سوابق علمی - اجرائی

سوابق تحصیلی

  • ثبت نشده فوق ليسانس

    مهندسی کشاورزی -علوم دامی(فیزیولوژی دام)

    دانشگاه اصفهان

  • ثبت نشده دکتری تخصصی

    علوم دامی

    دانشگاه فردوسي مشهد

مراتب علمی

  • استاديار1391

    گروه آموزشی علوم دامی

  • دانشيار1397

    گروه آموزشی علوم دامی

علاقه مندیها

رویدادها

مرتب سازی:

نمایش:

Evaluation of Environmental Effect on Baluchi Lamb Survival between Birth day and Weaning

غلامرضا داشاب,داوود علي ساقي,علي اصغر اسلمي نژاد,مهسا ضابطيان
ايران ، پژوهشهای علوم دامی ایران ، سال : ثبت نشده ، صفحات : 292-296، شاپا: 2008-3106 مقاله در مجله

چکیده

ANALYSIS OF GENETIC DIVERSITY AND STRUCTURE OF BALUCHI

ٖGholam reza dashab,علي اصغر اسلمي نژاد,محمد رضا نصيري,علي اسماعيلي زاده,داوود علي ساقي
Mexico , Tropical and Subtropical Agroecosystems , Year : ثبت نشده , Pages: 1055-1062, ISSN:1870-0462 Journal Paper

Abstract

QUANTITATIVE TRAIT LOCI FOR FLEECE TRAITS IN BALUCHI SHEEP

ٖGholam reza dashab,علي اصغر اسلمي نژاد,محمد رضا نصيري,علي اسماعيلي زاده,داوود علي ساقي
Mexico , Tropical and Subtropical Agroecosystems , Year : ثبت نشده , Pages: 445-455, ISSN:1870-0462 Journal Paper

Abstract

Comparison of linear mixed model analysis and genealogy-based haplotype clustering with a Bayesian approach for association mapping in a pedigreed population

ٖGholam reza dashab,محمد مهدي شريعتي
English , BMC Proceedings , Year : 2012 , Pages: 1-5, ISSN:1753-6561 Journal Paper

Abstract

Estimation of genetic parameters for growth traits in Baluchi sheep using Gompertz growth curve function

ٖGholam reza dashab,داوود علي ساقي,علي اسلمي نژاد,مجتبي طهمورث پور,حسين فرهنگ فر,محمد رضا نصيري
ثبت نشده , ثبت نشده , Year : 2012 , Pages: 889-892, ISSN: Journal Paper

Abstract

Identification of quantitative trait loci (QTL) for wool traits in Iranian Baluchi sheep

ٖGholam reza dashab,علي صغر اسلمي نژاد,محمد رضا نصيري,علي اسماعيلي زاده ,داوود علي ساقي
ثبت نشده , ثبت نشده , Year : 2012 , Pages: 81-87, ISSN: Journal Paper

Abstract

Molecular analysis of Calpastatin gene in Kermani sheep herds

غلامرضا داشاب,وحید بهرام پور,محمدرضا محمد آبادي,,امين باقي زاده
ايران ، علوم کشاورزی و منابع طبیعی ، سال : 2008 ، صفحات : 124-132، شاپا: 1028-3099 مقاله در مجله

چکیده

Wool Fiber Quality of Naeini Sheep

ٖGholam reza dashab,علي اكبر قره آغاجي,حسين موثق,محمد علي نيل فروشان
pakistan , PAKISTAN JOURNAL OF BIOLOGICAL SCIENCES , Year : 2006 , Pages: 270-276, ISSN:1028-8880 Journal Paper

Abstract

A Study on Some Physical Attributes of Naeini Sheep Wool for Textile Industry

ٖGholam reza dashab,محمد علي ادريس,علي اكبر قره آغاجي,محمد علي نيل فروشان,حسين موثق
ثبت نشده , ثبت نشده , Year : 2007 , Pages: 415-420, ISSN: Journal Paper

Abstract

Partial genome scan to map quantitative trait loci controlling body weight in baluchi sheep

غلامرضا داشاب,داوود علي ساقي,علي اصغر اسلمي نژاد,مجتبي طهمورث پور,محمدرضا نصيري
ايران ، پژوهش های آبخیزداری ، سال : ثبت نشده ، صفحات : 47-57، شاپا: 1019-9632 مقاله در مجله

چکیده

Analysis of Quantitative Trait Loci for Wool Traits in Baluchi Sheep

غلامرضا داشاب,علي اضغر اسلمي نژاد,محمد رضا نصيري,علي اسماعيل زاده
ثبت نشده ، ثبت نشده ، سال : 2013 ، صفحات : 539-552، شاپا: مقاله در مجله

چکیده

Quantitative trait loci affecting pre-weaning weights in Baluchi sheep

ٖGholam reza dashab
ثبت نشده , ثبت نشده , Year : 2013 , Pages: 394-397, ISSN: Journal Paper

Abstract

بررسي تنوع ژنتيكي چهار جايگاه ميكروساتلايت ILSTS و 45 LGB ،BMS1350 ،BMS در گوسفندان نژاد بلوچي

غلامرضا داشاب,رضا ولي زاده,محمد رضا نصيري,علي اصغر اسلمي نژاد,داوود علي ساقي,مريم قلي زاده
ثبت نشده ، ثبت نشده ، سال : ثبت نشده ، صفحات : 56-61، شاپا: مقاله در مجله

چکیده

مطالعه چندشكلي ژن ميواستاتين وتأثير آن بر صفات رشد در گوسفند لري

غلامرضا داشاب,فاطمه بهرام زاده,,محمد رکوعی,صادق عبداللهي
ايران ، پژوهشهای علوم دامی ایران ، سال : ثبت نشده ، صفحات : 374-380، شاپا: 2008-3106 مقاله در مجله

چکیده

استفاده از شبیه سازی تصادفی برای تعیین برنامۀ به گزینی مناسب در گاو نژاد سیستانی

غلامرضا داشاب,فاطمه میر,محمد رکوعی,هادی فرجی آروق
ايران ، تولیدات دامی ، سال : 2016 ، صفحات : 161-170، شاپا: 2009-6776 مقاله در مجله

چکیده

هدف از انجام تحقیق حاضر، کمک به طراحی برنامۀ به‏گزینی پایه برای گاوهای سیستانی با استفاده از شبیه‏سازی تصادفی بود. بدین‏منظور سه اندازۀ جمعیت (500، 1000، و 2000 رأس)، سه سطح تعداد گله (5، 10، و 20)، دو سطح شدت انتخاب (زیاد و کم)، و دو سطح روش آمیزش (تصادفی و حداقل هم‏تباری) با هم ترکیب و درمجموع 36 راهبرد در مدت 30 سال شبیه‏سازی مقایسه شد. نتایج نشان داد که اثر همۀ عوامل بر پیشرفت ژنتیکی سالانه برای شایستگی کل، پیشرفت ژنتیکی سالانۀ وزن تولد (به استثنای روش آمیزش و شدت انتخاب) و وزن یک‏سالگی، تغییر سالانۀ هم‏خونی (به استثنای تعداد گله)، فاصلۀ نسل (به استثنای روش آمیزش و شدت انتخاب)، و صحت انتخاب نرها و ماده‏ها معنی‏دار بود (01/0P<). پیشرفت ژنتیکی سالانه در حالت شدت انتخاب زیاد، اندازۀ جمعیت 2000، و تعداد گلۀ کم (5 گله) در مقایسه با شدت انتخاب کم، اندازۀ جمعیت 500، و تعداد گلۀ بیشتر (20 گله) به‌ترتیب 5/8، 2/93، و 38درصد بیشتر بود. در آمیزش با حداقل هم‏تباری باوجود کمتربودن پیشرفت ژنتیکی (11درصد)، افزایش سالانۀ هم‏خونی در مقایسه با آمیزش تصادفی کمتر بود. نتایج تحقیق نشان می‏دهد که در برنامه‏های به‏گزینی گاو سیستانی باید تعداد گلۀ کم، اندازۀ جمعیت بزرگ، و شدت انتخاب زیاد باشد و برای کنترل هم‏خونی جمعیت، آمیزش با روش حداقل هم‏تباری انجام گیرد.

پیش‌بینی مؤلفه‌های (کو)واریانس ژنتیکی فراسنجه‌های منحنی رشد در یک جمعیت آمیختۀ بلدرچین ژاپنی

هادی فرجی آروق,خدیجه ابراهیمی,غلامرضا داشاب,محمد رکوعی
ايران ، علوم دامی ایران ، سال : 2018 ، صفحات : 237-246، شاپا: 2008-4773 مقاله در مجله

چکیده

هدف از این بررسی، پیش¬بینی مؤلفه¬های (کو)واریانس و فراسنجه¬های ژنتیکی منحنی رشد در یک جمعیت آمیخته بلدرچین ژاپنی بود. برای این منظور، رکوردهای وزن بدن با منحنی گمپرتز برازش و فراسنجه¬های منحنی برآورد شد. با استفاده از این منحنی، وزن بلوغ (Wf)، وزن جوجه نوزاد یا هچ (W0)، شاخص بلوغ (K)، سن (ti) و وزن (Wi) در نقطه عطف و نرخ رشد در روزهای مختلف برای همه پرندگان پیش¬بینی شد. پیش¬بینی مؤلفه¬های (کو)واریانس و فراسنجه¬های ژنتیکی با استفاده از مدل حیوانی چند صفته با نمونه¬گیری گیبس انجام شد. وراثت¬پذیری فراسنجه¬های منحنی رشد شامل وزن بلوغ (Wf)، وزن جوجه نوزاد (W0)، شاخص بلوغ (K)، وزن و سن در نقطه عطف، به ترتیب برابر با ۳۳۵/۰، 269/۰، 273/۰، 291/۰ و 397/۰ پیش¬بینی شد. همچنین، وراثت¬پذیری صفات نرخ رشد دوره¬ای از نوزادی تا ۴۵ روزگی بالا و در دامنه بین 311/۰ و 424/0 محاسبه شد. همبستگی ژنتیکی وزن جوجه نوزاد با شاخص بلوغ و وزن بلوغ مثبت بود (۱۴/۰ و ۲۴/۰)، اما همبستگی ژنتیکی وزن جوجه نوزاد با سن و وزن در نقطه عطف منفی (۲۴/۰- و ۱۲/۰-) بود. همبستگی ژنتیکی شاخص بلوغ با وزن جوجه نوزاد، وزن بلوغ، سن و وزن در نقطه عطف منفی بودند. همبستگی ژنتیکی شاخص بلوغ با صفات نرخ رشد در سنین آغازین مثبت (برای صفات آخر دوره متوسط و منفی) پیش¬بینی شد. شاخص وزن در نقطه عطف، همبستگی ژنتیکی مثبت با بیشتر صفات نرخ رشد داشت و روند تغییرپذیری آن ها از آغاز تا پایان دوره رشد افزایشی بود.

