهی هشت توده مختلف گیاه fasciculifolius .A از رویشگاه‌های مختلف استان سیستان و بلوچستان جمع‌آوری شده و برخی از خصوصیات فیتوشیمیایی ریشه، برگ (فنل کل، فلاونوئید کل و پلی‌ساکارید) و گل (فنل کل، فلاونوئید کل و آنتوسیانین) بررسی شد. نتایج تجزیه واریانس بیانگر اختلاف معنی‌داری بین رویشگاه‌های مختلف در سطح 0.01 می‌باشد. بررسی‌های فیتوشیمیایی وجود مقادیر قابل‌توجهی از ترکیب‌های فنلی را در برگ که بیشترین مقدار آن در منطقه پشت‌کوه (mg GAE/g 32.55-14.62)، ریشه که بیشترین مقدار آن در منطقه انجیرک (mg GAE/g 53.84-20.39) و گل که بیشترین مقدار آن را در منطقه بیرک (mg GAE/g 15.82-5.11) نشان داد؛ همچنین وجود ترکیب‌های فلاونوئیدی در برگ که بیشترین مقدار آن در منطقه ناهوک (mgQE/g 12.72-8.76)، در ریشه که بیشترین مقدار آن در منطقه پنج‌انگشت (mgQE/g 03/1-0.25) و گل که بیشترین مقدار آن در منطقه ناهوک (mgQE/g 9.28-6.35) وجود داشت مشاهده شد. همین‌طور این بررسی، ترکیب‌های پلی‌ساکاریدی را در برگ که بیشترین مقدار در منطقه انجیرک (mg/g 93.29-60.89) و ریشه که بیشترین مقدار در منطقه پنج‌انگشت (mg/g 209.38-94.33) و آنتوسیانین گل که بیشترین مقدار در منطقه پنج‌انگشت (mg SG/g 77.58-36.34) دیده شده بود، نشان داد. نتایج این تحقیق حکایت از توانایی رویشگاه‌های مختلف استان در مورد تولید ترکیب‌های با ارزش دارویی دارد. علاوه‌بر این بالا بودن ترکیب‌های فنلی و پلی‌ساکاریدی این گیاه توصیفی از توانمندی قابل توجه این گیاه در بکارگیری در صنایع دارویی و غذایی می‌باشد.

بررسی روابط بین عملکرد و اجزای آن در ژنوتیپهای مختلف سویا (Glycine Max L.) با استفاده از روشهای آماری چند متغیره

براتعلی فاخری,سینا قنبری,احمد نوشکام,نفیسه مهدی نژاد
ايران ، پژوهشنامه اصلاح گیاهان زراعی ، سال : 2019 ، صفحات : 85-92، شاپا: 2228-6128 مقاله در مجله

چکیده

به­ منظور بررسی ارتباط برخی از صفات مورفولوژیکی مهم با عملکرد دانه در سویا، 18 ژنوتیپ سویا در آزمایشی در قالب طرح پایه بلوک‌های کامل تصادفی با 3 تکرار مورد ارزیابی قرار گرفتند. نتایج تجزیه واریانس نشان داد که در تمام صفات مورد مطالعه بین ژنوتیپ‌ها اختلاف معنی‌داری وجود داشت. نتایج تجزیه همبستگی صفات نیز نشان داد که صفات عملکرد بیولوژیک (96/0)، شاخص برداشت (92/0) و تعداد شاخه فرعی (92/0) بیشترین همبستگی را با عملکرد دانه داشتند. در نتایج تجزیه به عامل‌ها نیز چهار عامل مستقل از هم، مجموعا 92/99 درصد از تغییرات کل داده‌ها را توجیه نمودند. عامل اول با 71/96 درصد از واریانس کل را توجیه نمود که به ­عنوان عامل عملکرد نام‌گذاری شد. مدل رگرسیون چند گانه با روش تجزیه رگرسیون گام­ به­ گام، برای عملکرد دانه نیز نشان داد که صفت تعداد شاخه فرعی وارد مدل شده و در کل 20/85 درصد از تغییرات عملکرد دانه را توجیه می‌کند. ضریب همبستگی این صفت 92/0 می‌باشد که در سطح آماری یک درصد معنی‌دار گردید. در نتیجه این صفت می‌تواند به ­عنوان شاخص ترین صفت در برنامه‌های اصلاحی سویا مورد استفاده قرار گیرد. همچنین با انجام تجزیه کلاستر ارقام سویا در 3 گروه قرار گرفتند.

Association mapping of morphological and physiological traits of flag leaf related to drought tolerance in barley

Barat Ali Fakheri,,Reza Aghnoum,,Reza Ataei,
Brazil , Revista de Agricultura Neotropical , Year : 2019 , Pages: 7-18, ISSN:2358-6303 Journal Paper

Abstract

Association mapping (AM) has proven to be a powerful approach for dissecting the genetic basis of complex traits. In this study, Quantitative Trait Loci (QTLs) controlling flag leaf characteristics under drought stress were detected in a set of 148 modern spring barley cultivars using AM analysis. Flag leaf length (FLL), flag leaf width (FLW), relative water content (RWC), chlorophyll content, and maximum quantum efficiency of PSII (Fv/Fm) which are important in photosynthetic rate, were evaluated under normal irrigation and drought stress conditions at grain filling stage. Population structure was estimated using Structure2.3 and linkage disequilibrium (LD) was estimated by the ‘Full Matrix LD’ using Tassel5.0. Significant marker/trait associations were investigated based on K-Q matrix using Tassel3.0. The analysis of population structure divided the cultivars into two sub-groups. Significant LD values (P < 0.01) between polymorphic sites with regions of high and low LD were observed. A total of 84 significant putative genomic regions were identified, which delineated into 37 QTLs under two water treatments. Two stable QTLs on 2H and 3H were detected for FLL in drought stress treatment. A QTL for FLL were detected on 2H in normal treatment, which alone explained around 11% of phenotypic variance of FLL. This QTL was also associated with the expression of FLW and explained around 7.5% of phenotypic variance. The results suggest that major loci are located on chromosomes 2H, 3H, 4H and 5H involved in the development of flag leaf characteristics and could be used as selection criteria in barley breeding for drought tolerance

ارزیابی کیفیت و خصوصیات فیزیکوشیمیایی روغن کرچک (Ricinus communis L) در ارقام وحشی و مقایسه آن‌ها با رقم زراعی

Mohammad Ali Najafi,,Barat Ali Fakheri,علی اشرف جعفری
IRAN , علوم و صنایع غذایی ایران - انجمن علوم و صنایع غذایی ایران , Year : 2017 , Pages: 131-140, ISSN:2008-8787 Journal Paper

Abstract

یکی از گیاهان دارویی مورد استفاده در صنایع داروسازی، آرایشی و بهداشتی کشورهای توسعه یافته است. (Ricinus communis L.) کرچک روغن استخراجی از این گیاه از با ارزشترین مواد مسهل و ملین در پزشکی است. همچنین از روغن آن به عنوان سوخت بیودیزل استفاده میشود. در این تحقیق کمیت، کیفیت و خصوصیات فیزیکوشیمیایی روغن کرچک وحشی و مقایسه آن با رقم زراعی در منطقه بروجرد مورد مطالعه قرار گرفته 68 (بر حسب گرم ید مصرفی به ازای 100 گرم)، عدد - 49 درصد (وزنی/وزنی)، عدد یدی 85 -61/ است. در نمونههای آنالیز شده محتوای روغن 7 1 (برحسب میلی گرم سود مصرفی به ازای /9-4/ 1 ، اسیدیته 5 /4771 -1/ 0 (برحسب درصد اولئیک اسید)، ضریب شکست 4779 /36-0/ اسیدی 90 86 %) نیز به روش گاز /1-90/ 1 درصد تعیین گردید. مقدار ریسینولئیک اسید نمونه های روغن (وزنی/وزنی 4 /78-3/ هرگرم روغن) و خاکستر 6 کروماتوگرافی محاسبه گردید. مقدار روغن کرچک ارقام مورد بررسی از نظر تمامی صفات در سطح 5% اختلاف معنیدار نشان دادند. از لحاظ محتوای روغن، رقم 1161 (همدان) دارای بیشترین عملکرد بود. بنابراین با توجه به نتایج بدست آمده، چنانچه هدف از کاشت این گیاه بالاترین عملکرد اقتصادی باشد ژنوتیپهای وحشی عملکرد بالاتری دارند و ژنوتیپ 1161 را میتوان برای منطقه بروجرد توصیه نمود. این تحقیق اولین گزارش از بررسی محتوای روغن و خصوصیات فیزیکوشیمیایی روغن استخراجی از دانههای کرچک وحشی جمعآوری شده در ایران و کشت شده در بروجرد و مقایسه آنها با رقم زراعی است.

Effect of drought stress on the morphology and antioxidant enzymes activity of Foeniculum vulgare cultivars in Sistan

Alireza Sirousmehr,,Barat Ali Fakheri,Saeed Shojaei
India , Indian Journal of Plant Physiology , Year : 2018 , Pages: 283-292, ISSN:2662-253X Journal Paper

Abstract

Abstract Plants respond to a variety of abiotic and biotic signals influencing their growth and development. Although the responses are different between plants, in case the growth of medicinal plant, yield production and responses to environmental stresses is right dependent on genotype. Foeniculum vulgare (fennel) is annual, biennial or perennial plant, belongs to Apiaceae family. In this study, effect of water stress was investigated among 10 different fennel genotypes in completely random blocks design during years 2012–2014. The plant height, biologic yield, thousand grain weight, ash percentage and activities of CAT, APX and GPX enzymes and proline content were evaluated and compared between genotypes. It was evident that Shiraz genotype occupied the highest level position in majority of traits such as CAT activity, thousand grain weights, biologic yield and proline content. The correlation analysis revealed that proline level had the highest correlation with the thousand grain weight. Based on the components analysis in the first year, four components have values greater than 1 and the first component alone explained 40% of the total variation. The CAT activity had the highest coefficient in the first component. In the second year, three components had values greater than 1 which the first component was explained 35% of variation and thousand grain weight showed the highest coefficient. Cluster analysis divided the parameters studied in the threegroups in both years. Biplot results showed that the Shiraz genotype was in the best position with respect to the first component and possess the highest yield production rate compared to other genotypes.

Evolutionary dynamics models in biometrical genetics supports QTL × environment interactions

Barat Ali Fakheri,
India , Journal of Genetics , Year : 2019 , Pages: 1-9, ISSN:0022-1333 Journal Paper

Abstract

Despite the ubiquitous occurrence of heat-shock protein 60 (Hsp60) and their role in maintenance of cell activity and integrity, this protein remains poorly characterized in many of the symbiotic soil mycorrhizal fungi such as Rhizophagus irregularis. Thus, in the current study, an attempt has been made to elucidate the evolutionary history, time of divergence followed by estimation of population genetic parameters of hsp60 using R. irregularis as a model organism. Sequence alignment reported here identified several close homologues for hsp60 (gene) and Hsp60 (protein) from diverse taxa, while the output from protein-based phylogenetic tree indicates that mitochondrial Hsp60 of R. irregularis shares close evolutionary relationship with classical α-proteobacteria. This is perhaps the first line of evidence elucidating the likelihood of hsp60 from fungal taxa sharing a close evolutionary relationship with classical α-proteobacteria as a common ancestor. Comprehensive analysis of mitochondrial hsp60 from selected fungal taxa from the evolutionary point of view explains the possibility of gene duplication and or horizontal gene transfer of this gene across various fungal species. Synteny relationships and population genetics credibly explain high genetic variability associated with fungal hsp60 presumably brought by random genetic recombination events. The results presented here also confirm a high level of genetic differentiation of hsp60 among all the three fungal populations analysed. In this context, the outcome of the current study, based on computational approach, stands as a testimony for explaining the possibility of increased genetic differentiation experienced by hsp60 of R. irregularis

ارزیابی پایداری نظام‌های تولید محصولات گلخانه ای در استان سیستان و بلوچستان

محمد رضا اصغری پور چمن,محمدرضا رفیعی,سید احمد قنبری,براتعلی فاخری
ايران ، اکو فیزیولوژی گیاهی ، سال : 2019 ، صفحات : 178-189، شاپا: 2008-5958 مقاله در مجله

چکیده

هدف از این تحقیق ارزیابی پایداری زراعی-بوم شناختی و اجتماعی-اقتصادی نظام‌های تولید گلخانه‌ای استان سیستان و بلوچستان است. داده‌های این مطالعه با استفاده از پرسشنامه از 400 گلخانه‌ در چهار اقلیم مختلف در سال 1393 جمع آوری شد. حجم نمونه مورد مطالعه از طریق فرمول کوکران محاسبه شد. چهار اقلیم مورد مطالعه شامل منطقه سیستان، زاهدان، مناطق میانی استان شامل شهرستان‌های میرجاوه، خاش و سراوان و مناطق جنوبی استان شامل شهرستان‌های ایرانشهر، نیکشهر و سرباز می‌باشند. میانگین امتیاز شاخص پایداری کل نظام گلخانه‌ای 8/59 بود. سکونت مالک در محل گلخانه و میزان تحصیلات مسئول فنی گلخانه به ترتیب با ضرایب رگرسیون 022/0، 292/1، 850/0، 004/0، 72/ و 94/1 بود. بررسی نقاط بحرانی نظام‌های گلخانه‌ای نشان داد، که برای بهبود پایداری آن‌ها مدیریت صحیح و اصولی گلخانه، به کار گرفتن نیروی فنی متخصص و استفاده از فناوری‌‌های نوین کشاورزی در جهت مکانیزه کردن گلخانه‌ها لازم است که در نهایت منجر به افزایش تولید و عملکرد محصولات گلخانه‌‌ای می‌شود.

Algal Communities: An Answer to Global Climate Change

Barat Ali Fakheri,,,شاهرخ قرنجیک,John Beardal,احمد طالبی
Germany , Clean - Soil Air Water , Year : 2018 , Pages: 1-14, ISSN:1863-0650 Journal Paper

Abstract

Human activities and resultant changes in global climate have profound consequences for ecosystems and economic and social systems, including those that are dependent upon marine systems. The increasing concentration of atmospheric greenhouse gases (GHGs) has resulted in gradual modification of multiple aspects of marine ecosystem properties such as salinity, temperature, and pH. It is well known that temporal and spatial variations in environmental properties determine the composition and abundance of different algal populations in a region. Within the present study the evidence for algal compatibility to changing environmental conditions is surveyed. The unique ability of algal communities to play a role in promotion of CO2 sequestration technologies, biorefinery approaches, as well as transition to CO2-neutral renewable energy has gained traction with environmentalists and economists in a view to mitigation of climate change using algae. The next step is to re-evaluate the assumption of a steady-state oceanic carbon cycle and the role of biological activities in response to future climate changes

QTL mapping of grain yield and its components under normal and drought stress conditions in barley (Hordeum vulgare L.)

Barat Ali Fakheri,,رضا اقنوم,,سید سعید پورداد,بهرام مسعودی
India , Indian Journal of Genetics , Year : 2018 , Pages: 0-0, ISSN:0019-5200 Journal Paper

Abstract

A population comprising of 118 double haploids of barley derived from a cross, Nure x Tremois was evaluated for different traits for yield and its components under normal and drought stress conditions. Using a genetic map of 543 markers (DArT, SSR, SNP and AFLP), we identified 33 additive quantitative traits loci (QTLs) for phenological and morphological traits. All of these Qtls had additive and digenic effects. Five out of 67 epistatic Qtls exhibited significant Q×T interactions. The majorities of main effects were detected on chromosome 5H and affected primarily plant height (PH), number of spikes /plant (Ns/P), kernels per spike (KS), thousand kernel weight (TKW), main spike length (MSL) and harvest index (HI). We identified additive QTLs for plant height on most the chromosomes, except 4H. Five pairs of epistatic QTLs for plant height without interaction with environments were also detected. However, we did not find any additive QTLs for grain yield, but detected nine epistatic QTLs on all of the barley chromosomes. None of them had interaction with environments.