برازش منحنی های رشد در آمیخته های دی آلل بلدرچین ژاپنی و مقایسه الگوهای رشد آمیخته ها

هادی فرجی آروق,خدیجه ابراهیمی,غلامرضا داشاب,محمد رکوعی
ايران ، پژوهش های تولیدات دامی ، سال : 2018 ، صفحات : 110-122، شاپا: 2251-8622 مقاله در مجله

چکیده

بخش قابل توجهی از عملکرد رشد در پرندگان نتیجه­ اثرات ترکیبی ژن­ها است که تغییرات آنها نیازمند طراحی یک سیستم مطلوب جفتگیری جهت استفاده از توانایی ترکیبی عام و خاص ژن­ها است. هدف از مطالعه حاضر بررسی الگوهای رشد ترکیبی چهار سویه مختلف بلدرچین ژاپنی در یک سیستم تلاقی دی آلل جزئی بود. برای این منظور، چهار سویه خالدار ایتالیایی (A)، تکسدو (B)، وحشی (C) و ای ام تگزاس (D) در یک طرح تلاقی دی­آلل کراس جزئی جهت تولید ترکیب­های ژنی مختلف در طی چهار نسل استفاده شد. چهار تابع گمپرتز، ریچارد، لجستیک و ویبول برای رکوردهای وزنی ترکیبات مختلف برازش شدند مناسب­ترین تابع برای هر ترکیب توسط معیارهای نکویی برازش انتخاب گردید. سپس فراسنجه ­های تابع و الگوهای رشد حاصل از مناسب­ترین تابع بین ترکیب­ها مورد مقایسه قرار گرفت. نتایج معیار­های برازش نکویی نشان داد که تابع گمپرتز مناسب­ترین تابع برای ترکیب­های دوتایی AB، BA، CD و DC و ترکیب­های برگشتی ABCD-DCBA، DCBA-ABCD و تابع ویبول مناسب ­ترین تابع برای ترکیب­ های چهارتایی ABCD و DCBA جهت توصیف رشد بودند. سال و ماه جوجه­ درآوری بر تمامی الگوهای رشد اثر معنی ­دار داشتند. همچنین، اثر ترکیب­­های مختلف ژنی بر وزن ابتدایی، وزن نهایی، سن و وزن در نقطه عطف و وزن یک­روزگی معنی­دار بود (05/0>p). اثر جنس پرنده به­جز در وزن نهایی ۴۵ روزگی در سایر فراسنجه‌های منحنی معنی­ دار نبود (۰۵/۰p>). ترکیب DC بالاترین وزن ابتدایی و نهایی، سن و وزن در نقطه عطف را نسبت به سایر ترکیب­ها داشت. ترکیب­ های چهار­تایی به­ خصوص ترکیب DCBA بالاترین وزن نهایی، وزن 45 روزگی و نرخ رشد 45 روزگی، اما پایین­ ترین نرخ بلوغ را داشت. سن و وزن در نقطه عطف ترکیب DCBAدر بین سایر ترکیب­ ها در حد متوسط بود و عملکرد بهتری نسبت به سایر آمیخته ­ها داشت که می­ تواند به­ دلیل بیشترین مقدار هتروزیس در این ترکیب باشد.

برآورد پارامترها و روند ژنتیکی برای صفات وزن بدن در سنین تولد تا یک‌سالگی گوسفند کردی خراسان شمالی

هادی فرجی آروق,محدثه نامور,غلامرضا داشاب,محمد رکوعی,داوود علی ساقی
ايران ، تولیدات دامی ، سال : 2017 ، صفحات : 281-298، شاپا: 2009-6776 مقاله در مجله

چکیده

این تحقیق با هدف مقایسه مدل­های مختلف برای برآورد پارامترهای ژنتیکی مستقیم و مادری و همچنین برآورد روند ژنتیکی برای صفات وزن بدن گوسفند کردی شمال خراسان انجام شد. از رکوردهای وزن تولد (7345 رکورد)، وزن سه (5905 رکورد)، شش (5294 رکورد)، نه (3800 رکورد) و یکسالگی (3863 رکورد) در طی سال­های 1368 تا 1391 که توسط مرکز اصلاح نژاد شهرستان شیروان جمع­آوری شده بود، استفاده گردید. برآورد پارامترهای ژنتیکی صفات مختلف با شش مدل دام و نرم­افزار ThrGibbsf90انجام گرفت. بهترین مدل با استفاده از معیار انحراف اطلاعات (DIC) انتخاب شد. وراثت­پذیری مستقیم صفات وزن تولد، سه، شش، نه و یکسالگی به ترتیب (0007/0±)172/0، (0007/0(±257/0، (0006/0(±351/0، (0007/0(±120/0 و (0009/0(±131/0 بودند.اثر ژنتیکی مادری برای صفات وزن تولد، سه و شش ماهگی معنی­دار بود (01/0P<) و نسبت واریانس محیط دائمی مادری به واریانس فنوتیپی از 055/0 (یکسالگی) تا 186/0 (تولد) متفاوت بود. اگر­چه مقادیر وراثت­پذیری مادری وزن بدن در سنین بیشتر از وزن تولد کمتر بود، ولی برازش اثرات تصادفی مادری (ژنتیک افزایشی و محیطی دائمی مادر) در مدل دام سبب برآورد دقیق­تر پارامترهای ژنتیکی صفات مورد بررسی گردید. روند فنوتیپی صفات وزن تولد، سه، شش، نه و یک سالگی به ترتیب 4/8، 6/74، 3/8، 3/54 و 25/78 گرم در سال و روند ژنتیکی مستقیم برای این صفات به ترتیب 07/0-، 2/14، 9/21-، 7/13 و 9/24 گرم در سال برآورد شد. بنابراین، نتایج برآوردهای بیزی نشان داد که قابل اعتمادتر از روش­های آماری مرسوم هستند.

اثر تزریق زرده تخم مرغ بومی خزک به زرده تخم مرغ سویه راس بر عملکرد، ایمنی و بیان ژنTLR4

مهدی وفای واله ,فرزانه بازماندگان شمیلی,غلامرضا داشاب,فرزاد باقرزاده کاسمانی
ايران ، تولیدات دامی ، سال : 2017 ، صفحات : 507-519، شاپا: 2009-6776 مقاله در مجله

چکیده

به منظور ارزیابی اثرات مادری بر تکوین سیستم ایمنی نتاج، اثر تزریق زرده تخم­مرغ­های بومی خزک به زرده تخم­مرغ­های سویه تجاری راس بر عملکرد، ایمنی و بیان ژن TLR4 در مرغ­های سویه تجاری راس تعیین شد. بدین منظور تعداد 150 عدد تخم­مرغ سویه راس به طور تصادفی به دو گروه آزمایشی 75 تایی که شامل گروه I (گروه شاهد - تزریق زرده سویه راس) و گروه II (تزریق زرده نژاد خزک) تقسیم و برای مدت سه هفته در در دستگاه جوجه کشی خوابانده و پس از هچ با جیره متوازن به مدت شش هفته پرورش داده شدند. سه پرنده به طور تصادفی در روزهای 27 و 42 انتخاب و کشتار شدند و وزن اندام‌های مؤثر در ایمنی (کبد، بورس و تیموس) اندازه‌گیری شدند. تیتر آنتی‌بادی علیه ویروس نیوکاسل و بیان نسبی ژن TLR4 در کبد نمونه‌های آزمایشی بررسی شد. تزریق زرده خزک به تخم­مرغ­های سویه راس سبب بهبود عملکرد رشد، پاسخ ایمنی و نیز سبب کاهش بیان ژن TLR4 در کبد جوجه‌ها در مقایسه با گروه شاهد شد (05/0P<). بر اساس نتایج این پژوهش ممکن است تزریق زرده تخم­مرغ های بومی خزک به تخم مرغ های سویه تجاری راس در روز اول جنینی، سبب بهبود کارائی سیستم ایمنی مرغان سویه راس در سنین بالاتر بشود.

ارزیابی مقایسه ای برخی توابع ریاضی در توصیف منحنی شیردهی گاوهای شیری ایران

هادی فرجی آروق,مریم آرین فر,محمد رکوعی,غلامرضا داشاب
ايران ، تولیدات دامی ، سال : 2018 ، صفحات : 351-363، شاپا: 2009-6776 مقاله در مجله

چکیده

هدف از این تحقیق، مقایسه برخی توابع غیرخطی (وود، دها­نوا، ویلمینک، علی- شفر، کاپیو­بورلینو، کوبی- لیدو، دایجکسترا، روک، گوس و نلدر) برای توصیف منحنی تولید شیر سه دورۀ شیردهی گاوهای هلشتاین ایران بود. به‌ترتیب از 6079976، 4879486 و 3312416 رکورد روزآزمون شیر 3550 گله مربوط به سه دورۀ شیردهی اول، دوم و سوم که بین سال­های 1362 تا 1396 توسط مرکز اصلاح نژاد دام کشور جمع‌آوری شده بود، استفاده گردید. میانگین رکوردهای روزآزمون برای این سه دوره به‌ترتیب 17/31، 08/34 و 83/33 کیلوگرم بود. جهت برازش توابع غیرخطی از بسته نرم­افزاری nlmeنرم­افزار R (نسخه 3.4.3) استفاده شد. توابع غیرخطی توسط چهار معیار نکویی برازش شامل معیار اطلاعات آکائیک (AIC)، معیار اطلاعات بیزی (BIC)، جذر میانگین مربعات خطا (RMSE) و شاخص دوربین- واتسون (DW) با هم مقایسه شدند. تابع روک نسبت به سایر توابع برازش بهتری از شکل منحنی استاندارد تولید شیر سه دورۀ اول شیردهی گاوهای هلشتاین ایران نشان داد. توابع گوس و روک بالاترین دقت را در پیش­بینی زمان رسیدن به اوج تولید، میزان تولید شیر در اوج و تداوم تولید شیر در دوره­های مختلف شیردهی نشان دادند امّا در کل، تابع روک قدرت پیش­بینی­ بالایی در برآورد توصیف­کننده­های منحنی تولید شیر داشت. بنابراین بهتر است جهت برازش منحنی تولید شیر گاوهای هلشتاین ایران از این تابع استفاده شود.