Evaluation of agro-morphological traits related to grain yield of Iranian wheat genotypes in drought-stress and normal irrigation conditions

Barat Ali Fakheri,,Vahid Shariati,Khadijeh Razavi,,Elahe Tavakol,Hadi Darzi Ramandi,Mostafa Ghaderian
Australia , Australian Journal of Crop Science , Year : 2018 , Pages: 738-748, ISSN:1835-2693 Journal Paper

Abstract

In order to evaluate several agro-morphological traits in 30 bread wheat genotypes, an experiment, based on randomized complete block design with three replications, was carried out under drought-stress and normal irrigation conditions in two locations. The traits, including grain yield, biological yield, harvest index, spike features, and peduncle characters were evaluated. The result of the combined ANOVA revealed that location and genotype effects were significant for all of the traits. Stress had a significant difference for all of the traits, except for spike density and spikelet per spike. The simple correlation results for each condition were significantly different, indicating that the relationships among traits were significantly influenced by drought stress and location. Factor analysis, based on principal component analysis and varimax rotation in the Shahed field under irrigation regimes showed that four significant factors accounted for about 78.2% and 77.7% of the total variation among characters for normal irrigation and drought stress conditions, respectively. The cumulative variation at the NIGEB field was 62.7% for four factors under normal irrigation, and 84.8% for five factors under drought stress conditions. With respect to the achieved results, characters such as plant height, peduncle length, spike density, 1000-grain weight, harvest index, and biological yield had the highest communality and, consequently, provide a high relative contribution to wheat grain yield, and can be used as selective criteria in bread wheat breeding programs

GWAS analysis in spring barley (Hordeum vulgare L.) for morphological traits exposed to drought

Barat Ali Fakheri,,Reza Aghnoum,,Reza Ataei
USA , Plos One , Year : 2018 , Pages: 1-22, ISSN:1932-6203 Journal Paper

Abstract

Association analysis based on linkage disequilibrium has become a common and powerful approach for detection of QTLs underlying complex agronomic traits including drought tolerance. To determine marker/trait association, 148 modern European spring barley cultivars were evaluated under drought stress. Associations of morphological traits with AFLP/SSR markers were investigated based on the mixed linear model using the TASSEL3.0. Population structure was estimated using various methods including Bayesian clustering model by STRUCTURE software, PCoA analysis, NJ dendrogram and Hierarchical Clustering. Linkage disequilibrium patterns were explored among the whole genome and each chromosome separately. All the analysis for population structure divided the population into two subgroups. Linkage disequilibrium analysis showed that by increasing genetic distance, LD decreases. Totally, 167 significant marker trait associations were found which delineated into 65 QTLs in both treatments. Two stable QTLs on 5H at 86.880 cM were detected for Internode Length and on 3H at 126.421 cM for flag leaf length in drought stress treatment. Fourteen QTLs were co-localized with previously reported QTLs and others were novel. The results indicate that these putative genomic regions contain genes that have pleiotropic effects on morphological traits in drought condition

Effect of drought stress on the morphology and antioxidant enzymes activity of Foeniculum vulgare cultivars in Sistan

Barat Ali Fakheri,,Alireza Sirousmehr,Saeed Shojaei
India , Indian Journal of Plant physiology , Year : 2018 , Pages: 283-292, ISSN:0019-5502 Journal Paper

Abstract

Plants respond to a variety of abiotic and biotic signals influencing their growth and development. Although the responses are different between plants, in case the growth of medicinal plant, yield production and responses to environmental stresses is right dependent on genotype. Foeniculum vulgare (fennel) is annual, biennial or perennial plant, belongs to Apiaceae family. In this study, effect of water stress was investigated among 10 different fennel genotypes in completely random blocks design during years 2012–2014. The plant height, biologic yield, thousand grain weight, ash percentage and activities of CAT, APX and GPX enzymes and proline content were evaluated and compared between genotypes. It was evident that Shiraz genotype occupied the highest level position in majority of traits such as CAT activity, thousand grain weights, biologic yield and proline content. The correlation analysis revealed that proline level had the highest correlation with the thousand grain weight. Based on the components analysis in the first year, four components have values greater than 1 and the first component alone explained 40% of the total variation. The CAT activity had the highest coefficient in the first component. In the second year, three components had values greater than 1 which the first component was explained 35% of variation and thousand grain weight showed the highest coefficient. Cluster analysis divided the parameters studied in the threegroups in both years. Biplot results showed that the Shiraz genotype was in the best position with respect to the first component and possess the highest yield production rate compared to other genotypes

New protocol for the indirect regeneration of the Lilium ledebourii Bioss by using bulb explants

Barat Ali Fakheri,,Mohammad Reza Naghavi,
south korea , journal of plant biotechnology , Year : 2018 , Pages: 146-153, ISSN:1229-2818 Journal Paper

Abstract

Lilium ledebourii Bioss is a wild species of Lilium, which grows naturally in some provinces of Iran. Previous studies on Lilium tissue culture have been linked to direct regeneration and a few studies have been conducted on indirect regeneration, which has been studied under bright conditions. In this study, for the first time in the world, all the stages of indirect regeneration (callus induction, shoot and root induction) have been studied under dark conditions. Callus formation and the regeneration levels of L. Ledebourii Bioss were examined for three replicates in an MS (Murashige and Skoog) medium with different hormonal compositions and by using a factorial experiment in the framework of a completely random plan. For callus initiation, 2,4-D and kinetin hormones were used in five and four levels, respectively, as auxin and cytokinin. Results showed that the highest percentage of the callus was found in 3 μM of 2,4-D and 0.5 μM of kinetin. In terms of callus wet weight, the highest amount was found in 3 μM of 2,4-D and 0.5 μM of kinetin. In addition, in terms of diameter, the highest amount was found in 3 μM of 2,4-D, and 0.5 μM of kinetin. In summary, the 2,4-D hormone had a major impact on the percentage of regeneration increase so that the best response was related to the composition of 3 μM of 2,4-D, and 0.1 μM of kinetin. This study contended that auxin and cytokinin can induce long shoots and roots through cell elongation in dark condition

Evaluating phylogenetic relationships in the Lilium family using the ITS marker

Barat Ali Fakheri,,Mohammad Reza Naghavi,
south korea , journal of plant biotechnology , Year : 2018 , Pages: 236-241, ISSN:1229-2818 Journal Paper

Abstract

Lilium is a perennial bulbous plant belonging to the liriotypes genus. Our aim was to study the phylogenetic relationships of the Lilium family. Two varieties of Lilium ledebourii, 44 varieties of the gene bank, and one variety from the Tulipa family served as the out group. In order to study the diversity between lilium masses, ITS regions were used to design the marker. The results showed that the guanine base is the most abundant nucleotide. Relatively high conservation was observed in the ITS regions of the populations (0.653). Phylogenetic analysis showed that sargentiae and hybrid varieties are older than other varieties of the Lilium family. Also, the location of L. ledebourii varieties (Damash and Namin) was identified in a phylogenetic tree by using the ITS marker. Overall, our research showed that ITS molecular markers are very suitable for phylogenetic studies in the Lilium family

Mapping QTLs for physiological and biochemical traits related to grain yield under control and terminal heat stress conditions in bread wheat (Triticum aestivum L.)

Barat Ali Fakheri,,,,Bahram Masoudi
English , Physiology and Molecular Biology of Plants , Year : 2018 , Pages: 1231-1243, ISSN:0971-5894 Journal Paper

Abstract

In order to detect genomic regions with different effects for some of the physiological and biochemical traits of wheat, four experiments were conducted at Research Farm of Agricultural and Natural Resources Research Center of Zabol in 2015–2016 and 2016–2017 growing seasons. The experiments were carried out using four alpha lattice designs with two replications under non-stress and terminal heat stress conditions. Plant materials used in this study included 167 recombinant inbred lines and their parents (‘SeriM82’ and ‘Babax’). Six traits including grain yield (GY), proline content (PRO), water soluble carbohydrates (WSC), maximum efficiency of photosystem II (Fv/Fm), cytoplasmic membrane stability (CMS) and chlorophyll content (CHL) were evaluated. Genetic linkage map consisted of 211 AFLP marker, 120 SSR marker and 144 DArT markers with 1864 cm length and 4.4 cm mean distance. QTL analysis was carried out using a mixedmodel- based composite interval mapping (MCIM) method. By the combined analysis of normal phenotypic values, 27 additive QTLs and five pairs of epistatic effects were identified for studied traits, among which two additive and one epistatic QTL showed significant QTL 9 environment interactions. By the combined analysis of stress phenotypicvalues, a total of 26 QTLs with additive effects and 5 epistatic QTLs were detected, among which one additive and one epistatic QTL showed QTL 9 environment interactions. Six QTLs with major effects (QGY-2B, QGY- 2D, QPro-5B, QWSC-4A, QFv/Fm-6A and QCMS-4B), which were common between two conditions could be useful for marker-assisted selection (MAS) in order to develop heat tolerant and high-performance wheat varieties.

Assessment of Genetic Diversity for the Properties Related to the Quality of Hexaploid Bread Wheat (SeriM82 / Babax) under Drought Stress

Barat Ali Fakheri,,,Mohsen Ismail-Zadeh Moghadam,
India , Annual Research & Review in Biology , Year : 2018 , Pages: 1-12, ISSN:2347-565X Journal Paper

Abstract

In order to study the diversity of related characteristics of bakery quality in 167 bread wheat genotypes (SeriM82 / Babax), along with their parents, were evaluated based on two replications. The measured traits including protein content, zeolite sediment volume, bread volume, moisture content, grain hardness, water absorption, wet gluten, gluten index, gluten elasticity, Sodium dodecyl sulfate (SDS) sedimentation volume and quantitative trait of 1000 seed weight according to standards International. After analysis of variance, the data of the experiments and the comparison of the meanings were performed using multivariate methods, cluster analysis and factor analysis, genotyping grouping and the relationship between the variables (traits). The result of variance showed that genotype was significant for protein, bread volume, wet gluten, gluten index, sedimentation of sodium dodecyl sulfate and 1000 grain weight at 1% level. Factor analysis from 11 traits examined, 4 factors with 60% variance, the first factor with variance of 27.48% including traits of protein content, zeolite sediment volume, bread volume, moisture content and water absorption, the second factor with variance of 4.8% Includes wet gluten characteristics, gluten elasticity, SDS sedimentation volume, third factor with 10.16% variance, including seed hardness and gluten index, and fourth factor with variance of 9.85% of 1000 seed weight. The results of factor coefficient evaluation indicate the importance of protein content traits, zeolite sediment volume, bread volume, moisture content and water absorption in selection of suitable genotypes for drought conditions. Based on cluster analysis (intra-group variance algorithm), genotypes were divided into eight groups, the fifth group had high baking quality and could be used in breeding programs to improve the quality of baking.

اثر نظام های مختلف کودی زیستی، شیمیایی و تلفیقی بر رشد، عملکرد و اجزای عملکرد آفتابگردان(Helianthus annuus L.)

براتعلی فاخری,سیما آبیار,نفیسه مهدی نژاد,حسین گرگینی شبانکاره,مریم هراتی راد
ايران ، نشریه فیزیولوژی محیطی گیاهی ، سال : 2017 ، صفحات : 19-30، شاپا: 7671-2423 مقاله در مجله

چکیده

به منظور بررسی تأثیر کودهای زیستی، شیمیایی و تلفیقی بر رشد، عملکرد و اجز ای عملکرد آفتا بگردان،

Growth Analysis of Fenugreek (Trigonella foenum- graecum L.) under Various Levels of Nitrogen and Plant Density

براتعلی فاخری,لیلا بذرکارخطیبانی
ايران ، پژوهشهای زراعی ایران ، سال : 2018 ، صفحات : 747-760، شاپا: 2008-1472 مقاله در مجله

چکیده

به‌منظور بررسی اثر سطوح مختلف نیتروژن و تراکم بوته بر شاخص‌های فیزیولوژیک شنبلیله، آزمایشی مزرعه‌ای در سال زراعی ۹۱-۹۰ در استان گیلان (شهرستان شفت) به‌صورت کرت‌های خردشده در قالب بلوک‌های کامل تصادفی در چهار تکرار انجام شد. کود نیتروژن در چهار سطح (شاهد، ۲۵، ۵۰ و ۷۵ کیلوگرم نیتروژن خالص در هکتار) به‌عنوان عامل اصلی و تراکم بوته شامل (۶۰، ۸۰، ۱۰۰ و ۱۲۰ بوته در متر مربع) به‌عنوان عامل فرعی در نظر گرفته شد. نتایج نشان داد که شاخص‌های فیزیولوژیک تحت تأثیر تیمارهای مذکور قرار گرفتند. بالاترین شاخص سطح برگ با کاربرد ۵۰ کیلوگرم کود نیتروژن در هکتار و در تراکم ۱۲۰ بوته در متر مربع به‌دست آمد. بیشترین تجمع ماده خشک و سرعت رشد محصول مربوط به تیمار نیتروژن ۷۵ کیلوگرم در هکتار و تراکم ۱۲۰ بوته در متر مربع بود. حداکثر سرعت رشد نسبی پس از دریافت ۳/۲۹۴ درجه روز رشد در تیمار ۵۰ کیلوگرم نیتروژن در هکتار با تراکم ۸۰ بوته در متر مربع مشاهده شد.

Identification of genomic regions controlling physiological and morphological traits of bread wheat under terminal heat stress

براتعلی فاخری,فرامرز سهرابی چاه حسن,محمود سلوکی,نفیسه مهدی نژاد
ايران ، علوم گیاهان زراعی ایران ، سال : 2018 ، صفحات : 151-159، شاپا: 2008-4811 مقاله در مجله

چکیده

In order to identify genomic regions with main, epistatic, and QTL×environment interaction effects for some of the phenological and morphological traits in bread wheat, an experiment with 167 recombinant inbred lines and their parents (‘SeriM82’ and ‘Babax’) was conducted at Research Farm of the Agricultural Research Station of Sistan in 2015-16 cropping season. The experiment was carried out using two alpha lattice designs with two replications under non-stress and terminal heat stress conditions. Seven traits including days to maturity (DM), grain filling duration (GFD), maximum quantum efficiency of photosystemII (Fv/Fm), cytoplasmic membrane stability (CMS), grains per spike (GPS), grain yield (GY) and thousand grain weight (TGW) were measured. There were significant differences among the genotypes for all studied traits and maximum correlation was observed between GY and Fm/Fv (r = 0.86**). QTL analysis was conducted by Mixed-Model based composite interval mapping (MCIM) method. A total of 33 main-effect QTLs for studied traits were detected. Phenotypic variances explained by these QTLs varied from 7.04% for GFD to 19.41% for TGW. The major Qtgw7D (R2 = 19/41) was identified near the marker of acc/cat-10 and after validation can be used in marker-assisted selection (MAS) in order to produce heat tolerant wheat varieties

تأثیر سطوح نیتروژن و نیتروکسین بر ویژگی های رشدی و کمّی گاوزبان اروپایی (Borago officinalis L.) در شرایط زابل

براتعلی فاخری,سجاد شیخ پور,علیرضا سیروس مهر
ايران ، به زراعی کشاورزی ، سال : 2018 ، صفحات : 925-936، شاپا: 2008-8337 مقاله در مجله

چکیده

برای بررسی اثر وی ژگی های کمی گیاه دارویی گاوزبان اروپایی تحت تأثیر سطوح نیتروژن و نیتروکسین، آزمایشی به صورت کرت های 1391 درمزرعۀ تحقیقاتی دانشگاه زابل اجر ا شد . - خرد شده در قالب طرح بلوک های کامل تصادفی با سه تکرار درسال زراعی 1390 0 لیتر در هکتار / 100 و 150 کیلوگرم در هکتار) عامل کرت اصلی و نیتروکسین با سه سطح (صفر، 5 ، نیتروژن با چهار سطح (صفر، 50 0لیتر در هکتار بصورت محلول پاشی) عامل کرت فرعی لحاظ شدند. براساس نتایج به دست آمده، برهم کنش تیمارهای / تلقیح بذر و 5 مورد بررسی، اثر معناداری بر ارتفاع بوته، ارتفاع گل آذین، تعداد برگ، تعداد گل در بوته، تعداد ساقه های فرعی ، عملکرد خشک سرشاخه گلدار و عملکرد خشک بوتۀ گاوزبان داشتند. بیشترین ارتفاع بوته، ارتفاع گل آذین، تعداد برگ، تعداد گل، تعداد ساقه های فرعی، عملکرد خشک سرشاخۀ گلدار و عملکرد خشک بوته با مصرف 100 کیلوگرم نیتروژن در هکتار در شرایط تلقیح بذر با نیتروکسین و کمترین مقادیر نیز در شرایط عدم کاربرد نیتروژن و نیتروکسین حاصل شد. بیشترین عملکرد خشک سرشاخه گلدار و 9294 کیلوگرم در هکتار از کاربرد 100 کیلوگرم در هکتار نیتروژن در شرایط تلقیح بذر با نیتروکسین / 1168 و 01 / بوته به ترتیب با 11 به دست آمد که تقریباً 50 درصد افزایش نسبت به شاهد بود. در مجموع برای تولید گاوزبان در شرایط زابل استفاده از 100 کیلوگرم در هکتاراوره و تلقیح بذر با نیتروکسین، مناسب به نظر می رسد.