Estimation of additive and non-additive genetic variances of body weight in crossbreed populations of the Japanese quail

,ٖGholam reza dashab,,Mohammad Rokouei
USA , Poultry Science , Year : 2018 , Pages: 0-0, ISSN:0032-5791 Journal Paper

Abstract

A major part of the growth performance in birds is the result of the combined effects of genes, including the general and specific combining ability that requires the design of an optimal mating system. The aim of this study was to fit the best model for each body weight trait from hatch to 45 days and the estimation of the variance components and the genetic parameters for the body weight traits of a crossbred population. This crossbred population was created by 4 strains of Japanese quail, including the Italian Speckled (A), Tuxedo (B), Pharaoh (C), A&M Texas (D), and the body weights of the different combinations were analyzed by 24 models including the direct genetic effect, the non-additive genetic effects including dominance and epistatic effects, the maternal permanent environmental and maternal genetic effects. The selection of the best fit model of each trait was performed based on the deviance information criteria. The variance components were estimated using a single-trait animal model analyzed with Gibbs sampling. At the early stage of bird growth, maternal genetic and maternal permanent environmental effects had a considerable contribution to the best model, but the contribution of these effects reduced with an increase in the bird\\\'s age and the additive variance contribution increased. Adding non-additive genetic effects (dominance and epistasis) to the models significantly reduced the variance of the error and the additive genetic variance estimated with high accuracy. The estimated heritability of body weight traits for the body weights of hatch, 5, 10, 15, 20, 25, 30, 35, 40, and 45 d were 0.316, 0.170, 0.251, 0.153, 0.132, 0.164, 0.290, 0.425, 0.476, and 0.362, respectively. The ratio of maternal genetic and maternal permanent environmental was considerable especially on early age body weight but the ratio of dominance and epistatic variances on each of the body weight traits was less than 4.5% of the total variance, but led to a more accurate estimates of the direct additive genetic

پیش‌بینی مؤلفه‌های واریانس و فراسنجه‌های ژنتیکی صفات وزن بدن آمیخته‌های بلدرچین ژاپنی با در نظر گرفتن آثار ژنتیکی غیرافزایشی

هادی فرجی آروق,خدیجه ابراهیمی,غلامرضا داشاب,علی مقصودی,محمد رکوعی
ايران ، نشریه علوم دامی (پژوهش و سازندگی) ، سال : 2018 ، صفحات : 0-0، شاپا: 2588-6436 مقاله در مجله

چکیده

صفات رشد در پرندگان گوشتی از صفات مهم اقتصادی در برنامه¬های اصلاح نژادی هستند. بخش قابل توجهی از عملکرد رشد در پرندگان نتیجه¬ اثر ترکیبی ژن¬ها است، که بهره¬گیری از این اثرات ترکیبی نیازمند طراحی یک سیستم مطلوب جفت¬گیری جهت استفاده از قابلیت ترکیبی عام و خاص ژن¬ها می¬باشد. این مطالعه با هدف پیش¬بینی مؤلفه¬های واریانس و فراسنجه¬های ژنتیکی صفات وزن بدن در جمعیت آمیخته حاصل ازتلاقی دی آلل کراس چهار سویه بلدرچین با استفاده از مدل¬هایی شامل اثرات ژنتیکی افزایشی مستقیم و اثرات ژنتیکی غیرافزایشی انجام شد. برآورد مؤلفه¬های واریانس برای صفات وزن شامل وزن هچ، وزن¬های ۵، ۱۰، 15، 20، 25، 30، 35، 40 و 45 روزگی با مدل دام تک-صفتی مبتنی بر نمونه¬گیری گیبس انجام گرفت. نمونه¬گیری گیبس با ۱۵۰۰۰۰۰ سیکل، دور سوخته ۱۵۰۰۰۰ و فواصل ۱۰۰ انجام شد. وراثت-پذیری صفات فوق به ترتیب 655/۰، 276/۰، 201/۰، 022/۰، 053/۰، 04/۰، 129/۰، 087/۰، 417/۰ و 046/۰ برآورد شدند. در صفات وزن مربوط به سنین اولیه رشد، سهم اثرات ژنتیکی مستقیم کم بود و با افزایش سن پرنده به سهم واریانس افزایشی پرنده افزوده شد. افزودن اثرات ژنتیکی غیرافزایشی شامل غلبه و اپیستاتیک در مدل¬ باعث کاهش واریانس خطا و افزایش دقت برآوردهای واریانس ژنتیک افزایشی گردید. هرچند نسبت واریانس¬های غلبه و اپیستاتیک برای صفات وزن مورد بررسی کمتر از ۴ درصد واریانس کل بود، اما ورود این اثرات در مدل باعث گردید تا واریانس ژنتیکی افزایشی دقیق¬تر برآورد گردد.

Genomic Evaluation and Variance Component Estimation of Additive and Dominance Effects Using Single Nucleotide Polymorphism Markers in Heterogeneous Stock Mice

ٖGholam reza dashab,,Mehdi Vafaye Valleh,Mohammad Rokouei,مهدی سرگلزایی
check , Czech Journal of Animal Science , Year : 2018 , Pages: 492-506, ISSN:1212-1819 Journal Paper

Abstract

ABSTRACT Mahdavi M., Dashab G.R., Vafaye Valleh M., Rokouei M., Sargolzaei M.: (2018): Genomic evaluation and variance component estimation of additive and dominance effects using single nucleotide polymorphism markers in heterogeneous stock mice. Czech J. Anim. Sci., 63, 492–506. Exploration of genetic variance has mostly been limited to additive effects estimated using pedigree data and non-additive effects have been ignored. This study aimed to evaluate the performance of single nucleotide polymorphisms (SNPs) marker models in the mixed and orthogonal framework including both additive and nonadditive effects for estimating variances and genomic prediction in four diabetes-related traits in heterogeneous stock mice. Models have performed differently in detecting SNPs affecting traits. Dominance variances explained over 14.7 and 3.8% of genetic and phenotype variance in a Genomic prediction and variance component estimation method (GVCBLUP) framework. Reliabilities of additive Genomic best linear unbiased prediction model (GBLUP) in different traits ranged from 44.8 to 66.6%, for GVCBLUPs framework including both additive and dominance effects (MAD), and 46.1 to 69% for the model including additive effect (MA). Dominance GBLUP reliabilities ranged from 6 to 26.4% for MAD and from 22.5 to 50.5% in the model including dominance (MD). MA and MD had higher reliability for additive and dominance GBLUPs compared to MAD. Reliabilities of GBLUPs in MAD and MA for all traits were not significant except for growth slope (P < 0.01). In orthogonal framework models, epistasis variances accounted for a greater proportion (87.3, 89.1, 95.5, and 77.2%) of genetic variation for end weight, growth slope, body mass index, and body length, respectively. Heritability in a broad sense was estimated at 1.12, 1.67, 3.64, and 2.0%, in which non-additive heritability had a significant contribution. Genetic variances explained by dominance using GVCBLUPs were 16.8, 29.4, 14.6, and 14.9% for the traits. Generally, the non-additive models had a lower value of deviance information criterion (DIC) and performed better in estimating the variance component. Comparing the estimated variance by orthogonal framework models confirmed the results previously estimated by GVCBLUPs, with the difference that the estimates were shrinking. Following significant SNPs affecting diabetes-related traits by post-genome-wide studies could reveal unknown aspects and contribute to genetic control of the disease.

An Evolutionary and Phylogenetic Study of the BMP15 Gene

ٖGholam reza dashab,
IRAN , Iranian Journal of Applied Animal Science , Year : 2017 , Pages: 197-209, ISSN:2251-628X Journal Paper

Abstract

quencing technology have greatly increased our capacity to determine massive amounts of nucleotide se-quences. These sequences can be used to specify the characteristics of different regions, interpret the evolu-tionary relationships between categorized groups, likelihood of performing multiple comparisons between an unidentified sequence and millions of specified sequences existing in DNA information gene banks. This study focuses on bioinformatics analysis of molecular genetic variation of the BMP15 gene of some se-lected mammalian species with a view to providing relevant genetic information for breeding and selection programs in the studied species using computational methods. A total of twenty-three BMP15 nucleotide sequences and amino acids sequences were retrieved from the NCBI gene bank. Sequence alignment, pair and multi-alignment comparison of the BMP15 gene of the various species were done with MEGA6. High degree of polymorphism of the BMP15 gene was observed among the studied species. Despite high poly-morphism in BMP15 similarity between sequences was greater than 98% and differences existing in fertility rates among species may be species-specific due to differences in the processing of BMP15. The mean di-versity among populations and the scattering coefficient of evolution in the BMP15 position were calculated to be 2.15 and 1.25 bp, respectively and the mean divergence was calculated to be 1.7 bp. Also, the mean divergence within the species was 4.1, 0.4 and 2.1 bp in sheep, cows and goats, respectively. Bases substitu-tion rate and pattern in BMP15 showed that cows and goats have the minimum genetic distance and human has the maximum genetic distance with sheep. In addition to existing variation in DNA and amino acids sequences between BMP15 in different species, this study highlighted specific segments significantly more conserved in BMP15 from mono-ovulating as compared to super-ovulating species.

Comparison of two QTL mapping approaches based on Bayesian inference using high-dense SNPs markers

ٖGholam reza dashab
IRAN , Journal of Livestock Science and Technologies , Year : 2015 , Pages: 56-59, ISSN:2322-3553 Journal Paper

Abstract

To compare different QTL mapping methods, a population with genotypic and pheno-typic data was simulated. In Bayesian approach, all information of markers can be used along with combination of distributions of SNP markers. It is assumed that most of the markers (95%) have minor effects and a few numbers of markers (5%) exert major effects. The simulated population included a basic population of 1020 non-relative cattle that was continuously crossed for 4 genera-tions to make disequilibrium linkage among QTL position and markers. In all generations, 20 bulls were mated with 1,000 cows and each cow produced only one offspring. Whole tree family included 4100 head of livestock. Genotype of 10000 SNPs on 5 chromosomes at equal distance (0.05 cM) in the total population was simulated. The length of each chromosome was 100 cM. Simulated trait was milk production. Progeny of the first to third generation had record but the basic population and fourth generation of offspring did not have any record. Therefore, from the total population of 4100 heads, 3000 cattle had record. Two different models, Bayz A and Bayz B, were used to analyze QTL linked to the SNP markers. Analysis was conducted by BAYZ software. SNPs with more than 0.6 effect or Bayes factor (BF) greater than 5.5 were considered as QTL. The resultant analysis of two models of BAYZ A and BAYZ B were 7 and 9 QTL locations on 5 chromosomes, respectively. QTL position identified by BAYZ B method was matched on simulated location, but showed a false pos-itive on chromosome 4. QTL positions identified by BAYZ A method were located near by the sim-ulated positions, but with many false positive points.

تجزیه فیلوژنی و تکاملی بر مبنای توالی نوکلئوتیدی جایگاه ژن لپتین در شترهای منطقه سیستان و بلوچستان

غلامرضا داشاب,مجتبی پیری,بتول اصغری اسفدن
ايران ، پژوهشهای علوم دامی ایران ، سال : 2018 ، صفحات : 275-285، شاپا: 2008-3106 مقاله در مجله

چکیده

مطالعه بر روی حیوانات بومی می¬تواند به حفظ ساختار ژنتیکی جمعیت¬ها، پیاده نمودن برنامه¬های اصلاح نژادی و به‌دست آوردن اطلاعات در مورد ساختار ژنتیکی آن¬ها کمک کند. هدف از مطالعه حاضر بررسی توالی نوکلئوتیدی و آمینواسیدی ژن لپتین در شتر بومی استان سیستان و بلوچستان و مطالعات فیلوژنتیکی و مولکولی آن با سایر گونه¬های پستانداران بود. در این مطالعه نمونه¬های خون از 50 نفر شتر از سیاهرگ گردنی از دو گله واقع در زابل و منطقه دلگان بلوچستان گرفته شد. استخراجDNA از نمونه¬های خون کامل و تکثیر ناحیه اینترون دوم و اگزون سوم با طول تقریبی2۰00 جفت بازی جایگاه ژن لپتین با استفاده از یک جفت پرایمر اختصاصی صورت گرفت و محصول تکثیر شده با آنزیم برشی Asuhpi به دو قطعه ۱۴۰۰ و ۶۰۰ جفت بازی شکسته شده و در نهایت قطعات مذکور از روی ژل استخراج و تعیین توالی شدند. پس از برهم گذاری توالی قطعات مذکور یک قطعه ۱۹۴۰ جفت بازی با کمترین خطا جهت آنالیزهای بیوانفورماتیکی به‌دست آمد. همچنین، توالی نوکلئوتیدی ژن لپتین در سایر گونه¬های پستانداران با استفاده از ابزار BLAST در بانک¬های اطلاعاتی ژنوم حاصل شد. نتایج همترازی توالی¬های دو جمعیت مورد استفاده در منطقه زابل و بلوچستان تشابه 99 درصد را نشان داد، اما تفرق متمایز از سایر گونه¬های پستانداران داشت. تجزیه و تحلیل بیوانفورماتیکی توالی نوکلئوتیدی ژن لپتین بیانگر نسبت جایگزینی dn/ds برابر 76/0 در بین گونه¬های مختلف بود که نشان دهنده انتخاب خالص در طی تکامل این ژن است. نتایج درخت فیلوژنتیک بر اساس توالی نوکلئوتیدی نشان¬دهنده مسیرهای تکاملی مختلف ژن لپتین در گونه¬های مختلف، شامل هفت دسته از گونه¬ها شتر، (گاو، بوفالو وگاومیش)، (گوسفند و بز)، خوک، خفاش، گربه و پستانداران دریایی بود که شتر، گاو و پستانداران دریایی بیشترین قرابت را داشتند. با توجه به تنوع بسیار بالا در قطعه مورد مطالعه توالی جایگاه ژن لپتین و شاخص تکامل محاسبه شده به نظر می¬رسد اهلی شدن دام‌ها و انتخاب در صفات تولیدی شیر منجر به تغییراتی در توالی نوکلئوتیدی جایگاه ژن لپتین و تغییر نقش بیولوژیکی آن شده است.

مقایسه صحت برآورد ارزش‌های اصلاحی ژنومی صفات ایمنی با روش‌های مختلف بیزی

غلامرضا داشاب,بتول اصغری اسفدن
ايران ، ژنتیک نوین ، سال : 2018 ، صفحات : 235-246، شاپا: 2008-4439 مقاله در مجله

چکیده

هدف از این مطالعه ارزیابی صحت مکان‌‌‌‌‌‌یابی QTL و پیش‌بینی‌های ژنومی سه صفت ایمنی شامل تعداد سلول‌های B، CD4 و CD8 بر اساس دو روش آمای بیزی شامل بیز Cπ و لاسو و GBLUP بر روی ۱۰۹۴ موش هتروژنوس بود. داده‌های ژنوتیپی متشکل از ۱۰۹۴ حیوان با ۱۲۲۲۶ جایگاه‌های چندشکلی تک نوکلئوتیدی (SNPs) بر روی ۱۹ کروموزوم اتوزومی بعد از کنترل کیفیت داده‌های SNPs برای نرخ خوانش به ازای هر فرد و SNP و حداقل فراوانی آللی بودند. از هفت مدل آماری با در نظر گرفتن اثرات افزایشی و غالبیت نشانگرها و هم‌چنین آثار پلی‌ژنیک حیوان برای برآورد اثر SNPs و پیش‌بینی مؤلفه‌های واریانس استفاده شد. اثر SNPها با روش بنفرونی تصحیح شد و صحت برآورد ارزش‌های اصلاحی ژنومی با روش cross-validation ارزیابی شدند. مکان‌یابی نهایی جایگاه‌های کنترل کننده صفات کمی با هفت مدل و سه روش آماری برای سه صفت تعداد سلول‌های B، CD4 و CD8 به ترتیب ۱۰، ۶ و ۷ QTL را بر روی کروموزوم‌های ۱، ۳، ۵، ۷، ۸، ۹، ۱۲، ۱۴، ۱۶، ۱۷ و ۱۸ نشان داد. نتایج این مطالعه نشان داد که افزودن آثار افزایشی و غالبیت نشانگرها به همراه اثر پلی‌ژنیک حیوان منجر به افزایش صحت پیش‌بینی می‌شود. هم‌چنین، روش آماری نیز یکی از عامل‌های مؤثر در صحت پیش‌بینی‌های ژنومیک هستند. بالاترین پیش‌‌بینی ژنومیک برای تمام صفات مربوط به مدل ۷ و روش بیز لاسو بود. تفاوت بین روش‌های آماری مربوط به پس‌زمینه ژنتیکی و همچنین فرضیاتی است که برای میزان تنوع آثار نشانگرها در نظر گرفته می-شود.

مطالعه روابط تکاملی و فیلوژنتیکی ژن گلوتاتیون پراکسیداز- ۱ در جمعیتهای مرغ خزک و راس 3

غلامرضا داشاب,رخساره نجم الدینی,مهدی وفای واله ,نصراله مرادی کر
ايران ، تولیدات دامی ، سال : 2018 ، صفحات : 225-241، شاپا: 2009-6776 مقاله در مجله

چکیده

چکیده استرس گرمایی یکی از مهمترین عوامل استرسزای محیطی است که تولید طیور در دنیا به خصوص در مناطق گرم همانند استان سیستان و بلوچستان در ایران را با چالش همراه کرده است. استرس گرمایی موجب افزایش تولید رادیکالهای آزاد در بدن پرندگان میشود. گلوتاتیون پراکسیداز نقش مهمی به عنوان آنتیاکسیدان سلولی در استرس گرمایی ایفا میکند. هدف از انجام این در دو جمعیت راس ۳۰۸ و خزک بود. نمونههای خون از ۱۰ GPX- پژوهش، تجزیه تکاملی و فیلوژنتیک توالی نوکلئوتیدی 1 از DNA .) پرنده از دو جمعیت خزک و راس ۳۰۸ به طور تصادفی جمعآوری شد )پنج قطعه از خزک و پنج قطعه راس ۳۰۸ با استفاده از یک جفت پرایمر اختصاصی انجام گرفت. GPX- قطعه ۸۰۰ جفت بازی از 1 PCR خون کامل استخراج شد. تکثیر در مجموع نه هاپلوتیپ و ۱۳ ناحیه GPX- ارسال شد. همردیفی توالی قطعات 1 DNA سپس محصول تکثیر برای توالییابی متغیر را نمایان ساخت. از ۱۳ ناحیه چندشکل، پنج ناحیه جهشهای نقطهای بودند. ترسیم درخت فیلوژنتیک تشابه ژنتیکی بالایی را در بین دو جمعیت مورد مطالعه نشان داد، اما تفرق در درون جمعیتها نشان میدهد که امکان بهبود، تغییرات ژنتیکی و در GPX- افزایش مقاومت به استرسهای محیطی در نتیجه انتخاب وجود دارد. نتایج فاصله ژنتیکی و نواحی چندشکل 1 گونه های مختلف درخت فیلوژنتیک را تأیید نمودند. مطالعه فرآیندهای انتخاب مثبت نشان داد که انتخاب و تکامل نقش مهمی در فهم نقش زیستی این ژن دارند.

الگوی ترجیح کدونی در ژنهای متفاوت بیان شده بین دو زیر گونه گاو ( Bos indicus و Bos taurus )

غلامرضا داشاب,بتول اصغری اسفدن,حسین بنابازی
ايران ، ژنتیک نوین ، سال : 2018 ، صفحات : 19-30، شاپا: 2008-4439 مقاله در مجله

چکیده

امروز انتخاب گاوها با استفاده از اطلاعات ژنتیکی در سطح ترجمه ژنوم، ترانسکربپتوم و پروتئوم انجام می‌گیرد. در این راستا ارتباط زیادی بین الگوهای ترجیح کدونی در سطح ژنوم و میزان بیان ژن‌های موجود در سطح ژنوم است که این الگوها مرتبط بابیان و ترجمه ژن‌ها می‌باشند، این شاخص نتیجه تعادل بین عواملی ازجمله جهش، انتخاب طبیعی، محتوای GC و سطح بیان ژن به وجود می‌آید؛ که این اطلاعات در جهت بررسی روند تکاملی و تغییرات در ژنوم و پیش‌بینی سطوح بیان ژن در گونه‌ها مفید هستند. به‌هرحال اطلاعات محدودی در موردبررسی الگوی ترجیح کدونی در گاوسانان وجود دارد. در پژوهش حاضر، الگوی ترجیح کدونی بین دو جمعیت گاو هلشتاین و کلیستانی با استفاده از داده‌های ژن‌های بابیان متفاوت و ارتباط آن بابیان ژن ارزیابی می‌گردد. به این منظور، در این مطالعه از داده‌هایRNA-Seq مربوط به تجمیع 40 نمونه از گاو هلشتاین (Bos taurus) و 45 گاو ماده کلیستانی (Bos indicus) استفاده شد. درنهایت الگوی ترجیح کدونی بر اساس شاخص‌هایی ازجمله ENC، GC3S، CAI و GC برای ژن‌های بابیان متفاوت در بین این دو نژاد با استفاده از نرم‌افزار CODON W محاسبه گردید. هم‌چنین برای محاسبه همبستگی بین شاخص‌های مدنظر و رسم گراف‌های مربوطه از نرم‌افزار آماری 3.4.2 R استفاده شد. تجزیه‌وتحلیل ترجیح کدونی برای نواحی ORF ژن‌های بابیان متفاوت در دو نژاد هلشتاین و کلیستانی نشان داد که همبستگی بالایی بین مقادیر شاخص GC کل و GC3S وجود دارد که نشان‌دهنده تأثیر مقدار GC و جهش به‌عنوان عامل مهم در ایجاد کدون‌های مختلف ‌می‌باشد. همچنین، همبستگی بین شاخص ENC و GC3S نشان داد که جهش مهم‌ترین عامل در شکل‌گیری کدون‌ها بوده است. همبستگی بین شاخص CAI که عمدتاً برای پیش‌بینی سطوح بیان ژن به کار می-رود با شاخص ENC نشان‌دهنده ارتباط بین الگوی ترجیح کدونی و بیان ژن هستند. این اولین گزارش برای بررسی زیست‌شناسی کدون در بین دو نژاد هلشتاین و کلیستانی است که چنین اطلاعاتی نه‌تنها چشم‌انداز جدیدی برای درک مکانیسم‌های الگوی ترجیح کدونی به ارمغان می‌آورد، بلکه سرنخ‌های مفیدی را برای مهندسی ژنتیک مولکولی و مطالعات تکاملی ارائه می‌دهند.