Evaluation of grain yield of recombinant inbred lines of bread wheat (Triticum aestivum L.) derived from SeriM82/Babax cross under drought stress conditions

براتعلی فاخری,سیدمحمدتقی طباطبایی مزرعه نو,محمود سلوکی,محسن اسماعیل زاده مقدم,نفیسه مهدی نژاد
ايران ، علوم زراعی ایران ، سال : 2018 ، صفحات : 270-283، شاپا: 1562-5540 مقاله در مجله

چکیده

To compare the grain yield potential of recombinant inbred lines of bread wheat derived from SeriM82/Babax,cross under drought stress conditions and also to study the relationship between grain yield and other related traits for the indirect selection of superior genotypes, 167 recombinant inbred lines of bread wheat along with their parental lines were evaluated using alpha-lattice design with two replication in two separate normal and drought stress conditions in Yazd Research Station in 2013-14 and 2014-2015 growing seasons. The results of combined analysis of variance showed significant differences among genotypes. High genetic variation was observed in all traits, indicating a high breeding value potential in this population which facilitate selection of superior lines with drough tolerance. Days to flowering had significant relationship with grain yield under drought stress conditions, and therefore, lines with shorter days to flowering could be selected for drought-prone envirnments. The results of stepwise regression analyisis as well as path coefficients analysis showed that 1000- gain weight and spike length were the most effective attributes in determininggrain yield, which can be used as selction criteria for indirect selection for grain yield in wheat breeding programs for drough prone environments. Consecuently due to the low heritability of grain yield, it could not be considered as a proper trait to select under drought stress condition and it’s better to use traits with high correlation with grain yield, e.g. number of grains, mean of grain weight and phonological sttributes of plant.

اثر منابع مختلف کود و سیستمهای خاکورزی متفاوت بر عملکرد ذرت دانهای و عناصر غذایی خاک

براتعلی فاخری,احمد قاسمی,سید احمد قنبری,حمیدرضا فنایی
ايران ، علوم آب و خاک ، سال : 2017 ، صفحات : 97-108، شاپا: ۲۴۷۶-۳۵۹۴ مقاله در مجله

چکیده

در راستای توسعه کشاورزی پایدار، آزمایشی شامل خاک‌ورزی به‌عنوان عامل اصلی در دو سیستم متداول (شخم و مخلوط کردن کود با خاک) و بی‌خاک‌‌ورزی (باقی گذاشتن بقایای کود سبز و کشت مستقیم ذرت) و منابع کود: T0: شاهد، T1: کود سبز جو بدون مصرف کود دامی و شیمیایی، T2: کود سبز جو همراه با مصرف کامل کود شیمیایی توصیه شده (NPK) به جو شامل اوره، سوپر فسفات تریپل و سولفات پتاسیم به‌ترتیب به میزان 165، 90، 75 کیلوگرم در هکتار، T3: کود سبز همراه دو سوم کود شیمیایی به جو و یک سوم باقیمانده به ذرت، T4: کود سبز همراه یک سوم کود شیمیایی به جو و دو سوم باقیمانده به ذرت، T5: کود سبز جو همراه مخلوط نصف کود دامی و شیمیایی و T6: کود سبز همراه 40 تن کود دامی به‌عنوان عامل فرعی به‌صورت کرت‌های یک بار خرد شده در قالب بلوک‌های کامل تصادفی با سه تکرار طی دو سال زراعی 92 و 93 در ایستگاه تحقیقات کشاورزی سیستان اجرا گردید. نتایج نشان داد که خاک‌ورزی متداول در مقایسه با بی‌خاک‌ورزی منجر به افزایش معنی‌دار عملکرد دانه، درصد نیتروژن، فسفر، پتاسیم و کربن آلی خاک شد. جرم مخصوص ظاهری و درصد رطوبت خاک در خاک‌ورزی متداول کاهش نشان داد. منابع کود (کودهای آلی و شیمیایی) باعث افزایش معنی‌دار کربن آلی، نیتروژن، فسفر، پتاسیم و درصد رطوبت خاک شدند. فاکتورهای pH و جرم مخصوص ظاهری خاک تحت تأثیر منابع کود کاهش نشان دادند. برهمکنش خاک‌ورزی در منابع کود نشان داد که در خاک‌ورزی متداول و تیمار T5 بالاترین عملکرد دانه ذرت با میانگین 8471 کیلوگرم در هکتار به‌دست آمد. براساس نتایج این آزمایش می‌توان گزارش کرد سیستم خاک‌ورزی متداول به‌همراه مخلوط نصف کود دامی، سبز و شیمیایی علاوه بر افزایش عملکرد دانه ذرت باعث افزایش نیتروژن، فسفر، پتاسیم، کربن آلی و بهبود جرم مخصوص ظاهری وpH خاک گردید.

تحلیل امرژی نظام کشت انگور یاقوتی سیستان

براتعلی فاخری,شیرعلی کوهکن,سید احمد قنبری,محمد رضا اصغری پور چمن
ايران ، خشکبوم ، سال : 2018 ، صفحات : 73-83، شاپا: 2008-790X مقاله در مجله

چکیده

این پژوهش با استفاده از رهیافت تحلیل امرژی برای ارزیابی جنبه های محیط زیستی تولید انگور یاقوتی سیستان که از مهترین محصولات باغی است اجرا شد. در این مطالعه تمام ورودی ها اعم از ورودی های تجدید پذیر شامل نور خورشید، باد و باران؛ تجدید ناپذیر شامل خاک؛ نهاده ها و خدمات خریداری شده شامل نیروی انسانی، کودهای شیمیایی نیتروژن، پتاسیم و فسفر و سموم شیمیایی برای تولید انگور یاقوتی مورد ارزیابی 43 درصد / 1/94 امژول خورشیدی که بیشترین امرژی مصرفی با 41 × قرار گرفت. نتایج مطالعه نشان داد کل امرژی تولید انگور یاقوتی برابر 1016 11 درصد بود. شاخص / 23 درصد و در رتبه سوم مربوط به مصرف نیتروژن با 32 / مربوط به نیروی کارگری و پس از آن مربوط به آب آبیاری با 16 2/ 0 و شاخص پایداری امرژی 42 / 3، نسبت بارگزاری بر محیط زیست 541 / 1، شاخص نسبت سرمایه گذاری امرژی 25 / نسبت عملکرد امرژی 31 حاصل گردید، که در مقایسه با گزارش های ارائه شده از سوی سایر محققین نشان دهنده پایداری نسبتا خوب و بار زیست محیطی کم این سیستم است. بنابراین، با افزایش کارایی مصرف انرژی از طریق بهینه نمودن مصرف نیروی کارگری، آب آبیاری و کود نیتروژن سیستم کشت انگور یاقوتی می تواند بعنوان الگوی مناسب در منطقه سیستان توصیه شود

اثر تنش خشکی بر میزان فعالیت آنزیم‌های آنتی‌اکسیدانی، محتوی پرولین و کربوهیدرات در برخی ژنوتیپ‌های گندم دوروم (L. Triticum turgidum) در مرحله گیاهچه‌ای

براتعلی فاخری,طاهره نعیمی,لیلا فهمیده
ايران ، پژوهشنامه اصلاح گیاهان زراعی ، سال : 2018 ، صفحات : 22-31، شاپا: 2228-6128 مقاله در مجله

چکیده

نش خشکی و تغییرات شرایط آب و هوایی، سبب خسارات و کاهش محصولات کشاورزی می‌شوند. گندم دوروم بعد از گندم نان و یا همگام با آن نقش اصلی را در تامین غذا دارد، از این رو شناخت ارقام مقاوم و متحمل به تنش یک ضرورت در آن است. در این آزمایش اثر سطوح مختلف تنش خشکی(5، 10، 15، 20 و 25 درصد ظرفیت زراعی) بر میزان فعالیت آنزیم‌های آنتی‌اکسیدانی شامل کاتالاز (CAT)، پلی فنل اکسیداز (PPO)، آسکوربات پراکسیداز (APX)، گایاکول پراکسیداز (GPX) و برخی رنگیزه‌های فتوسنتزی (کلروفیلa ، کلروفیلb ، کلروفیل کل و کارتنوئید) و همچنین برخی تنظیم‌کننده‌های اسمزی شامل پرولین و کربوهیدرات در ژنوتیپ‌های گندم دوروم (شبرنگ، بهرنگ، کرخه، آریا و دنا) بررسی شده است. این آزمایش به صورت فاکتوریل در قالب طرح بلوک‌های کامل تصادفی با سه تکرار در پژوهشکده زیست‌فناوری دانشگاه زابل انجام گردید. پس از کشت ارقام در گلدان، اعمال تنش خشکی در مرحله گیاهچه‌ای (چهار برگی) انجام و سپس صفات اندازه‌گیری شد. نتایج تجزیه واریانس نشان داد اثر ژنوتیپ، تنش خشکی و برهمکنش ژنوتیپ و تنش خشکی در سطح احتمال 1 و 5 درصد برای اکثر صفات مورد بررسی معنی‌دار شدند. اثر ژنوتیپ و تنش خشکی برای صفت مقدار آنزیم پلی فنل اکسیداز معنی‌دار نشد. سطح آبیاری 5 درصد ظرفیت زراعی بیشترین اثر را بر میزان فعالیت آنزیم‌های آنتی‌اکسیدانی و تنظیم‌کننده‌های اسمزی گذاشت. طبق یافته‌های این پژوهش مشخص شد در شرایط این آزمایش، ژنوتیپ‌های بهرنگ و کرخه بالاترین میانگین را از نظر میزان رنگیزه‌های فتوسنتزی و ژنوتیپ شبرنگ بیشترین میزان فعالیت آنزیم‌های آنتی‌اکسیدانی و همچنین ژنوتیپ کرخه بالاترین میزان محتوی پرولین و کربوهیدرات در بین سایر ژنوتیپ‌های مورد بررسی داشتند