تجزیه فیلوژنی و تکاملی توالی نوکلئوتیدی جایگاه ژن بتالاکتوگلوبولین

غلامرضا داشاب,بتول اصغری اسفدن
ايران ، تازه های بیوتکنولوژی سلولی مولکولی ، سال : 2018 ، صفحات : 61-69، شاپا: 2228-5458 مقاله در مجله

چکیده

سابقه و هدف: مطالعه حاضر به منظور آگاهی از روند تکاملی و مولکولی توالی نوکلئوتیدی جایگاه ژن بتالاکتوگلوبولین در پستانداران، آنالیز فیلوژنی و روند انتخاب طبیعی انجام گرفت. مواد و روش­ها: توالی نوکلئوتیدی جایگاه ژن بتالاکتوگلوبولین در گونه­ های مورد مطالعه از بانک اطلاعاتی ژنوم (NCBI) به دست آمده و هم­تراز شدند. درصد جانشینی و جایگزینی نوکلئوتیدها با روش حداکثر درست نمایی و همچنین ترسیم درخت فیلوژنتیک به روش Neighbor- Joining بدست آمدند. یافته ­ها: نتایج نشان داد جانشینی انتقالی بیشتر از جانشینی تقاطعی است و نسبت dN/dSبرابر70/0 محاسبه شد که نشان دهنده انتخاب خالص در طی تکامل این جایگاه ژنی است. نتایج درخت فیلوژنتیک نشان­دهنده مسیرهای تکاملی مختلف ژن بتالاکتوگلوبولین در گونه ­های مختلف شامل پنج دسته­ از گونه ­های (گاو، بوفالو وگاومیش)، (گوسفند و بز)، اسب و گراز وحشی بود که گاو، بوفالو و گوسفند بیشترین قرابت را داشتند. بحث: جهش و انتخاب در طی سالیان گذشته سبب به وجود آمدن پروتئین­های جدید، واریته­ های جدید و سبب تثبیت عملکرد آنها در طی روند تکامل و پیشرفت در جهت خالص­ سازی عملکرد آنها گردیده است. نتیجه گیری: بر اساس این تحقیق، نواحی حفاظت شده بخش اندکی از توالی ژن بتالاکتوگلوبولین را تشکیل می­دهد که این امر نشان دهنده چندشکلی بالای این ژن و همچنین مستعد بودن آن به تغییرات نوکلئوتیدی و جهش می­باشد.

بررسی چندشکلی ژن MEG9 و ارتباط آن با وزن تولد در گاو های سیستانی

غلامرضا داشاب,حسین اکبری,مهدی وفای واله
ايران ، پژوهش های تولیدات دامی ، سال : 2017 ، صفحات : 194-200، شاپا: 2251-8622 مقاله در مجله

چکیده

به منظور بررسی چند­شکلی ژن­ MEG9 و ارتباط آن­ با وزن تولد در گاوهای سیستانی، از تعداد 130 رأس گوساله (نر و ماده) مرکز به­گزینی گاو سیستانی به طور تصادفی خونگیری به عمل آمد. استخراج DNA از خون کامل به روش فنل-کلروفرم انجام شد. واکنش زنجیره­ای پلی­مراز (PCR) جهت تکثیر قطعه 210 جفت بازی واقع در اگزون 3 ژن مذکور با استفاده از آغازگرهای اختصاصی انجام شد. شناسایی جهش­ها با روش SSCP با الکتروفورز محصولات پی­سی­آر بر روی ژل پلی­آکریل­آمید 8 درصد و رنگ­آمیزی نیترات نقره انجام گرفت. به منظور بررسی ارتباط الگوهای شناسایی شده در جایگاه ژنی MEG9 با وزن تولد در گوساله­های گاو سیستانی از مدل­های ثابت خطی و مقایسه میانگین­ها با روش توکی-کرامر انجام گرفت. نتایج مطالعه در جایگاه ژنی MEG9 سه الگوی باندی (ژنوتیپ) q1، q2 و q3 را به ترتیب با فراوانی­های 37، 34 و 29 درصد نشان داد. مطالعه همبستگی الگوهای مشاهده شده در جایگاه ژنی MEG9با صفت وزن تولد معنی­دار بود (05/0P<). در نهایت، نتایج این مطالعه نشان داد که ژن MEG9 می­تواند یک نشانگر مولکولی مناسب جهت انتخاب وزن تولد در گاوهای سیستانی باشد.

تجزیۀ تبارزایی و تکاملی توالی نوکلئوتیدی جایگاه ژن FASN

غلامرضا داشاب,هاجر رضاخانی نژاد,مهدی وفای واله
ايران ، علوم دامی ایران ، سال : 2017 ، صفحات : 185-196، شاپا: 2008-4773 مقاله در مجله

چکیده

در این بررسی به‌منظور آگاهی از روند تکاملی و مولکولی توالی نوکلئوتیدی جایگاه ژن FASN در پستانداران شمار 38 رأس گاو هلشتاین شیری (18 رأس کم تولید و 20 رأس پر تولید) انتخاب و خون‌گیری از ورید دمی آن‌ها انجام شد. استخراج DNA از خون کامل به روش فنول-کلروفرم صورت گرفت. واکنش زنجیره­ای پلیمراز برای افزایش قطعۀ 750 جفت بازی واقع در ناحیۀ اگزون 37 تا 39 جایگاه ژن FASN با استفاده از جفت آغازگرهای اختصاصی انجام گرفت و محصول PCR تعیین توالی شدند. توالی نوکلئوتیدی جایگاه ژن FASN در جمعیت مورد بررسی با دیگر توالی­های DNA جایگاه یادشده در پستانداران بر پایۀ جستجو در بانک اطلاعاتی ژنگان یا ژنوم (NCBI) به‌دست‌آمده و هم­تراز شدند. درصد جانشینی و جایگزینی نوکلئوتیدها با استفاده از روش بیشترین درستنمایی و همچنین ترسیم درخت تبارزایی (فیلوژنتیک) و تعیین روند انتخاب طبیعی به روش اتصال-همسایگی NJ (Neighbor- Joining) و UPGMA با نرم‌افزارهای MEGA6 و Dnasp5.1 انجام گرفت. نتایج به‌دست‌آمده از بررسی‌های داده‌های زیستی (بیوانفورماتیک) نشان داد، در درصد جانشینی در بازهای پورین بیشتر از بازهای پیریمیدین بود. میزان عددی نسبت جایگزینی dN/dS در مقایسۀ توالی جایگاه ژن FASN در بین دو گروه گاوهای شیری پر تولید و کم تولید و همچنین در مقایسه با دیگر گونه­ها به ترتیب برابر با 16/1 و 12/1 محاسبه شدند که نشان‌دهندۀ انتخاب مثبت در فرآیند تکامل این ژن است. درخت تبارزایی برای ژن یادشده در موجودهای مختلف نشان داد، که در دستۀ پستانداران بوفالو و گاومیش، گربه و یوزپلنگ خویشاوندی بیشتری دارند (98%، 57%). نتایج نشان می­دهد، تفرق و انتخاب در طی سالیان متمادی سبب به وجود آمدن رقم­های جدید، پروتئین­های جدید و از سویی سبب تثبیت عملکرد آن‌ها در طی روند تکامل و پیشرفت در جهت خالص­سازی عملکرد آن‌ها شده است.

چند‌شکلی تک‌نوکلئوتیدی ناحیه پروموتور ژن ‏TFAM‏ و ارتباط آن با صفات رشد در ‏گاو سیستانی

غلامرضا داشاب,حسین مرادقلی,مهدی وفای واله
ايران ، نشریه علوم دامی (پژوهش و سازندگی) ، سال : 2017 ، صفحات : 0-0، شاپا: 2588-6436 مقاله در مجله

چکیده

گاو سیستانی نژاد گوشتی و از ذخایر ژنتیکی با‌ارزش کشور است که از لحاظ تولید گوشت، کمیت و ‏کیفیت لاشه و بازده غذایی مناسب است. در پژوهش حاضر‎ ‎به‎ ‎منظور‎ ‎بررسی‎ ‎چند‌شکلی ژن ‏TFAM‏ ‏‏(‏Mitochondrial transcription factor A‏) با استفاده از ‏PCR-RFLP، از 150 رأس‏ گاو سیستانی به‎ ‎صورت‎ ‎تصادفی‎ ‎و‎ ‎انفرادی خونگیری از ورید گردنی انجام گرفت. سپس نمونه‌‌های‎ ‎خون‎ ‎دام‌ها‎ ‎با‎ ‎روش ‏شستشوی نمکی بهینه شده استخراج‎ ‎وکیفیت‎ ‎آنها با الکتروفورز ژل آگارز 1 درصد بررسی گردید. ناحیه ‏پروموتور جایگاه ‏TFAM‏ به طول ‏bp‏801 با روشPCR ‎‏ تکثیر و محصول ‏PCR‏ توسط آنزیمBsuRI ‎‏ برش‎ ‎داده‎ ‎شد. محصولات‎ ‎هضم‎ ‎شده‎ ‎توسط‎ ‎الکتروفورز‎ ‎با‎ ‎ژل‎ ‎آگارز‎ ‎‏3 درصد و‎ ‎رنگ‎ ‎آمیزی‎ ‎اتیدیوم‎ ‎بروماید ‏نمایان‌سازی گردید. با توجه به این که آنزیم برشی مذکور در قطعه تکثیر شده دارای چندین سایت برشی ‏می‌باشد، نتایج‎ ‎الگوی هضمی در حیوانات هموزیگوت (‏AA‏) سه باند با اندازه 152، 187 و 462‏‎ ‎جفت باز، ‏در حیوانات هموزیگوت (‏CC‏) چهار باند با اندازه 83، 104، 152 و 462 جفت باز و نهایتاً‏ در حیوانات ‏هتروزیگوت (‏AC‏) پنچ باند با اندازه‌های 83، 104، 152، 187 و 462 جفت باز مشاهده گردید. داده‌های‎ ‎آماری‎ ‎با‎ ‎استفاده نرم‎ ‎افزار ‏POPGENE3.2‎‏ مورد‎ ‎تجزیه‎ ‎و‎ ‎تحلیل‎ ‎قرار‎ ‎گرفت. جمعیت‎ ‎در جایگاه ‏TFAM‏ ‏انحراف از تعادل هاردی-‏‎ ‎واینبرگ را نشان داد(05/0>‏P‏). شاخص‎ ‎شانون(‏I‏)،‎ ‎شاخص‎ ‎نئی،‎ ‎هتروزیگوسیتی‏‎ ‎مشاهده‎ ‎شده‎ ‎و‎ ‎هتروزیگوسیتی‏‎ ‎مورد‎ ‎انتظار‎ ‎به‎ ‎ترتیب، 69، 49، 37، 50 درصد محاسبه‎ ‎شد. در مطالعه حاضر ‏ارتباط معنی‌داری بین ژنوتیپ‌های گاو سیستانی در جایگاه ژنTFAM ‎‏ با صفات رشد مشاهده نشد‎.‎

ارتباط چندشکلی ژن‌های GDF9 و BMP15 با صفت چند‌قلوزایی در بز مرخز

غلامرضا داشاب,اعظم خسروی زرندی,محمد رکوعی,مهدی وفای واله
ايران ، پژوهش های تولیدات دامی ، سال : 2016 ، صفحات : 0-0، شاپا: 2251-8622 مقاله در مجله

چکیده

چند‌قلوزایی یکی از مهم­ترین صفات اقتصادی در پرورش بز است، که علاوه بر تأثیر‌پذیری از ژن‌های کوچک اثر، تحت تأثیر ژن‌های با اثر بزرگ نیز می‌باشد. در دهه‌های اخیر مشخص شد که دو عضو متعلق به خانواده فاکتورهای رشد با منشأ اووسیتی به نام­هایGDF9 وBMP15 برای رشد فولیکولی و تخمک‌ریزی ضروری هستند. هدف از پژوهش حاضر مطلعه­ی چند شکلی در جایگاه­های ژنی GDF9 وBMP15 و ارتباط الگوهای ژنوتیپی شناسایی شده در جایگاه­های مذکور با میزان چندقلوزایی است. نمونه خون از تعداد 50 رأس بز مرخز به‌طور تصادفی گرفته شد و استخراج DNA با روش بهینه یافته نمکی انجام گرفت. واکنش زنجیره‌ای پلیمراز برای تکثیر قطعه 862 جفت بازی از اگزون 2 ژن BMP15 و قطعه 995 جفت بازی از اگزون 2 ژن GDF9 انجام گرفت. محصولات PCR پس از هضم توسط آنزیم Hinf1 برروی ژل آگارز 3 درصد الکتروفورز و بر اساس الگوی باندی مشاهده شده ژنوتیپ دام­ها تعیین شد. در جایگاه BMP15 دو الل B و b با فراوانی­های به­‌ترتیب 96/0 و 04/0 و ژنوتیپ‌های BB، Bb و bb به­‌ترتیب با فراوانی­های 94/0، 04/0 و 02/0 مشاهده شد. هم­چنین، در جایگاه GDF9 فراوانی آلل‌های A و a به‌‌ترتیب 68/0 و 32/0 و فراوانی ژنوتیپ‌های AA، Aa و aa به‌ترتیب 60/0، 16/0 و 24/0 برآورد شد. شاخص نئی، PIC و هتروزایگوسیتی مورد انتظار در ژن BMP15 به‌ترتیب 47/0، 077/0 و 08/0 و در ژن GDF9 به‌ترتیب 34/0، 4/0 و 43/0 محاسبه شد. هم­چنین، ‌نتایج بررسی ارتباط الگوهای ژنوتیپی جایگاه‌های ژنی GDF9 وBMP15 و اثرات متقابل آنها بر صفت دوقلوزایی معنی‌دار بودند، بنابراین، می­توان نتیجه گرفت هر چند دو جایگاه ژنی GDF9 و BMP15 تنوع متوسط و پایین دارند، اما نقش مهمی در دوقلوزایی ایفا می­نمایند. لذا اطلاعات موجود می­تواند در برنامه‌های انتخاب برای افزایش دوقلوزایی در بز نژاد مرخز سودمند باشد.

ارزیابی ژنتیکی صفت بقاء در گوسفند بلوچی با روش نمونه برداری گیبس

غلامرضا داشاب,علی وجدان حسن کیاده,محمد رکوعی,احمدرضا سیدعلیان
ايران ، علوم دامی ایران ، سال : 2016 ، صفحات : 453-461، شاپا: 2008-4773 مقاله در مجله

چکیده

هدف از این پژوهش برآورد روند و فراسنجه‌های ژنتیکی صفت بقاء در گوسفند بلوچی است. در این پژوهش از رکوردهای بقاء 27978 رأس گوسفند بلوچی مرکز اصلاح نژاد دام کشور، در سال‌های 1358 تا 1388 استفاده شد. صفات موردبررسی شامل صفت بقاء از 1 تا 400 روزگی و بقاء از یک‌روزگی تا تاریخ حذف یا تا آخرین تاریخ ثبت شده بود. فراسنجه‌های ژنتیکی با دو مدل حیوانی (با و بدون محیط دائم مادری) با توجه به داده­های سانسورشدۀ راست و توزیع احتمال نمایی به روش نمونه­برداری گیبس برآورد شد. عامل‌های ثابت مؤثر بر صفت بقاء در مدل حیوانی شامل تأثیر سال و ماه تولد، جنس، نوع تولد و گله بودند. میانگین وراثت‌پذیری افزایشی برای صفات بقاء از 1 تا 400 روزگی و بقاء از یک‌روزگی تا آخرین تاریخ رکوردبرداری در مدل 1 و 2 به ترتیب در محدودۀ 135/0-159/0 و 085/0- 168/0 برآورد شد. میانگین نسبت واریانس محیط مشترک مادری محاسبه شده برای صفت بقاء از 1 تا 400 روزگی 076/0 و بقاء از یک‌روزگی تا آخرین تاریخ رکوردبرداری 144/0 محاسبه شد. روند ژنتیکی بقاء بر پایۀ دو معیار موردبررسی به ترتیب 0005/0-، 0001/0- به دست آمد که نزدیک به صفر بود. وراثت­پذیری برآوردشده نشان ­داد، که انتخاب ژنتیکی برای صفت بقاء می­تواند مؤثر باشد و با توجه به اهمیت این صفت در سودآوری، بهتر است در برنامه‌های اصلاح نژادی این صفت استفاده شود.

بررسی چندشکلی ناحیۀ اگزون سوم ژن FABP4 در دو نژاد سیستانی و دشتیاری و ارتباط آن با صفات رشد در گاو های نژاد سیستانی

غلامرضا داشاب,سمانه ابولی,محمد رکوعی,مهدی وفای واله
ايران ، تولیدات دامی ، سال : 2015 ، صفحات : 107-117، شاپا: 2009-6776 مقاله در مجله

چکیده

چند‏شکلی ناحیۀ اگزون سوم جایگاه ژن FABP4 و ارتباط الگو‏های ژنوتیپی شناسایی‌شده با صفات مرتبط با رشد با استفاده از 45 رأس گاو شامل نژاد سیستانی (30 رأس) و دشتیاری (15 رأس) بررسی شد. DNA از خون کامل استخراج و کیفیت آنها به‌کمک الکتروفورز ژل آگارز یک درصد بررسی شد. پس از تکثیر زنجیره‏ای پلی‏مرازی (PCR) و هضم آنزیمی آنها با NlaIII و الکتروفورز روی ژل آگارز 8/2 درصد، الگو‏های ژنوتیپی دام‏ها براساس اندازه و تعداد باند‏ها تعیین شد. فراوانی نسبی الگو‏های باندی شناسایی‌شده شامل ژنوتیپ‏هایAA ، AB، و BB در دو نژاد سیستانی و دشتیاری به‌ترتیب 67، 30، و 3 و نیز 73، 27، و صفر درصد بودند. فراوانی آلل‏های A و Bدر جایگاه مطالعه‌شده در جمعیت سیستانی و دشتیاری به‌ترتیب 82، 18، 5/86، و 5/13 درصد محاسبه شد. شاخص‏‌های هتروزایگوسیتی شامل شاخص شانون (I)، شاخص نئی، هتروزایگوسیتی مشاهده شد و هتروزایگوسیتی مورد انتظار در جمعیت سیستانی و دشتیاری به‌ترتیب 48، 30، 30 و30 و 39، 11، 27 و 24 درصد برآورد شد. الگو‏های ژنوتیپی در جایگاه ژن FABP4 در جمعیت گاو سیستانی همبستگی معنی‌داری با وزن‌های شش، نه‌، و دوازده ماهگی نشان داد. بنابراین جایگاه مذکور می‏تواند به‌عنوان ژن کاندیدا در توصیف تنوع صفات مرتبط با رشد بعد از سن ازشیرگیری گوساله‏ها در برنامه‏های اصلاح نژادی استفاده شود.

آنالیز دی آلل کراس برخی صفات تولیدمثلی در ماهیان )Puntius tetrazona( زینتی

غلامرضا داشاب,حسین اکبری,سیدایمان فاضل
ايران ، شیلات ، سال : 2016 ، صفحات : 505-520، شاپا: 2008-5729 مقاله در مجله

چکیده

از بهترین روش های به نژادی ماهیان جداسازی دودمان های خالص با توان تولید دورگه های پرمحصول است. در مطالعه حاضر تاثیرات هتروزیس، افت به واسطه همخونی، تاثیرات مادری، ترکیب پذیری عمومی و ترکیب پذیری خصوصی صفات مربوط به تولیدمثل شامل تعداد تخم تولیدی، تعداد تخم هچ شده و درصد هچ نتاج خالص و دورگه های حاصل از تلاقی گونه تایگر و دوسویه آن یعنی گرین و آلبینو بارب در قالب طرح دی آلل کراس کامل بررسی شد. نتایج بیانگر منفی بودن میزان هتروزیس در هر سه صفت مذکور بود و هیچ کدام از دورگه ها نسبت به نتاج والدین خالص خود در صفات مورد بررسی برتری نشان ندادند. همچنین، نتایج نشان داد که بیشترین میزان افت به واسطه همخونی در بین تلاقی ها مربوط به صفت تولید تخم و کمترین میزان آن نیز مربوط به درصد هچ بود. این بررسی نشان می دهد زمانی که از سویه آلبینو به منزله لاین مادری استفاده شود، عملکرد دورگه های حاصل نسبت به سایر تلاقی ها بالاتر است و تاثیرات مادری مثبتی دارد. بنابراین، این سویه می تواند به منزله لاین مادری در تلاقی ها استفاده شود. مقایسه میزان ترکیب پذیری عمومی نشان دهنده برتری ژنتیکی افزایشی تایگر بارب نسبت به دو سویه دیگر در صفت تعداد تخم تولیدی است و بیانگر این نکته است که این سویه می تواند ارزش های اصلاحی (GCA) خود برای قدرت تخم ریزی را به نتاج خود منتقل کند. همچنین، بالاترین میزان ترکیب پذیری خاص که به منظور استفاده از حداکثر توان ژنتیک غیرافزایشی دورگه هاست برای صفات تعداد تخم تولیدی، تعداد تخم هچ شده و درصد هچ به ترتیب مربوط به دورگه های حاصل از تلاقی های تایگر نر با گرین ماده، تایگر نر با آلبینوی ماده و آلبینوی نر با گرین ماده است.