تأثیر محلولپاشی منگنز بر صفات کمی و کیفی علوفه گیاه جوHordeum vulgare و رابطه بین آنها

براتعلی فاخری,نفیسه مهدی نژاد,محمود محمدخانی
ايران ، زراعت و اصلاح نباتات ایران ، سال : 2018 ، صفحات : 13-29، شاپا: 2008-8485 مقاله در مجله

چکیده

این تحقیق در مزرعه مرکز تحقیقات کشاورزی سیستان در سال زراعی 3131 34 بهصورت طرح آلفالاتیس با دو تکرار تحت دو شرایط - نرمال و محلولپاشی منگنز اجرا شد. محلولپاشی منگنز با غلظت یک کیلوگرم در هکتار در سه مرحله پنجهزنی، ساقهدهی و گلدهی بر روی 341 رقم جو بهاره انجام شد. نتایج نشان داد که در مراحل مختلف رشد، محلولپاشی منگنز موجب افزایش صفات کمی ارتفاع، وزن تر و خشک علوفه، تعداد پنجه در بوته، نسبت برگ به ساقه و کاهش صفت نسبت دانه به علوفه در مقایسه با تیمار نرمال گردید. محلولپاشی منگنز باعث افزایش صفات الیاف نامحلول در شوینده اسیدی و خنثی، پروتئین خام، فیبر خام و لیگنین شوینده اسیدی و همچنین کاهش صفات کیفی قابلیت هضم ماده خشک، هیدراتهای کربن محلول در آب و خاکستر خام در مقایسه با تیمار نرمال شد. ضرایب همبستگی ساده بین صفات نشان داد که بین کمیت و کیفیت علوفه رابطه معکوسی وجود داشت. در نتیجه عواملی که سبب افزایش کمیت علوفه می- گردند، کیفیت آن را کاهش میدهند و بالعکس. در ادامه با استفاده از تجزیه به عاملها، 34 متغیر در پنج عامل برای شرایط نرمال و چهار 57 درصد از تغییرات دادهها را توجیه کردند. نتایج / 13 و 11 / عامل برای شرایط محلولپاشی منگنز تعریف شدند که در مجموع به ترتیب 13 این تحقیق در مجموع قابلیت هضم ماده خشک، هیدراتهای کربن محلول در آب، الیاف نامحلول در شوینده اسیدی و خنثی را از پارامترهای خوراکی علوفه معرفی کرد که میتواند در کیفیت علوفه و میزان تغذیه حیوان از علوفه تأثیرگذار باشد.

Super-paramagnetic iron oxide nanoparticles (SPIONs): Greener synthesis using Stevia plant and evaluation of its antioxidant properties

Barat Ali Fakheri,MehrdadKhatami,Hajar Q.Alijani,,Masoomeh Heydarpour,Zeinab K.Farahani,Arif UllahKhan
English , Journal of Cleaner Production , Year : 2019 , Pages: 1171-1177, ISSN:0959-6526 Journal Paper

Abstract

The super-paramagnetic iron oxide nanoparticles (SPIONs) were synthesized using an environmentally friendly method. The SPIONs with mainly carbohydrate coatings were simply synthesized using a natural, zero calorie sweetener (Stevia) extract (as both reducing and stabilizing agents). The resulting SPIONs were characterized by X-ray diffraction (XRD), Field emission scanning electron microscopy (FESEM), High-resolution transmission electron microscopy (HRTEM), thermal gravimetric analysis (TGA), X-ray photoelectron spectroscopy (XPS), vibrating-sample magnetometer (VSM) and Zeta potential test. The SPIONs (smaller than 25 nm) are very stable due to bio-molecular coating because having a zeta potential of −41.1 mV creates opposing forces between nanoparticles and prevents them from gathering. The biogenic SPIONs were able to counteract the effects of oxidative metabolites as studied with the antioxidant activity with an IC50 of 65 μg/ml. This feature shows the capability of these nanoparticles in designing potential biomedical applications

نقشه یابی مکان های ژنی صفات کیفیت نانوایی گندم نان تحت تنش خشکی

براتعلی فاخری,سیدمحمدتقی طباطبایی مزرعه نو,محمود سلوکی,محسن اسماعیل زاده مقدم,نفیسه مهدی نژاد
ايران ، ژنتیک نوین ، سال : 2018 ، صفحات : 281-292، شاپا: 2008-4439 مقاله در مجله

چکیده

یکی از روش های نوین مورد استفاده در برنامه های اصلاحی در گیاهان شناسایی مکان های صفت کمی ) QTL ( در ژنوم به کمک نشانگرهای مولکولی است. به منظور شناسایی QTL برای صفات کیفیت نانوایی نظیر محتوای پروتئین، حجم رسوب زلنی، حجم نان، حجم رسوب SDS ، میزان جذب آب، درصد رطوبت، شاخص گلوتن، الاستیسیته گلوتن، گلوتن مرطوب، شاخص سختی دانه و وزن هزار دانه در گندم نان، یک جمعیت ژنتیکی متشکل از 961 لاین اینبرد نوترکیب ) RIL ) حاصل از تلاقی SeriM82 و Babax در رابطه با صفات فوق مورد ارزیابی قرار گرفت. برای شناسایی QTL از نقشه پیوستگی که با استفاده از 241 نشانگر AFLP 264 نشانگر ، DarT و 74 نشانگر SSR تهیه شده بود و شامل 21 گروه لینکاژی بود، استفاده شد. در مجموع سی QTL برای صفات مورد مطالعه در شرایط نرمال و تنش به دست آمد که سه QTL برای محتوای پروتئین، شش QTL جهت گلوتن مرطوب، دو QTL مربوط به حجم نان، دو QTL جهت حجم رسوب زلنی، شش QTL جهت وزن هزار دانه و سه QTL مربوط به شاخص گلوتن شناسایی شد؛ و واریانس فنوتیپی توجیه شده به وسیله این QTL 29 درصد متغیر بود و / 5 تا 47 / های شناسایی شده بین 50 LOD 6 قرار داشت. /52 – 2/ در دامنه 05 QTL های شناسایی شده بعد از اعتبارسنجی می توانند در برنامه های اصلاحی و گزینش به کمک نشانگر مورداستفاده قرار گیرند.

آت اکولوژی گونه دارویی انزروت (Astragalus fasciculifolius Bioss.)در برخی از رویشگاهای طبیعی جنوب استان سیستان و بلوچستان

براتعلی فاخری,فاطمه نصرتی,محمود سلوکی,نفیسه مهدی نژاد,محرم ولیزاده
ايران ، تحقیقات گیاهان دارویی و معطر ایران ، سال : 2018 ، صفحات : 662-671، شاپا: 0905-1735 مقاله در مجله

چکیده

توسعه و اجرایی شدن برنامههای اثربخش و مفید در راستای احیاء، حفاظت و بهرهبرداری مناسب از گونههای دارویی تنها با از خانواده بقولات )Astragalus fasciculifolius Bioss( شناسایی ویژگیهای گیاهی و اکولوژیکی میسر است. گیاه انزروت گونه دارویی ارزشمندی است که از نظر ترکیبهایی مانند ساپونینها، فلاونوییدها و پلیساکاریدها نقش مؤثری در )Fabaceae( درمان بیماریهای قلبی، بازدارندگی رشد سلولهای سرطانی و از بین بردن اثرات شیمی درمانی دارد. در این بررسی نقشه پراکندگی این گونه با استفاده از منابع موجود تهیه گردید. سپس خصوصیات اقلیمی، تجزیه فیزیکی و شیمیایی خاک، مراحل مختلف فنولوژیکی و گیاهان همراه در منطقه ثبت شد. نتایج این بررسی نشان داد این گیاه در شهرستانهای خاش، سراوان، سوران و مهرستان پراکنش دارد. پهنهبندی اقلیمی این مناطق در بلوچستان براساس ضریب خشکی دومارتن از نوع اقلیم خشک میباشد. متوسط میزان بارندگی 25 است. این گونه بهطور عمده در ارتفاع 1300 تا ºC سالیانه این رویشگاها 52 میلیمتر، رطوبت نسبی 20 % و دمای متوسط آن 1500 متر از سطح دریا، در دامنهها و عمدتاً در آبراههها در بستر رودخانههای فصلی و در تمامی جهات بهویژه جهت شمالی و شیب 0/56 تا dS/m 8، هدایت الکتریکی / 6 تا 23 / صفر تا 75 % پراکنش دارد. خاک رویشگاه عمدتاً دارای بافت شنی لومی با اسیدیته 73 50 % میباشد. انزروت گونهای مقاوم به خشکی است و در شرایط اقلیمی خشک با متوسط / 30 تا 62 / 1/06 و مقدار آهک 64 بارندگی سالیانه کمتر از 30 میلیمتر قادر به رویش است

تجزیه QTL برخی صفات فیزیولوژیک و بیوشیمیایی مرتبط با عملکرد دانه در گندم تحت شرایط تنش گرمای انتهای فصل

براتعلی فاخری,فرامرز سهرابی چاه حسن,محمود سلوکی,نفیسه مهدی نژاد
ايران ، تحقیقات غلات ، سال : 2018 ، صفحات : 519-531، شاپا: 2252-0163 مقاله در مجله

چکیده

به­منظور نقشه­یابی نواحی ژنومی اصلی و اپیستاتیک و برهمکنش آن­ها با محیط برای برخی صفات فیزیولوژیک و بیوشیمیایی گندم، آزمایشی در قالب دو طرح آلفا لاتیس با دو تکرار در دو شرایط نرمال و تنش گرمای انتهای فصل در مزرعه تحقیقاتی مرکز تحقیقات کشاورزی و منابع طبیعی سیستان در سال زراعی 95-1394 اجرا شد. مواد گیاهی آزمایش شامل 167 لاین خویش­آمیخته نوترکیب به­همراه والدین آن­ها ‘‘Babaxو‘SeriM82’بودند که در آن­ها صفات عملکرد دانه، محتوای پرولین برگ،کربوهیدرات­های محلول در آب، حداکثر کارایی فتوسیستمII، پایداری غشاء سیتوپلاسمی ومحتوای کلروفیل برگ اندازه­گیریشد. تجزیه QTLبه روش ترکیبی بر اساس مکان­یابی فاصله­ای مرکب (MCIM) برایهردو محیط به­طور هم­زمان انجام گرفت. اثر اصلی ژنوتیپ برای کلیه صفات مورد مطالعه معنی­دار بود و تفکیک متجاوز از والدین در دو جهت مثبت و منفی مشاهده شد. در تجزیه QTL به­طور هم­زمان برای دو محیط، درمجموع بیست و سه QTL اصلی مکان­یابی شد و برهمکنشQTL×محیط در پنج QTL اصلی معنی­دار شد.همچنین دو جفت QTLدارای اثر اپیستازی برای صفات مورد مطالعه شناسایی شد. اغلبQTL­های شناسایی شده از پایداری لازم برخوردار بودند و بنابراین می­توانند در گزینش به کمک نشانگر برای ایجاد ارقام پرمحصول و متحمل به گرما مورد استفاده قرار گیرند.

اثر سطوح مختلف اسید هیومیک بر شاخص های رشد و اسانس گیاه دارویی بادرنجبویه ( Melissa officinalis L.) تحت رژی مهای خشکی

براتعلی فاخری,فرنوش صبوری,حسین گرگینی,فریبا ساعدی
ثبت نشده ، ثبت نشده ، سال : 2018 ، صفحات : 166-0، شاپا: مقاله در مجله

چکیده

امروزه به دلیل مشکلات زیست محیطی توجه بیشتری به کودهای بیولوژیک شده است. این آزمایش به صورت فاکتوریل در قالب طرح کاملاً تصادفی با سه تکرار در گلخانه دانشگاه زابل اجرا شد. تیمارها شامل آبیاری در 100 )شاهد(، 75 و 50 درصد ظرفیت زراعی و محلول پاشی اسید هیومیک در سه سطح صفر، 200 و 400 میلی گرم در لیتر در نظر گرفته شد. بیشترین و کمترین ارتفاع بوته، وزن تر و خشک بوته، تعداد شاخه جانبی، قطر ساقه، وزن خشک و تر ریشه به ترتیب از آبیاری در حد ظرفیت زراعی )عدم تنش( و آبیاری در 50 درصد ظرفیت زراعی مشاهده شد. درحال یکه بیشترین درصد اسانس ) 31 / 0 درصد( از 50 درصد ظرفیت زراعی و عملکرد اسانس از 75 درصد ظرفیت زراعی به دست آمد. بیشترین مقدار ارتفاع بوته، وزن تر و خشک بوته، قطر ساقه، وزن خشک و تر ریشه در برهمکنش 400 میلی گرم در لیتر اسید هیومیک و آبیاری در حد ظرفیت زراعی )عدم تنش( حاصل شد. بالاترین درصد اسانس و عملکرد اسانس با کاربرد 400 میل یگرم اسید هیومیک در شرایط 50 درصد و 75 درصد ظرفیت زراعی به دست آمد. برهمکنش تیمار ها برای پارامتر تعداد شاخه جانبی اثر معن یدار نشد. صفات رشد رویشی )ارتفاع بوته، وزن تر و خشک بوته، تعداد شاخه جانبی و قطر ساقه( با افزایش سطح تنش کاهش و با افزایش سطح اسید هیومیک افزایش یافتند. ب هطور کلی نتایج حاکی از آن بود که محلول پاشی با اسید هیومیک توانست خسارات ناشی از تأثیر تنش خشکی را بر گیاه بادرنجبویه کاهش دهد.

اﺛﺮ ﻣﺪﯾﺮﯾﺖﻫﺎی ﻣﺨﺘﻠﻒ ﺧﺎکورزی ﺑﺮ ﮐﯿﻔﯿﺖ ﻋﻠﻮﻓﻪ و داﻧﻪ ذرت (Zea mays L.) ﺗﺤﺖ ﺗﺄﺛﯿﺮ ﻣﻨﺎﺑﻊ ﻣﺨﺘﻠﻒ ﮐﻮدﻫﺎی آﻟﯽ و ﺷﯿﻤﯿﺎﯾﯽ

براتعلی فاخری,احمد قاسمی,سید احمد قنبری,حمیدرضا فنایی
ايران ، بوم شناسی کشاورزی ، سال : 2018 ، صفحات : 490-503، شاپا: ۲۰۰۸-۷۷۱۳ مقاله در مجله

چکیده

در راستای توسعه کشاورزی پایدار، این آزمایش به¬صورت کرت‌های یک بار خرد شده در قالب طرح بلوک‌های کامل تصادفی با سه تکرار در مرکز تحقیقات کشاورزی و منابع طبیعی سیستان طی دو سال زراعی ۱۳۹۲ و ۱۳۹۳ اجرا گردید. تیمارها‌ی آزمایش شامل خاک‌ورزی به¬عنوان عامل اصلی در دو سیستم متداول ( شخم و مخلوط کردن کود با خاک) و بی‌خاک‌ورزی (باقی گذاشتن بقایای کود سبز بر سطح خاک و کشت مستقیم ذرت (Zea mays L.) و منابع کود: T۰: شاهد (بدون مصرف کود)،T۱: کود سبز جو (Hordeum vulgare L.) بدون مصرف کود دامی و شیمیایی، T۲: کود سبز با مصرف کامل کود شیمیایی توصیه شده (NPK) به جو شامل اوره، سوپر فسفات تریپل و سولفات پتاسیم به¬ترتیب به¬میزان ۱۶۵، ۹۰ و ۷۵ کیلوگرم در هکتار، T۳: کود سبز با دو سوم کود شیمیایی به جو و یک سوم باقی مانده به ذرت،T۴ : کود سبز با یک سوم کود شیمیایی به جو و دو سوم باقی مانده به ذرت،T۵ : کود سبز جو با مخلوط نصف کود دامی و شیمیایی و T۶: کود سبز با ۴۰ تن کود دامی به عنوان عامل فرعی بودند. زمان برگرداندن جو به خاک مرحله خوشه‌دهی بود. نتایج نشان داد که اختلاط کود با خاک در مقایسه با بی‌خاک‌ورزی منجر به افزایش عملکرد دانه، علوفه‌تر و خشک، میزان نیتروژن، پتاسیم، فسفر و خاکستر دانه و کاهش درصد الیاف نامحلول در شوینده خنثی (NDF)گردید. منابع کود آلی و شیمیایی باعث افزایش معنی‌دار عملکرد دانه، علوفه‌تر و خشک، میزان نیتروژن، پتاسیم، فسفر، روی و خاکستر دانه شدند، ولی بر درصد NDF روند کاهشی نشان دادند. برهمکنش سال در خاک‌ورزی در منبع کود نشان داد که بیشترین عملکرد دانه، علوفه‌تر و خشک در سال دوم در سیستم اختلاط کود با خاک و در منبع کود سبز جو با مخلوط نصف کود دامی و شیمیایی با میانگین عملکرد دانه و علوفه‌تر به¬ترتیب برابر ۴۰۰/۹ و ۱۵۱/۱۱۰ تن در هکتار حاصل شد. بر اساس نتایج مخلوط کود سبز با نصف کود دامی و شیمیایی همراه با اختلاط کود با خاک برای تولید کمی و کیفی دانه و علوفه ذرت مناسب می باشد.