بررسی چند شکلی ژن میواستاتین و ارتباط آن با صفات رشد در گوسفند کردی خراسان شمالی

غلامرضا داشاب,سکینه اکبری,مسعود علی پناه,محمد رکوعی,داود علی ساقی
ايران ، ژنتیک نوین ، سال : 2015 ، صفحات : 129-133، شاپا: 2008-4439 مقاله در مجله

چکیده

ژن میواستاتین یا فاکتور 8 موثر بر رشد و تمایز ( 8 اسکلتی عمل می کند. جهش در ناحیه کد کننده میواستاتین باعث تغییر نقش مهاری آن و افزایش عضله م یشود. در پژوهش اخیر خونگیری به طور تصادفی از تعداد 58 راس گوسفند کردی خراسان شمالی انجام و سپس با استفاده از روش نمکی بهینه یافته صورت گرفت. یک قطعه 337 جفت بازی از ناحیه اگزون 3 DNA استخراج تکثیر شد. به (PCR) ژن میواستاتین با استفاده از یک جفت آغاز گر اختصاصی توسط واکنش زنجیره ای پلیمراز PCR-RFLP با روش HaeΙΙΙ منظور ردیابی شکل های متفاوت آللی در جایگاه میواستاتین از آنزیم محدودالاثر با فراوانی به ترتیب mm و Mm استفاده شد. از سه الگوی ژنوتیپی ممکن در جایگاه ژن میواستاتین، تنها دو ژنوتیپ 0 برآورد شد. / 0 و 92 / به ترتیب 08 m و M 0 مشاهده شد. فراوانی آللی در جایگاه مزبور برای آللهای / 0/15 و 85 تجزیه مدلهای خطی با اثرات ثابت ژنوتیپ نشان داد که میانگین وزن برهها در 3 و 6 ماهگی ژنوتیپ هتروزیگوت بالاتر از ژنوتیپ هموزیگوت میباشد.

آنالیز دی آلل کراس برخی صفات مرتبط با رشد و امید به زندگی در ماهیان زینتی (Puntius tetrazona)

غلامرضا داشاب,حسین اکبری
ايران ، مجله علمی شیلات ایران ، سال : 2015 ، صفحات : 119-137، شاپا: 2322-5998 مقاله در مجله

چکیده

امیزش بین گونه‌ای بطور گسترده‌ای برای تولید دورگه‌های با صفات برتر در حیوانات آبزی مورد استفاده قرار می‌گیرد. در این بررسی توارث مادری، توانایی ترکیب عمومی و اختصاصی، هتروزیس و افت بواسطه همخونی (افزایش هم‌تباری) در صفات مرتبط با رشد شامل سرعت رشد بدن بر حسب گرم در روز، سرعت افزایش طول بر حسب میلیمتر در روز، وزن بدن بر حسب گرم، طول و عرض بدن بر حسب میلیمتر و همچنین درصد تلفات در قالب طرح دی آلل کراس کامل در نتاج خالص و دورگه‌های حاصل از سه ‌گونه تایگر و دو هیبرید آن شامل گرین و آلبینو بارب بررسی گردید. نتایج نشان داد بالاترین میزان توارث مادری در صفات مذکور مربوط به هیبرید آلبینو بوده و این هیبرید به عنوان لاین مادری بهترین عملکرد را نسبت به دو گونه تاریگر و هیبرید گرین بارب دارا است. میزان توانایی ترکیب عمومی گرین بارب در سه صفت (وزن، طول و عرض بدن) و در دو صفت سرعت رشد بدن و سرعت افزایش طول (تغییر طول) بدن هیبرید آلبینو عملکرد بالاتری نشان داد. مقایسه میزان توانایی ترکیبی خاص نشان دهنده برتری ژنتیکی هیبرید آلبینو هم به عنوان لاین پدری و هم به عنوان والد مادری در ترکیب با دو گونه تایگر و هیبرید گرین بارب بود. در بررسی مربوط به میزان هتروزیس، مقدار آن برای چهار صفت سرعت افزایش طول، وزن بدن، طول و عرض ماهیان منفی برآورد شد، اما میزان آن در دو صفت سرعت رشد بدن و درصد تلفات مثبت بودند که نشان دهنده فاصله ژنتیکی زیاد والدین در دو صفت مذکور می‌باشد. میزان افت بواسطه همخونی (افزایش هم‌تباری) نیز بیشترین میزان آن مربوط به صفت طول بدن و کمترین میزان آن در بین صفات رشد مربوط به سرعت رشد بدن برآورد شد.

مطالعه چندشکلی ژن میواستاتین وتأثیر آن بر صفات رشد در گوسفند لری

غلامرضا داشاب,فاطمه بهرام زاده,مسعود علی پناه,محمد رکوعی,صادق اسداللهی
ايران ، پژوهشهای علوم دامی ایران ، سال : 2015 ، صفحات : 374-380، شاپا: 2008-3106 مقاله در مجله

چکیده

ژن میواستاتین یا فاکتور 8 رشد و تمایز، روی توسعه و بلوغ ماهیچه های اسکلتی اثر مهارکنندگی دارد و اگر جهشی در آن رخ بدهد، باعث تغییر در اندازه ماهیچه ها می گردد. از طرفی گوسفند لری مهمترین نژاد گوسفند گوشتی بومی ایران است، که دارای توانایی ژنتیکی بالایی برای تولید گوشت می باشد. لذا، بررسی ژن های مؤثر بر تولید گوشت در این نژاد می تواند در انتخاب و اصلاح آن اهمیت داشته باشد. بنابراین، برای شناخت بهتر جایگاه ژن میواستاتین در گوسفند لری و ارتباط ژنوتیپ های شناسایی گردیده با صفات وزن تولد، ازشیرگیری و 6 ماهگی، تعداد 50 رأس گوسفند لری به طور تصادفی انتخاب و خونگیری از ورید گردنی انجام گرفت. استخراج DNA با استفاده از کیت دنازیست صورت گرفت و برای بررسی کمیت و کیفیت DNA استخراجی از روش اسپکتوفتومتری و الکتروفورز استفاده شد. به منظور ارزیابی وجود چندشکلی پرایمرهای اختصاصی طراحی و نواحی مورد نظر تکثیر شدند. پس از تأیید قطعه مورد نظر bp373 روی ژل آگارز به وسیله آنزیم برشی HaeIII تعیین ژنوتیپ گردید، که تنها حیوانات با ژنوتیپ Mm و mm در جایگاه ژن میوستاتین در جمعیت گوسفند لری مشاهده شدند. فراوانی آلل های M و m به ترتیب 75/8% و 25/91% محاسبه شد. همچنین، بررسی ارتباط بین ژنوتیپ های شناسایی گردیده درگوسفند لری با صفات رشد در جایگاه ژن میواستاتین به جز برای وزن تولد غیر معنی دار بود. بنابراین، آلل های جایگاه ژن میواستاتین تثبیت گردیده و نشانگر مناسبی در مطالعات ژنتیکی و پیوستگی با صفات رشدمحسوب نمی گردد.

بررسی چندشکلی ژن IGF-1 و ارتباط آن با صفات مرتبط با رشد در گاوهای سیستانی

غلامرضا داشاب,سمیه علی پور,مسعود علی پناه,محمد رکوعی
ايران ، علوم دامی ایران ، سال : 2014 ، صفحات : 0-0، شاپا: 2008-4773 مقاله در مجله

چکیده

فاکتور رشد شبه انسولین ) IGF-1 ( یک هورمون پپتیدی است که ساختار مشابهی با هورمون انسولین داشته و روی کروموزوم شمارة 5 گاو قرار دارد. IGF-1 نقش مهمی در رشد و نمو بافت های مختلف بدن ایفا می کند. هدف از پژوهش حاضر، بررسی چندشکلی های موجود در ژن IGF-1 و تأثیر آن بر صفات مرتبط با رشد در گاوهای سیستانی است. نمونه های خون از ورید گردنی 53 رأس گاو سیستانی ) یک ساله ( گرفته شد و استخراج DNA به روش نمکی بهینه یافته از خون کامل انجام گرفت. تکثیر یک قطعه 243 جفت بازی از ناحیة اگزون 1 ژن IGF-1 توسط واکنش زنجیره ای پلی مراز (PCR) با استفاده از یک جفت آغازگر اختصاصی صورت گرفت. وجود جهش نقطه ای و تعیین ژنوتیپ های موجود در این جایگاه در هریک از نمونه ها با استفاده از آنزیم برشی SnaBI انجام گرفت و روی ژل آگارز 2 درصد الکتروفورز شد. نتایج از وجود دو آلل A و B در جایگاه مورد مطالعه 0 محاسبه شد. سه الگوی ژنوتیپی جایگاه مورد / 0 و 55 / حاکی بود که فراوانی آن ها به ترتیب 25 مطالعه شامل AA ، AB و BB 0/ 0 و 545 /336 ،0/ دارای فراوانی های ژنوتیپی به ترتیب برابر با 055 بودند. آزمون مربع کای برای ناحیة اگزون 1 ژن IGF-1 در جمعیت گاو سیستانی مورد مطالعه، بیانگر برقراری تعادل هاردی واینبرگ بود. آنالیز ارتباط ژنوتیپ ها در این جایگاه با داده های مرتبط با - صفات رشد 0/ اختلاف معناداری ) 05 P< ( را بین ژنوتیپ های AA و AB نشان داد . بر اساس نتایج تحقیق حاضر می توان نتیجه گرفت که ژن IGF-1 می تواند به عنوان ژن کاندیدا برای صفات مرتبط با رشد در برنامه های به نژادی گاو سیستانی استفاده شود.

ساختار ژنتیکی سویه‌های مختلف گونه تایگر بارب (Puntius tetrazona) با استفاده از نشانگرهای ریزماهواره‌ای

غلامرضا داشاب,سیدایمان فاضل,مهدی وفای واله
ايران ، علوم و فنون شیلات ، سال : 2016 ، صفحات : 75-90، شاپا: 2322-5513 مقاله در مجله

چکیده

تنوع، ساختار ژنتیکی و میزان تفرق چهار سویه از ماهی زینتی بارب، Puntius tetrazona، شامل تایگر، رزی، آلبینو و گرین بارب با استفاده از نشانگر­های ریزماهواره­ای بررسی شد. استخراج DNA از160 قطعه ماهی (هر سویه 40 قطعه) از بافت باله پشتی با استفاده از کیت دنا-زیست آسیا و پروتکل شرکت انجام گردید. واکنش تکثیر 4 نشانگر با استفاده از آغازگرهایSm17، Sm25، Ma106 و Ma109 انجام و بر روی ژل آکریل آمید 8 درصد الکتروفورز شد. نتایج بیانگر چند­شکلی بودن تمام جایگاه‌های مورد مطالعه بود. تعداد آلل­های مشاهده شده چهار جایگاه در تمام جمعیت برابر با 21 آلل بود. میانگین تعداد آلل به‌ازای هر نشانگر در تمام جمعیت برابر با 25/5 و در دامنه 3 تا 6 آلل قرار داشت. متوسط تعداد آلل مشاهده شده هر سویه به‌ترتیب تایگر، گرین، آلبینو و رزی بارب برابر 25/3، 25/3، 4 و 25/3 آلل بودند. متوسط هتروزیگوسیتی مشاهده شده و مورد انتظار در تمام جمعیت به‌ترتیب برابر با 24/0 و 49/0 بودند. اکثر جایگاه‌ها در جمعیت­های مختلف انحراف از تعادل هاردی-واینبرگ را نشان دادند. تجزیه داده­های مولکولی نشان داد که بخش قابل توجهی از تنوع افراد (97 درصد) در درون سویه­ها است. مقدارFst در مطالعه حاضر برابر با 03/0 بود که نشان از تفرق پایین جمعیت­ها است. تجزیه کلاستری UPGMA براساس فاصله ژنتیکیNei تفرق بسیار کمی در بین سویه­های مختلف تایگر بارب نشان داد. بنابراین، هر چند نشانگرهای ریزماهواره‌ای استفاده شده در مطالعه ساختار ژنتیکی سویه­ها مناسب بودند، اما درجه تفرق سویه­ها بسیار کم و حاکی از درجه خویشاوندی بالای آنها است.

تجزیه و تحلیل چند صفتی وزن بدن در جمعیت آمیخته بلدرچین ژاپنی با استفاده از روش آماری بیزی

هادی فرجی آروق,خدیجه ابراهیمی,غلامرضا داشاب,محمد رکوعی
ايران ، نشریه علوم دامی (پژوهش و سازندگی) ، سال : 2019 ، صفحات : 0-0، شاپا: 2588-6436 مقاله در مجله

چکیده

وزن بدن یکی از صفات مهم اقتصادی در برنامه¬های اصلاح نژادی پرندگان گوشتی است. پارامترهای ژنتیکی هر جمعیت متأثر از شرایط محیطی مختلف می¬باشد. لذا لازمه هر فعالیت اصلاح نژادی در طیور برآورد این پارامترهاست. هدف این پژوهش برآورد مؤلفه¬های (کو)واریانس و فراسنجه¬های ژنتیکی صفات وزن بدن از هچ تا 45 روزگی جمعیت آمیخته بلدرچین ژاپنی با استفاده از 1794 رکورد وزن بدن حاصل از 70 پرنده نر و 72 پرنده ماده بود. برآورد فراسنجه¬های ژنتیکی و غیرژنتیکی با استفاده از مدل چندصفتی در برگیرنده اثرات ژنتیکی افزایشی، ژنتیکی غیر¬افزایشی و اثرات مادری و تکنیک نمونه¬گیری گیبس انجام شد. وراثت¬پذیری به دست آمده برای صفات وزن بدن در روز هچ، 5، 10، 15، 20، 25، 30، 35، 40 و 45 روزگی به ترتیب 16/0، 11/0، 12/0، 14/0، 15/0، 18/0، 20/0، 19/0، 17/0 و 17/0 بود. وراثت¬پذیری مادری، نسبت واریانس محیط دائمی مادری به واریانس فنوتیپی، نسبت واریانس غالبیت و اپیستازی به واریانس فنوتیپی به ترتیب در دامنه 32/0- 39/0، 23/0- 36/0، 04/0- 10/0 و 03/0 - 13/0 برآورد شدند. بیشترین مقدار همبستگی ژنتیکی بین وزن 35 و 30 روزگی (94/0) و کمترین مقدار آن بین وزن هچ و 5 روزگی (16/0) بود. نتایج نشان داد که اثرات مادری و ژنتیکی غیرافزایشی جهت برآورد دقیق¬تر پارامترهای ژنتیکی باید در مدل منظور شوند و همچنین، انتخاب بلدرچین¬ها برای وزن بدن 25 روزگی به دلیل همبستگی بالای آن با 45 روزگی و وراثت¬پذیری بالای آن می¬تواند باعث پیشرفت ژنتیکی خوب در وزن بدن 45 روزگی شود.

مكان يابي جايگاه كنترل كننده براي داده هاي شبيه سازي شده با استفاده از چهار روش

ٖGholam reza dashab,Naveen Kumar Kadri,محمد مهدي شريعتي
The 15th Quantitative Trait Locus and Marker Assisted Selection Workshop , Year : 2011 Conferance Paper

Abstract

ارزيابي چند شكلي ماركر هاي ريز ماهواره اي و ساختار زنتيكي گوسفند بلوچي

ٖGholam reza dashab,علي اصغر اسلمي نژاد,محمد رضا نصيري,علي اسماعيلي زاده,داوود علي ساقي
Ennual Meeting of the European Federation of Animal Science (EAAP) , Year : 2011 Conferance Paper

Abstract

مطالعه مكان يابي كيو تي ال در گوسفند بلوچي

ٖGholam reza dashab,علي اصغر اسلمي نژاد,محمد رضا نصيري,علي اسماعيلي زاده,داوود علي ساقي
Ennual Meeting of the European Federation of Animal Science (EAAP) , Year : 2011 Conferance Paper

Abstract

تجزيه جايگاه هاي ژني (QTL) با مدل هاپلوتيپ تصادفي و تاثير طول هاپلوتيپ در تشخيص مكانهاي ژني صحيح

غلامرضا داشاب,محمد رکوعی
the Fifth Congress on Animal Science ، سال : 2012 مقاله کنفرانسی

چکیده

مقايسه روش¬هاي مختلف مكان¬يابي ژن¬ها (QTL) با استفاده از داده هاي شبيه سازي شده

غلامرضا داشاب
the Fifth Congress on Animal Science ، سال : 2012 مقاله کنفرانسی

چکیده

آناليز مدلهاي مختلف بيز (BAYZ) در مطالعات ژنوميكس

غلامرضا داشاب,
3rd Iranian Agricultural Biotechnology Congress ، سال : 2012 مقاله کنفرانسی

چکیده

مقايسه مدلهاي مختلط خطي تك نشانگري (MMA) و هاپلوتيپ تصادفي (RHM) در مكان يابي QTL

غلامرضا داشاب,محمد رکوعی,
3rd Iranian Agricultural Biotechnology Congress ، سال : 2012 مقاله کنفرانسی

چکیده

مطالعه برخي عوامل موثر بر كيفيت پشم گوسفند نائيني

غلامرضا داشاب
اولين سمينار پژوهشي پوست ، چرم و الياف دامي كشور ، سال : 2001 مقاله کنفرانسی

چکیده

ارزيابي پشم گوسفند نائيني جهت صنايع نساجي

غلامرضا داشاب
اولين سمينار پژوهشي پوست ، چرم و الياف دامي كشور ، سال : 2001 مقاله کنفرانسی

چکیده

بررسي آسيب ديدگي و ميزان خسارات وارده بر پوست دامهاي استان سيستان و بلوچستان

غلامرضا داشاب,منصور باراني
دومين سمينار پژوهشي گوسفند و بز كشور ، سال : 2005 مقاله کنفرانسی

چکیده

مقايسه خصوصيات الياف و پوست در دو روش پوست پشم چيني شده و نشده در عمليات دباغي

غلامرضا داشاب,منصور باراني
دومين سمينار پژوهشي گوسفند و بز كشور ، سال : 2005 مقاله کنفرانسی

چکیده

نشانگر هاي مولكولي مورد استفاده در مطالعات تنوع ژنتيكي حيوانات

غلامرضا داشاب,راحله خانه گیر
The 1st National Conference on Stable Agriculture and Natural Resources ، سال : 2014 مقاله کنفرانسی

چکیده

معيارهاي سنجش تنوع ژنتيكي در جمعيت هاي حيواني

غلامرضا داشاب,راحله خانه گیر
The 1st National Conference on Stable Agriculture and Natural Resources ، سال : 2014 مقاله کنفرانسی

چکیده

بررسي تنوع ژنتيكي جايگاه TFAM در گاوهاي سيستاني

غلامرضا داشاب,حسین مراد قلی
The 1st National Conference on Stable Agriculture and Natural Resources ، سال : 2014 مقاله کنفرانسی

چکیده

بررسي چند شكلي تك نوكلئوتيدي در ناحيه پروموتور ژن گيرنده استروژن آلفا ER? گاو سيستاني با استفاده ازروش PCR-RFLP

غلامرضا داشاب,سمیه براهویی علی پور,محمد ايزدي زاده بيداني
The 1st National Conference on Stable Agriculture and Natural Resources ، سال : 2014 مقاله کنفرانسی

چکیده

بررسي چىدشكلي ژن IGF-1 در گاوهاي سيستاني با استفاده از روش PCR-RFLP

غلامرضا داشاب,سمیه براهویی علی پور,,محمد رکوعی
The 1st National Conference on Stable Agriculture and Natural Resources ، سال : 2014 مقاله کنفرانسی

چکیده

تاثير ژن ميوستاتين بر صفات وزن در گوسفند لري

غلامرضا داشاب,فاطمه بهرام زاده,,محمد رکوعی
The 1st National Conference on Stable Agriculture and Natural Resources ، سال : 2014 مقاله کنفرانسی

چکیده

ارزيابي ناحيه پروموتور ژن فاكتور رونويسي ميتوكندري و ارتباط آن با ماربلينگ گوشت گوساله هاي سيستاني

غلامرضا داشاب,حسین مراد قلی,
The 1st National Conference on Stable Agriculture and Natural Resources ، سال : 2014 مقاله کنفرانسی

چکیده

?چند شكلي ژن هاي باروري GDF9 و BMP15 در بزهاي مرخز

غلامرضا داشاب,اعظم خسروی زرندی,محمد رکوعی,
The 1st National Conference on Stable Agriculture and Natural Resources ، سال : 2014 مقاله کنفرانسی

چکیده

ارتباط چند شكلي ژن هاي باروري GDF9 و BMP15 بر صفات وزن در بز مرخز

غلامرضا داشاب,اعظم خسروی زرندی,محمد رکوعی,
The 1st National Conference on Stable Agriculture and Natural Resources ، سال : 2014 مقاله کنفرانسی

چکیده

مطالعه ارتباط چند شكلي ژن IGF-1 با صفات رشدي در گاو سيستاني

غلامرضا داشاب,سمیه براهویی علی پور,,محمد رکوعی
The 1st National Conference on Stable Agriculture and Natural Resources ، سال : 2014 مقاله کنفرانسی

چکیده

بررسي چندشكلي ژن ‏FABP4‎‏ و ارتباط آن با صفات رشد در گاوهاي سيستاني و دشتياري

غلامرضا داشاب,سمانه ابولی,محمد رکوعی,
دومين همايش كشاورزي و منابع طبيعي پايدار ، سال : 2014 مقاله کنفرانسی

چکیده

شنبه

یکشنبه

دوشنبه

سه شنبه

چهارشنبه

پنجشنبه

  •    شماره تماس:_
  •    شماره داخلی:_
  •    نمابر:_
  •   پست الکترونیک:dashab@uoz.ac.ir