تاثیر تنش خشکی و محلول پاشی نانو کلات آهن بر فعالیت آنزیم های آنتی اکسیدانی و عملکرد گل اکوتیپ های بابونه (Matricaria chamomilla L.)

براتعلی فاخری,حمیده آزادقوجه بیگلو,نفیسه مهدی نژاد,قاسم پرمون
ايران ، فرآیند و کارکرد گیاهی ، سال : 2018 ، صفحات : 223-237، شاپا: ۲۳۲۲-۲۷۲۷ مقاله در مجله

چکیده

به منظور ارزیابی فعالیت آنزیم­های آنتی­اکسیدانی و عملکرد گل ژنوتیپ­های بابونه تحت تنش رطوبتی و محلول‌پاشی نانو کلات آهن، آزمایشی به‌صورت فاکتوریل در قالب طرح پایه بلوک‌های کامل تصادفی با سه تکرار در گلخانه تحقیقاتی پژوهشکده دانشگاه زابل، در سال 1393 اجرا گردید. تیمار‌های آزمایشی شامل تنش خشکی در 2 سطح (شاهد یا 90 درصد ظرفیت زراعی و 70 درصد ظرفیت زراعی) و نانو کلات آهن در 2 سطح (شاهد و 2 میلی‌گرم بر لیتر) و 7 ژنوتیپ بابونه (اردستان، گچساران، نائین، خوزستان، کازرون، آلمان و مجارستان) بود. در این تحقیق میزان فعالیت آنزیم­های آنتی اکسیدانی (کاتالاز، پراکسیداز، آسکوربات پراکسیداز، گایاکول پراکسیداز، پلی­فنل اکسیداز و پروتئین کل) و عملکرد گل در بوته مورد ارزیابی قرار گرفت. نتایج نشان داد که تنش موجب افزایش فعالیت آنزیم، کاتالاز، در ژنوتیپ­های کازرون، خوزستان، نائین و آلمان، افزایش فعالیت آنزیم آسکوربات در همه ژنوتیپ­ها، گایاکول پراکسیداز در ژنوتیپ­های کازرون، خوزستان، نائین و آلمان و کاهش پروتئین کل در ژنوتیپ­های اردستان، گچساران و مجارستان و کاهش عملکرد گل در بوته در ژنوتیپ­های اردستان، خوزستان، نائین و مجارستان شد. کاربرد نانو کلات آهن نیز با کاهش تأثیرات مخرب تنش بر میزان آنزیم­های آنتی‌اکسیدانی تأثیرگذار بود که این تأثیرات در برخی ژنوتیپ­ها مثبت و در برخی دیگر منفی بود. به­طور کلی ژنوتیپ­های خوزستان و آلمان متحمل­ترین ژنوتیپ برای کشت در شرایط تنش می­باشند.

Evolutionary dynamics models in biometrical genetics support QTL×environment interactions

Barat Ali Fakheri,
XXIXth International Biometric Conference , Year : 2018 Conferance Paper

Abstract

Quantitative genes interact often in no additive pathways together and with environment. Development of QTL involves interactions between environmental and genetic factors. Discrete and continuous time models are used to study genotype×environment interactions evolution. Some scientists investigate the evolutionary biometrical genetics through phenotypic selection and genetic variances and covariances; others use QTL cartography (Fig. 7.2). QTL mapping (Fig. 7.2) consists of three parts. a) Phenotyping: the traits are measured; b) genotyping: the data based on the molecular markers are determined; c) Integrating a and b parts to detect QTL related to traits

مکانیابی QTL های اصلی و اپیستاتیک و اثر متقابل آنها با محیط برای عملکرد دانه و صفات مختلف در یک جمعیت لاین نوترکیب خویش آمیخته گندم تحت تنش آلومینیوم

براتعلی فاخری,سارا فرخ زاده,سیروس طهماسبی,نفیسه مهدی نژاد,عباس میرسلیمانی,کمال غلامیپور فرد
کنفرانس ملی پیشرفت های اخیر در مهندسی و علوم نوین ، سال : 2018 مقاله کنفرانسی

چکیده

بیشتر صفات مهم زراعی وراثت کمی دارند و به وسیله تعداد زیادی ژن یا QTL کنترل می شوند. هدف اصلی این پژوهش، شناسایی پارامترهای ژنتیکی شامل QTL های اصلی، QTL های اپیستاتیک و اثر متقابل آنها با محیط در کنترل ژنتیکی عملکرد دانه و صفات مرتبط با آن بود. داده های آزمایش از جمعیت لاین های خویش آمیخته نوترکیب گندم حاصل از تلاقی Seri M82 و Babax، طی دو سال زراعی (93-94 و 94-95) و تحت دو شرایط نرمال و تنش آلومینیوم جمع آوری شد. نقشه پیوستگی جمعیت با استفاده از 211 نشانگر AFLP؛ 144 نشانگر DArT و 120 نشانگر SSR تهیه گردید و سپس تجزیه QTL با استفاده از نرم افزار QTL-NETWORK انجام شد. در مجموع QTL70 اصلی برای 12 صفت مورد بررسی شناسایی شد. اثر متقابل QTL × محیط در QTL 31 اصلی معنی دار شد، به طوری که تنوع فنوتیپی توجیه شده توسط این اثر متقابل برای هر صفت از 0/02 تا 1/38 درصد متغیر بود. در بین QTL های اصلی با اثر افزایشی، QTL های وزن خوشه بر روی کروموزوم های 6A-a و 7D-a به ترتیب در موقعیت های 7/15 و 17/3 سانتی مورگان با QTL های وزن دانه در سنبله هممکان بودند. 15 جفت QTL با اثر اپیستازی شناسایی شد که 60 جایگاه ژنی در آنها دخیل بوده و 8 جفت QTL اپیستاتیک دارای اثر متقابل با محیط بودند. با توجه به معنیدار نشدن اثر متقابل QTL در محیط در اغلب QTLهای اصلی شناسایی شده برای صفات مختلف مورد بررسی در این پژوهش، نشان از پایداری این QTL ها داشته و میتوان با اعتماد بیشتری به بررسی دقیقتر و مکانیابی این QTL ها پرداخت تا بتوان بعد از تایید نشانگرهای همبسته با این QTL ها از آنها در برنامههای اصلاحی انتخاب به کمک نشانگر در جهت بهبود عملکرد و صفات مرتبط با آن در لاینهای جدید گندم تحت شرایط تنش آلومینیوم استفادهکرد.

A Benchmarking on Protein complex prediction methods

Abbasali Emamjomeh,جواد ظهیری,,اسما ایوزه,حسام سپاسی تهرانی,Barat Ali Fakheri
سومین کنفرانس علوم پروتئینی و پپتیدی , Year : 2018 Conferance Paper

Abstract

Many of biological mechanisms are carried out by protein complexes. Therefore, their detection can be very important to understand the protein functions and cell organization. Some of high-throughput experimental methods have provided significant amount of protein-protein interaction (PPI) data, which has in turn precursor to computational methods to explore complexes from physical interactions between proteins. In this article, we evaluate and compare some of these computational methods to determine the protein complexes from PPI networks. We discuss some of the challenges in the exact reconstruction of complexes. Also, various tools to evaluate PPI networks and some of the current high-throughput databases have been considered in this study. Protein complex prediction methods can complete experimental data from high- throughput techniques. Most of these methods are based on network models. However, these are challenges in prediction of some protein complexes which have sparse or small regions. Developing methods need more knowledge on integrated methods which use functional and topological properties. This article can be useful to benchmarking of some computational complex detection methods and tools but also provide new insight to improve precise of prediction tools.

شنبه

یکشنبه

دوشنبه

سه شنبه

چهارشنبه

پنجشنبه

  •    شماره تماس:_
  •    شماره داخلی:_
  •    نمابر:_
  •   پست الکترونیک:fakheri@uoz.ac.ir